205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3285 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02632  (D)-glucarate dehydratase 1  74.03 
 
 		 446 aa  699    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0901  glucarate dehydratase  74.26 
 
 		 446 aa  701    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0843  glucarate dehydratase  78.13 
 
 		 446 aa  730    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4757  glucarate dehydratase  80.89 
 
 		 448 aa  778    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00282791  hitchhiker  0.00286979 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1079  glucarate dehydratase protein  74.67 
 
 		 453 aa  706    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.786774  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3285  glucarate dehydratase  100 
 
 		 450 aa  929    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3120  glucarate dehydratase  95.78 
 
 		 450 aa  878    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3715  D-glucarate dehydratase  78.73 
 
 		 456 aa  708    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.352997  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3182  glucarate dehydratase  74.26 
 
 		 446 aa  701    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.475312  normal  0.651115 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3086  glucarate dehydratase  74.03 
 
 		 446 aa  697    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0151  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3721  D-glucarate dehydratase  89.09 
 
 		 447 aa  827    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.682097 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4275  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  77.11 
 
 		 450 aa  717    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0189  glucarate dehydratase  78.77 
 
 		 457 aa  689    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1139  glucarate dehydratase  76.89 
 
 		 450 aa  713    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3421  D-glucarate dehydratase  77.5 
 
 		 444 aa  718    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.36134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3166  glucarate dehydratase  74.26 
 
 		 446 aa  701    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.193762  normal  0.0642923 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0663  glucarate dehydratase  80.93 
 
 		 451 aa  781    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.139311 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4766  glucarate dehydratase  79.82 
 
 		 451 aa  768    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0539  glucarate dehydratase  79.64 
 
 		 449 aa  726    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.492128  normal  0.504058 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3119  glucarate dehydratase  74.26 
 
 		 446 aa  700    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.593552 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0834  D-glucarate dehydratase  78.46 
 
 		 451 aa  691    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.608839  normal  0.0271686 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2925  glucarate dehydratase  73.92 
 
 		 446 aa  699    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0946  glucarate dehydratase  76.82 
 
 		 456 aa  722    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.189357  normal  0.0818467 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0684  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  76.89 
 
 		 450 aa  713    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4047  glucarate dehydratase  74.26 
 
 		 446 aa  701    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4102  glucarate dehydratase  79.56 
 
 		 449 aa  734    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1011  glucarate dehydratase  75.88 
 
 		 456 aa  725    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2142  glucarate dehydratase  77.11 
 
 		 450 aa  715    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5152  glucarate dehydratase  74.44 
 
 		 461 aa  700    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6530  glucarate dehydratase  81.55 
 
 		 449 aa  739    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124321  normal  0.118965 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1731  glucarate dehydratase  76.85 
 
 		 451 aa  725    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00228751  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1041  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  76.67 
 
 		 450 aa  708    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1045  glucarate dehydratase  76.67 
 
 		 450 aa  709    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.567238 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3101  glucarate dehydratase  74.26 
 
 		 446 aa  701    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1163  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  76.89 
 
 		 450 aa  713    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3280  glucarate dehydratase  74.26 
 
 		 446 aa  701    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.455755 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1017  glucarate dehydratase  71.17 
 
 		 445 aa  665    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0552689  normal  0.150619 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2393  glucarate dehydratase  72.17 
 
 		 444 aa  654    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.617772  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3623  glucarate dehydratase  72.71 
 
 		 451 aa  701    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1130  glucarate dehydratase  77.15 
 
 		 444 aa  712    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3555  glucarate dehydratase  77.38 
 
 		 446 aa  731    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0970  D-glucarate dehydratase  72.46 
 
 		 450 aa  677    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.886707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6204  glucarate dehydratase  75.23 
 
 		 451 aa  682    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.254671 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3240  D-glucarate dehydratase  75.17 
 
 		 446 aa  711    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0783146 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1216  D-glucarate dehydratase  79.22 
 
 		 449 aa  702    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529304  normal  0.0486159 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6488  (D)-glucarate dehydratase 1  74.38 
 
 		 451 aa  700    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4631  glucarate dehydratase  80.93 
 
 		 451 aa  777    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139469  hitchhiker  0.000950159 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7096  glucarate dehydratase  73.97 
 
 		 450 aa  674    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.486467  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0925  glucarate dehydratase  74.26 
 
 		 446 aa  701    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3395  glucarate dehydratase  77.75 
 
 		 446 aa  733    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1118  glucarate dehydratase  75.12 
 
 		 444 aa  672    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.958385 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0809  glucarate dehydratase  79.5 
 
 		 446 aa  741    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2931  glucarate dehydratase  74.03 
 
 		 446 aa  699    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.923462  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3091  glucarate dehydratase  74.49 
 
 		 446 aa  702    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00700735  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02594  hypothetical protein  74.03 
 
 		 446 aa  699    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0248  glucarate dehydratase  72.01 
 
 		 445 aa  648    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0349  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  68.26 
 
 		 442 aa  630  1e-179  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1790  Glucarate dehydratase  69.07 
 
 		 445 aa  620  1e-176  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1990  glucarate dehydratase  68.85 
 
 		 445 aa  620  1e-176  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.202051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0842  Glucarate dehydratase  65.99 
 
 		 453 aa  615  1e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.545959  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0446  Glucarate dehydratase  73.65 
 
 		 432 aa  610  1e-173  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0808  Glucarate dehydratase  67.57 
 
 		 461 aa  601  1e-170  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2497  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  69.55 
 
 		 441 aa  597  1e-169  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.693468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3241  D-glucarate dehydratase  67.42 
 
 		 447 aa  588  1e-167  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0695422 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1214  D-glucarate dehydratase  62.42 
 
 		 464 aa  590  1e-167  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0710823 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3556  Glucarate dehydratase  66.07 
 
 		 450 aa  588  1e-167  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3183  glucarate dehydratase  66.52 
 
 		 446 aa  586  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.558486 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3120  glucarate dehydratase  66.52 
 
 		 446 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.796929 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3167  glucarate dehydratase  66.52 
 
 		 446 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.153553 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3092  glucarate dehydratase  65.62 
 
 		 446 aa  587  1e-166  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.026036  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3396  Glucarate dehydratase  66.07 
 
 		 450 aa  587  1e-166  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02633  predicted glucarate dehydratase  65.39 
 
 		 446 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0900  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  65.17 
 
 		 446 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0924  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  65.17 
 
 		 446 aa  581  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3102  glucarate dehydratase  66.29 
 
 		 446 aa  584  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4583  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  65.57 
 
 		 469 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.674394  normal  0.416536 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02595  hypothetical protein  65.39 
 
 		 446 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4449  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  65.57 
 
 		 469 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.644266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2932  glucarate dehydratase  65.39 
 
 		 446 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2926  glucarate dehydratase  65.17 
 
 		 446 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0276  glucarate dehydratase  64.91 
 
 		 465 aa  578  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815006 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0201  glucarate dehydratase  65.13 
 
 		 465 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203534  unclonable  0.0000000000115228 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3396  glucarate dehydratase  65.57 
 
 		 465 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2811  glucarate dehydratase  66.01 
 
 		 465 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0295  glucarate dehydratase  66.01 
 
 		 465 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0224  glucarate dehydratase  65.35 
 
 		 465 aa  569  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115995 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0216  glucarate dehydratase  64.91 
 
 		 465 aa  569  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2481  glucarate dehydratase  61.28 
 
 		 441 aa  561  1.0000000000000001e-159  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.762164  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0829  glucarate dehydratase protein  63.58 
 
 		 445 aa  547  1e-154  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.267714 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1068  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.73 
 
 		 434 aa  270  2.9999999999999997e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.391722 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1407  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  36.34 
 
 		 429 aa  263  4e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0463415  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0035  glucarate dehydratase  68.52 
 
 		 186 aa  239  8e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2486  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  36.64 
 
 		 422 aa  239  9e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6284  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.92 
 
 		 424 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5156  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.2 
 
 		 435 aa  235  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18905  decreased coverage  0.00252858 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2716  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.1 
 
 		 424 aa  234  3e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734376  normal  0.775663 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3283  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.48 
 
 		 424 aa  233  5e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.686911  normal  0.91746 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2911  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  33.87 
 
 		 424 aa  232  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.609631  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0035  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.76 
 
 		 433 aa  227  3e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.45154 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4200  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  35.83 
 
 		 421 aa  227  4e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.370116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>