158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3229 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3210  filamentous hemagglutinin family protein  68.75 
 
 
991 aa  1219    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3229  filamentous hemagglutinin, intein-containing, putative  100 
 
 
6274 aa  12110    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00510  putative hemagglutinin  39.12 
 
 
3443 aa  1069    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.443452 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32790  hypothetical protein  39.45 
 
 
5212 aa  2440    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000189329 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0044  filamentous hemagglutinin  42.38 
 
 
2904 aa  1050    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2777  filamentous hemagglutinin  40.85 
 
 
3563 aa  1096    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3151  adhesin  33.4 
 
 
2758 aa  506  1e-141  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3218  hypothetical protein  97.19 
 
 
398 aa  504  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123977  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2787  filamentous haemagglutinin  45.79 
 
 
980 aa  494  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0043  adhesin/hemagglutinin  53.22 
 
 
594 aa  467  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0053  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.42 
 
 
3967 aa  438  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.927925 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2522  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  28.43 
 
 
5981 aa  426  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4077  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.39 
 
 
3602 aa  420  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2008  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  32.04 
 
 
3796 aa  394  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2001  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  31.53 
 
 
3862 aa  383  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02477  hemagglutinin-related protein  33.29 
 
 
3322 aa  374  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0926813  normal  0.901067 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1913  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  31.6 
 
 
3790 aa  374  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2177  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  31.67 
 
 
1730 aa  370  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2221  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.89 
 
 
3475 aa  358  1e-96  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0093  filamentous haemagglutinin adhesin HecA 20-repeat-containing protein  32.02 
 
 
3081 aa  352  1e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4402  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.29 
 
 
3040 aa  352  1e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.887533  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1044  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.63 
 
 
3480 aa  352  2e-94  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0887  hemagglutinin-related protein  33.18 
 
 
3501 aa  349  1e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.386493 
 
 
-
 
NC_003296  RS05701  hemagglutinin-related protein  33.1 
 
 
3552 aa  347  5.999999999999999e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02976  filamentous haemagglutinin; haemagglutination activity domain protein  30.7 
 
 
3526 aa  346  7e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.224102  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2858  filamentous haemagglutinin/adhesin  32.65 
 
 
3301 aa  342  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.892494 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3779  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.29 
 
 
3028 aa  338  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.321451 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2723  filamentous haemagglutinin  32.87 
 
 
3147 aa  337  3e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0377  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.52 
 
 
3128 aa  332  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1129  cell surface protein  32.62 
 
 
3141 aa  329  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1122  cell surface protein  31.97 
 
 
3144 aa  326  9.000000000000001e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.691127  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1277  adhesin/hemolysin  32.56 
 
 
3131 aa  326  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1170  adhesin/hemolysin  32.91 
 
 
3141 aa  318  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2802  haemagglutinin  32.83 
 
 
3141 aa  318  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4291  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.01 
 
 
3079 aa  317  4.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6351  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  29.29 
 
 
3785 aa  315  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3880  filamentous haemagglutinin/adhesin  32.58 
 
 
3159 aa  310  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1895  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.77 
 
 
3378 aa  306  7.000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3647  filamentous haemagglutinin  33.42 
 
 
2984 aa  305  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0113  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  28.31 
 
 
4966 aa  304  3e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.352935 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5341  putative adhesin/hemolysin  32.65 
 
 
3004 aa  301  3e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1775  hemagglutinin-related protein  30.9 
 
 
3165 aa  296  8e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7307  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.66 
 
 
3020 aa  295  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0209346 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0510  adhesin/hemagglutinin  31.69 
 
 
3350 aa  293  6e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1528  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  32.43 
 
 
2670 aa  290  5e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0370  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  33.29 
 
 
2421 aa  283  1e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0433  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  35.29 
 
 
2345 aa  267  4e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365206  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2330  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  32.27 
 
 
2600 aa  265  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1519  hemagglutinin/adhesin repeat-containing protein  35 
 
 
2588 aa  263  9e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1750  hemagglutination activity domain-containing protein  35 
 
 
2530 aa  262  2e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000776384 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1622  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  35 
 
 
2545 aa  261  4e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0065  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  35.67 
 
 
1723 aa  251  3e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.290227  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5732  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.81 
 
 
2782 aa  249  9e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0572  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  46.39 
 
 
658 aa  247  5e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5769  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  40.61 
 
 
2827 aa  228  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.531028 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4525  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  45.83 
 
 
3884 aa  227  4.9999999999999996e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0418  filamentous haemagglutinin family outer membrane protein  31.63 
 
 
812 aa  224  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.740243  normal  0.11734 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0483  adhesin  33.22 
 
 
1998 aa  223  1e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5133  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  47.43 
 
 
721 aa  213  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.532528 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2176  adhesin HecA family  32.69 
 
 
3300 aa  207  4e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3717  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  42.11 
 
 
923 aa  201  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.123962  normal  0.562424 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1281  haemagglutination activity domain protein  29.05 
 
 
1270 aa  199  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.326078 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4729  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.44 
 
 
428 aa  189  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.257698  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2930  filamentous haemagglutinin adhesin HecA 20-repeat-containing protein  29.5 
 
 
2536 aa  177  7.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05770  hemagglutinin-related protein  28.22 
 
 
2737 aa  176  9e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.245553  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  51.2 
 
 
3689 aa  173  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5446  adhesin  34.04 
 
 
3929 aa  171  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5361  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.73 
 
 
2847 aa  171  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1536  hemagglutination activity domain-containing protein  36.62 
 
 
2449 aa  164  5e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.043951  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7346  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.04 
 
 
2666 aa  164  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.550949 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4642  hemolysin  39.36 
 
 
1651 aa  163  9e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.154721  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3791  filamentous haemagglutinin-like protein  39.12 
 
 
1489 aa  162  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.615569 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4482  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  41.84 
 
 
1615 aa  163  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.751989  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6766  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.18 
 
 
2818 aa  160  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0155  filamentous haemagglutinin / adhesin  30.67 
 
 
1841 aa  159  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4028  adhesin HecA family  27.08 
 
 
2964 aa  156  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4181  adhesin HecA family  27.24 
 
 
2547 aa  152  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_1682  filamentous haemagglutinin family protein  34.24 
 
 
1719 aa  148  4e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1053  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.31 
 
 
1508 aa  147  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.21388  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0299  hemolysin  40.59 
 
 
1618 aa  147  9e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.420803  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3291  adhesin HecA family  27.12 
 
 
2732 aa  145  3e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4272  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.55 
 
 
1508 aa  144  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3188  putative hemagglutinin-related protein  34.55 
 
 
2751 aa  144  6e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.513834 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0071  hemagglutinin-related protein  33.09 
 
 
541 aa  144  7e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5058  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  31.22 
 
 
2786 aa  143  8.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1449  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  37.12 
 
 
1508 aa  142  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.597308 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2335  putative transcriptional activator  37.68 
 
 
2350 aa  142  1e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0284  adhesin HecA family  27.08 
 
 
2651 aa  143  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3922  hemagglutination activity domain-containing protein  37.85 
 
 
1635 aa  140  8e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02101  putative hemagglutinin-related protein  30.8 
 
 
2691 aa  139  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.386866 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2480  hemagglutinin-like protein  35.56 
 
 
914 aa  135  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.168613  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2341  hemagglutinin-like protein  34.07 
 
 
901 aa  135  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0801  hemagglutinin, homlog  35.56 
 
 
893 aa  135  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4077  putative hemagglutinin/hemolysin  30.17 
 
 
463 aa  135  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4170  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  36.57 
 
 
1508 aa  134  6e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0207391  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0744  hemagglutination activity domain-containing protein  28.5 
 
 
1745 aa  134  8.000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0630487  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1756  hemagglutinin, homlog  35.19 
 
 
905 aa  133  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.982994  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1614  hemagglutinin, homlog  35.19 
 
 
905 aa  133  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1822  hemagglutinin, homlog  35.19 
 
 
898 aa  133  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0492  hemagglutinin-like protein  35.19 
 
 
911 aa  133  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>