29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3110 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3110  cointegrate resolution protein T  100 
 
 		 336 aa  659    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00291993  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2977  cointegrate resolution protein T  76.12 
 
 		 336 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0357413  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2927  cointegrate resolution protein T  55.7 
 
 		 334 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0440763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25690  Tn4652, cointegrate resolution protein T  46.31 
 
 		 340 aa  215  7e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2522  hypothetical protein  49.8 
 
 		 328 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2982  Tn4652, cointegrate resolution protein T, putative  47.63 
 
 		 332 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.452807  normal  0.0424161 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3057  TnpT protein  48.51 
 
 		 333 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3239  Tn4652, cointegrate resolution protein T, putative  51.87 
 
 		 328 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.700572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35830  cointegrate resolution protein T  47.38 
 
 		 332 aa  196  6e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000214436  decreased coverage  7.37164e-20 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2650  Tn4652 cointegrate resolution protein T  50.62 
 
 		 326 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787846 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2250  hypothetical protein  44.17 
 
 		 300 aa  192  9e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00401309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2672  Tn4652 cointegrate resolution protein T  52.5 
 
 		 326 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.807767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1773  putative cointegrate resolution protein T  45.12 
 
 		 330 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.40151 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2488  cointegrate resolution protein T  39.75 
 
 		 365 aa  170  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.022084  normal  0.0490152 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5152  putative cointegrate resolution protein T  44.54 
 
 		 330 aa  170  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.14112  normal  0.670321 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2091  cointegrate resolution protein T  44.86 
 
 		 362 aa  168  9e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2378  cointegrate resolution protein T  44.86 
 
 		 362 aa  168  9e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000723193 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00631  cointegrate resolution protein T  45.99 
 
 		 339 aa  166  4e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0854758  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2275  TnpT protein  46.44 
 
 		 324 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0467434  hitchhiker  0.00186431 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1984  cointegrate resolution protein T  41.74 
 
 		 391 aa  139  6e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0193  cointegrate resolution protein T  57.33 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1383  hypothetical protein  28.8 
 
 		 380 aa  73.6  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3967  chromosome segregation ATPases-like  30 
 
 		 349 aa  72.8  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.649048  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4368  chromosome segregation ATPases-like protein  28.26 
 
 		 351 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2766  hypothetical protein  32.44 
 
 		 350 aa  67.8  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.120691  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4317  chromosome segregation ATPases-like protein  27.11 
 
 		 349 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02952  chromosome segregation ATPases-like protein  25.64 
 
 		 349 aa  63.9  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.420552  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1963  chromosome segregation ATPases-like  28.33 
 
 		 348 aa  56.6  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1226  CUB protein  22.78 
 
 		 1621 aa  44.7  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.287366  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>