More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3376 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02202  NADH dehydrogenase subunit M  72.78 
 
 		 509 aa  720    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.786903  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1380  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  72.78 
 
 		 509 aa  720    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2423  NADH dehydrogenase subunit M  79.61 
 
 		 509 aa  772    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.200315 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4130  NADH dehydrogenase subunit M  88.04 
 
 		 510 aa  813    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1010  NADH dehydrogenase subunit M  68.32 
 
 		 514 aa  678    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3376  NADH dehydrogenase I, M subunit  100 
 
 		 510 aa  1003    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1862  NADH dehydrogenase subunit M  88.82 
 
 		 510 aa  844    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.485949  normal  0.0328463 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3208  NADH dehydrogenase subunit M  99.02 
 
 		 510 aa  996    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.281414  normal  0.361431 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1571  NADH dehydrogenase subunit M  74.1 
 
 		 510 aa  730    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1503  NADH dehydrogenase subunit M  75.35 
 
 		 511 aa  726    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2761  NADH dehydrogenase subunit M  74.5 
 
 		 511 aa  721    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1805  NADH dehydrogenase subunit M  74.1 
 
 		 510 aa  730    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.168858 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2663  NADH dehydrogenase subunit M  72.19 
 
 		 509 aa  713    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28550  NADH dehydrogenase subunit M  80.39 
 
 		 509 aa  787    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.101547  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3614  NADH dehydrogenase subunit M  92.16 
 
 		 510 aa  886    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.166771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1375  NADH dehydrogenase subunit M  72.78 
 
 		 509 aa  720    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.905412 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1735  NADH dehydrogenase subunit M  88.04 
 
 		 510 aa  813    Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00591275  normal  0.538145 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2539  NADH dehydrogenase subunit M  70.72 
 
 		 511 aa  701    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2821  NADH dehydrogenase subunit M  73.45 
 
 		 509 aa  696    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.43  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2653  NADH dehydrogenase subunit M  72.58 
 
 		 509 aa  717    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3702  NADH dehydrogenase subunit M  88.24 
 
 		 510 aa  815    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.65414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1465  NADH dehydrogenase subunit M  74.1 
 
 		 510 aa  731    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1405  NADH dehydrogenase subunit M  72.31 
 
 		 532 aa  707    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0707014  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2426  NADH dehydrogenase subunit M  72.78 
 
 		 509 aa  720    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02162  hypothetical protein  72.78 
 
 		 509 aa  720    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.58394  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3121  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  68.2 
 
 		 513 aa  662    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0441802  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3416  NADH dehydrogenase subunit M  72.78 
 
 		 509 aa  720    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2570  NADH dehydrogenase subunit M  72.78 
 
 		 509 aa  720    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2456  NADH dehydrogenase subunit M  71.99 
 
 		 509 aa  710    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2501  NADH dehydrogenase subunit M  72.19 
 
 		 509 aa  713    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2431  NADH dehydrogenase subunit M  72.78 
 
 		 509 aa  720    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2545  NADH dehydrogenase subunit M  72.19 
 
 		 509 aa  713    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3297  NADH dehydrogenase subunit M  72.55 
 
 		 509 aa  735    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.416453 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2556  NADH dehydrogenase subunit M  72.19 
 
 		 509 aa  712    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29860  NADH dehydrogenase subunit M  80.67 
 
 		 509 aa  803    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000573313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2558  NADH dehydrogenase subunit M  80.47 
 
 		 509 aa  801    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0595  NADH dehydrogenase subunit M  61.73 
 
 		 541 aa  617  1e-175  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000354161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0584  NADH dehydrogenase subunit M  61.73 
 
 		 541 aa  615  1e-175  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0370  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  60.8 
 
 		 507 aa  600  1e-170  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1688  NADH dehydrogenase subunit M  56.34 
 
 		 577 aa  567  1e-160  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.694136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1024  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  53.88 
 
 		 500 aa  475  1e-133  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.272198  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1116  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  53.07 
 
 		 493 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1348  NADH dehydrogenase I, M subunit  56.31 
 
 		 489 aa  464  1e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.467461  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3814  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  50.72 
 
 		 490 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1109  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  54.2 
 
 		 505 aa  448  1e-125  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2871  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  48.09 
 
 		 537 aa  419  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0408599 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0707  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  54.04 
 
 		 493 aa  404  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.296941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0314  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  45.15 
 
 		 493 aa  373  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4232  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.02 
 
 		 525 aa  368  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177133  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3343  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.52 
 
 		 519 aa  361  2e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.816819 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3914  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.96 
 
 		 535 aa  359  5e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0719914  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3430  NADH dehydrogenase I, M subunit  44.81 
 
 		 496 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3623  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.15 
 
 		 497 aa  355  7.999999999999999e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0933316 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0350  NADH dehydrogenase I, M subunit  41.82 
 
 		 522 aa  355  1e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3998  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.76 
 
 		 535 aa  355  1e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000144113 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1656  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.14 
 
 		 495 aa  350  5e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.750988  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0414  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.67 
 
 		 542 aa  345  8.999999999999999e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2820  NADH dehydrogenase subunit M  40.67 
 
 		 494 aa  345  1e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0443  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.47 
 
 		 542 aa  345  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0442  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.47 
 
 		 542 aa  344  2e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.990094  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0171  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  44.47 
 
 		 496 aa  344  2.9999999999999997e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3126  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.93 
 
 		 535 aa  340  4e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1337  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.97 
 
 		 481 aa  340  5e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.210293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0829  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.32 
 
 		 504 aa  339  8e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1034  NADH dehydrogenase subunit M  39.4 
 
 		 501 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2411  NADH dehydrogenase subunit M  37.94 
 
 		 502 aa  335  1e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0139684  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4060  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.98 
 
 		 480 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.40537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1248  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  43.85 
 
 		 534 aa  333  5e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.130648  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4732  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.68 
 
 		 480 aa  332  8e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.708423  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2154  NADH dehydrogenase subunit M  38.09 
 
 		 496 aa  332  1e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.575239  normal  0.457666 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0809  NADH dehydrogenase subunit M  37.13 
 
 		 502 aa  331  2e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2245  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.96 
 
 		 494 aa  331  2e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000177754 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2618  NADH-quinone oxidoreductase, M subunit  39.96 
 
 		 494 aa  331  2e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2275  NADH dehydrogenase subunit M  38.4 
 
 		 496 aa  331  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.229712  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1073  NADH dehydrogenase subunit M  39.71 
 
 		 496 aa  330  3e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2386  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.88 
 
 		 507 aa  330  4e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0446554  normal  0.771852 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6082  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.59 
 
 		 519 aa  330  4e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.596347  normal  0.0617522 
 
 
-
 
NC_004310  BR0814  NADH dehydrogenase subunit M  37.13 
 
 		 502 aa  329  7e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.669912  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2930  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.13 
 
 		 503 aa  329  7e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1358  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.34 
 
 		 481 aa  329  7e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.199626  normal  0.187922 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3212  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.51 
 
 		 517 aa  329  7e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5565  NADH dehydrogenase subunit M  39.23 
 
 		 496 aa  329  9e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0400022  normal  0.331028 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1952  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  38.15 
 
 		 507 aa  328  1.0000000000000001e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0417902  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1817  NADH dehydrogenase subunit M  39.31 
 
 		 496 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1448  NADH dehydrogenase subunit M  39.31 
 
 		 496 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1142  NADH dehydrogenase subunit M  39.31 
 
 		 496 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.400671  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1311  NADH dehydrogenase subunit M  39.31 
 
 		 496 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1040  NADH dehydrogenase subunit M  39.02 
 
 		 496 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.926201  normal  0.336803 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2261  NADH dehydrogenase subunit M  39.02 
 
 		 496 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.796685  normal  0.444802 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1273  NADH dehydrogenase subunit M  38.41 
 
 		 503 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1302  NADH dehydrogenase subunit M  39.31 
 
 		 496 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.982872  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0425  NADH dehydrogenase subunit M  39.31 
 
 		 496 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.271774  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1625  NADH dehydrogenase subunit M  39.02 
 
 		 496 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209377  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0725  NADH dehydrogenase subunit M  39.31 
 
 		 496 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.10971  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2237  NADH dehydrogenase subunit M  39.02 
 
 		 496 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.759454  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1728  NADH dehydrogenase subunit M  37.9 
 
 		 512 aa  327  3e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.694351  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4155  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.07 
 
 		 534 aa  326  5e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0166298 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1365  NADH dehydrogenase subunit M  38.2 
 
 		 503 aa  326  5e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1929  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.5 
 
 		 585 aa  326  6e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341288  normal  0.991992 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.3 
 
 		 508 aa  325  1e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>