43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3103 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3103  transcriptional regulator, putative  100 
 
 		 120 aa  246  8e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000951367  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2971  transcriptional regulator, putative  98.33 
 
 		 120 aa  242  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0855395 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2921  H-NS family protein MvaT  84.3 
 
 		 121 aa  203  5e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0220889  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2102  transcriptional regulator MvaT, P16 subunit  78.15 
 
 		 119 aa  189  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.313756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2138  transcriptional regulator MvaT, P16 subunit  76.47 
 
 		 119 aa  186  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000737433  hitchhiker  0.00000269456 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3765  transcriptional regulator MvaT, P16 subunit, putative  75.63 
 
 		 119 aa  184  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148956  normal  0.0287223 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1998  hypothetical protein  74.79 
 
 		 134 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.989293  hitchhiker  0.000130496 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2532  hypothetical protein  63.87 
 
 		 117 aa  155  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29590  putative transcriptional regulator  62.18 
 
 		 117 aa  152  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.656804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3014  hypothetical protein  61.67 
 
 		 123 aa  150  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4167  hypothetical protein  61.02 
 
 		 119 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000189495  normal  0.273328 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2345  hypothetical protein  59.83 
 
 		 120 aa  146  8e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4794  hypothetical protein  60 
 
 		 122 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5037  hypothetical protein  55.46 
 
 		 121 aa  143  9e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.038586  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4755  hypothetical protein  55.74 
 
 		 124 aa  141  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0017  transcriptional regulator MvaT, P16 subunit, putative  57.14 
 
 		 119 aa  140  7e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499101  unclonable  0.000000189493 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0009  hypothetical protein  57.14 
 
 		 119 aa  140  7e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000754026  normal  0.103636 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0011  hypothetical protein  57.14 
 
 		 119 aa  140  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.570728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0009  hypothetical protein  57.14 
 
 		 119 aa  140  7e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2795  H-NS family protein MvaT  58.68 
 
 		 121 aa  140  8e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.289356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56070  transcriptional regulator MvaT, P16 subunit  56.56 
 
 		 124 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0979321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1634  hypothetical protein  59.66 
 
 		 138 aa  136  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0882393  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3693  transcriptional regulator MvaT, P16 subunit, putative  57.85 
 
 		 121 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.643108  decreased coverage  0.000194447 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2443  hypothetical protein  59.66 
 
 		 120 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0503835  normal  0.228348 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4883  transcriptional regulator MvaT  55.28 
 
 		 125 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2947  transcriptional regulator MvaT, P16 subunit, putative  60 
 
 		 123 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.194319  normal  0.217791 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0128  hypothetical protein  55.74 
 
 		 121 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0281  hypothetical protein  56.56 
 
 		 121 aa  134  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1366  transcriptional regulator MvaT, P16 subunit  57.02 
 
 		 125 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000478135  normal  0.173651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4448  transcriptional regulator MvaT, P16 subunit  57.02 
 
 		 125 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000222895  hitchhiker  0.00000983981 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4357  hypothetical protein  57.02 
 
 		 125 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.00000000000135149  normal  0.0272701 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3337  transcriptional regulator, putative  57.02 
 
 		 121 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1006  transcriptional regulator MvaT, P16 subunit  56.2 
 
 		 125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000105934  hitchhiker  0.0000000000004027 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4019  transcriptional regulator, putative  55.28 
 
 		 126 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000000036562  normal  0.0246266 
 
 
 
NC_004578  PSPTO_4315  transcriptional regulator, putative  55.28 
 
 		 126 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000000286205  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3313  H-NS family protein MvaT  56.2 
 
 		 134 aa  130  5e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.747798  normal  0.724808 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4437  H-NS family protein MvaT  54.92 
 
 		 125 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00708385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2960  hypothetical protein  57.02 
 
 		 121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38310  Transcriptional regulator MvaT  52.89 
 
 		 126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0396822  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1652  H-NS family protein MvaT  45.45 
 
 		 125 aa  107  7.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000000469447  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2608  transcriptional regulator MvaT, P16 subunit  40 
 
 		 122 aa  100  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000264068  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4162  hypothetical protein  55 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4154  hypothetical protein  39.13 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0314351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>