More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3446 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3446  glycosyl transferase, group 1 family protein  100 
 
 		 412 aa  858    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3228  glycosyl transferase, group 1  85.79 
 
 		 401 aa  720    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.948731  normal  0.566821 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0772  glycosyl transferase, group 1 family protein  44.2 
 
 		 397 aa  307  3e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  41.71 
 
 		 403 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  41.71 
 
 		 403 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3571  glycosyl transferase group 1  33.5 
 
 		 397 aa  179  8e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.414166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2864  glycosyl transferase group 1  30.75 
 
 		 382 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2863  glycosyl transferase group 1  29.76 
 
 		 400 aa  155  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.401777  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0177  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 		 445 aa  150  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0643614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0178  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 		 414 aa  150  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0742938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3557  glycosyl transferase group 1  29.13 
 
 		 417 aa  135  9e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0744165  normal  0.646322 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3107  glycosyl transferase, group 1  24.84 
 
 		 452 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0797  glycosyl transferase group 1  24.5 
 
 		 441 aa  100  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.926616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1784  glycosyltransferase  25.35 
 
 		 401 aa  100  7e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4356  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 		 409 aa  97.4  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.784045 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2189  glycosyl transferase group 1  24.76 
 
 		 394 aa  97.1  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1534  glycosyl transferase, group 1  24.42 
 
 		 411 aa  96.3  9e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00818879  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 		 403 aa  96.3  9e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1804  glycosyl transferase group 1  25.62 
 
 		 415 aa  94.7  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4972  glycosyl transferase group 1  27.21 
 
 		 445 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0451  putative glycosyl transferase  24.56 
 
 		 401 aa  92  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  29.1 
 
 		 408 aa  91.7  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1118  group 1 glycosyltransferase  27.48 
 
 		 425 aa  91.3  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48856  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0458  glycosyl transferase group 1  24.3 
 
 		 447 aa  90.9  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3432  glycosyl transferase group 1  25.95 
 
 		 419 aa  90.5  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  23.98 
 
 		 391 aa  90.5  5e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1051  putative transferase  25.45 
 
 		 384 aa  90.1  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2780  glycosyl transferase, group 1  27.48 
 
 		 425 aa  90.1  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.301884  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4622  glycosyl transferase group 1  28.05 
 
 		 391 aa  90.1  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0028112 
 
 
-
 
NC_002978  WD0613  glycosyl transferase, group 1 family protein / moaA/nifB/pqqE family protein  23.65 
 
 		 778 aa  89.4  1e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12808  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3384  glycosyl transferase group 1  29.18 
 
 		 410 aa  89.4  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.320283  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1093  glycosyl transferase group 1  27.9 
 
 		 384 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  23.53 
 
 		 392 aa  88.2  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5087  glycosyl transferase group 1  28.05 
 
 		 390 aa  87.8  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0591  glycosyl transferase group 1  23.5 
 
 		 404 aa  87.4  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2208  glycosyl transferase group 1  24.56 
 
 		 403 aa  87.8  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120517  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1704  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 410 aa  87.4  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4708  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 		 418 aa  87  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.514087 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6868  glycosyl transferase group 1  24.42 
 
 		 424 aa  87.4  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0256  glycosyl transferase group 1  26.93 
 
 		 415 aa  86.7  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  26.19 
 
 		 415 aa  85.9  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5022  glycosyl transferase group 1  30.89 
 
 		 395 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0391  glycosyl transferase group 1  25.98 
 
 		 414 aa  85.5  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1032  glycosyl transferase group 1  25.78 
 
 		 413 aa  85.1  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4083  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 		 399 aa  84.3  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3553  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 		 403 aa  84.7  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0516541  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1390  glycosyl transferase group 1  23.96 
 
 		 539 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2877  glycosyl transferase, group 1  26.39 
 
 		 426 aa  84  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1173  glycosyl transferase group 1  24.71 
 
 		 391 aa  82.8  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1349  glycosyl transferase, group 1 family protein  43.64 
 
 		 387 aa  81.6  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1116  glycosyltransferase  27.06 
 
 		 413 aa  82  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2778  glycosyl transferase, group 1  26.89 
 
 		 413 aa  82  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3800  glycosyl transferase group 1  39.33 
 
 		 402 aa  82  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17673  normal  0.211423 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5195  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 		 396 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3048e-16 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2598  glycosyl transferase group 1  24.88 
 
 		 418 aa  80.9  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  30.81 
 
 		 446 aa  80.5  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  28.41 
 
 		 398 aa  80.1  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  28.41 
 
 		 391 aa  80.1  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  23.15 
 
 		 390 aa  79.7  0.00000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 		 400 aa  79.7  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4198  glycosyl transferase group 1  25.75 
 
 		 405 aa  79.7  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1194  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 355 aa  79.7  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2441  glycosyl transferase group 1  29.76 
 
 		 351 aa  79  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.719271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0775  glycosyltransferase-like protein  30.29 
 
 		 371 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1365  glycosyl transferase, group 1  24.82 
 
 		 396 aa  78.2  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0275215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  28.41 
 
 		 391 aa  79  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5356  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 		 418 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.119029 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3447  group 1 glycosyl transferase  29.12 
 
 		 395 aa  78.6  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  27.96 
 
 		 383 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 373 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  35.06 
 
 		 413 aa  77.8  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  30.92 
 
 		 376 aa  77.4  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  31.71 
 
 		 434 aa  77  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 		 426 aa  77  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4891  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  24.74 
 
 		 1867 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  21.03 
 
 		 364 aa  76.6  0.0000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4590  glycosyl transferase group 1  28.29 
 
 		 462 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3293  glycosyl transferase group 1  25.16 
 
 		 392 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2288  glycosyl transferase group 1 family protein  33.61 
 
 		 820 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.683447  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  33.52 
 
 		 419 aa  76.3  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  30.16 
 
 		 406 aa  76.3  0.0000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1001  glycosyl transferase group 1  35.8 
 
 		 392 aa  76.3  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00745042 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4999  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.02 
 
 		 367 aa  76.3  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1107  glycosyl transferase group 1  37.6 
 
 		 399 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1456  glycosyl transferase group 1  28.91 
 
 		 371 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3364  glycosyl transferase, group 1  35.59 
 
 		 822 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  32.54 
 
 		 346 aa  75.9  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  29.86 
 
 		 410 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  28.72 
 
 		 410 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  29.08 
 
 		 370 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1514  glycosyl transferase group 1  22.46 
 
 		 396 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  31.28 
 
 		 353 aa  75.1  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3851  glycosyl transferase, group 1  22.94 
 
 		 353 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.243477 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2669  glycosyl transferase, group 1  23.56 
 
 		 404 aa  75.1  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 378 aa  75.1  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  36.07 
 
 		 398 aa  75.5  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 		 396 aa  75.5  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4248  glycosyl transferase group 1  25.44 
 
 		 405 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461257  normal  0.0976118 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0783  glycosyl transferase group 1  23.34 
 
 		 782 aa  75.1  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  31.18 
 
 		 417 aa  75.5  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>