More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3091 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_3220  ABC transporter, ATP-binding protein  71.8 
 
 
539 aa  739    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94364  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3091  nickel ABC transporter, ATP-binding protein, putative  100 
 
 
548 aa  1085    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00987515  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2961  ABC transporter  91.16 
 
 
547 aa  951    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18700  ABC transporter, ATP binding component  75.19 
 
 
542 aa  758    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106187  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3752  ABC transporter related  57.98 
 
 
597 aa  573  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0298  ABC transporter related  52.94 
 
 
565 aa  517  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3513  ABC transporter related protein  52.15 
 
 
541 aa  511  1e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.709638  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2819  ABC transporter related  48.28 
 
 
571 aa  508  1e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.810211  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4819  ABC transporter related  49.66 
 
 
619 aa  506  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0993193 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2537  ABC transporter related  48.37 
 
 
573 aa  506  9.999999999999999e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000203549 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2416  ABC transporter related  58.67 
 
 
505 aa  503  1e-141  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.48904  normal  0.517623 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4177  ABC transporter related  50.75 
 
 
561 aa  502  1e-141  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0028  ABC transporter related  50.37 
 
 
546 aa  496  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0987785  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4459  ABC transporter related protein  50.56 
 
 
565 aa  498  1e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0942  ABC transporter related  50.64 
 
 
551 aa  496  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.337051  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7172  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  50 
 
 
547 aa  494  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.892646  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1054  ABC transporter related  51.3 
 
 
563 aa  490  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.763117  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0030  ABC transporter related  50.09 
 
 
558 aa  491  1e-137  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1962  ABC transporter related protein  49.22 
 
 
573 aa  489  1e-137  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3912  ABC transporter related protein  48.06 
 
 
594 aa  489  1e-137  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11080  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  45.75 
 
 
643 aa  484  1e-135  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3154  ABC transporter-related protein  49.72 
 
 
557 aa  481  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1128  ABC transporter related  47.44 
 
 
588 aa  479  1e-134  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.716333  normal  0.0608285 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13693  dipeptide-transport ATP-binding protein ABC transporter dppD  50.56 
 
 
548 aa  473  1e-132  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.373881  normal  0.206528 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34300  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  48.5 
 
 
661 aa  473  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.183589 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4851  putative ABC transporter ATP-binding protein  48.79 
 
 
546 aa  466  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.508729  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0472  ABC transporter related  52.31 
 
 
545 aa  462  9.999999999999999e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.197295  normal  0.707988 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0716  ABC transporter related  45.05 
 
 
606 aa  458  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.953426  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2194  ABC transporter related  44.85 
 
 
600 aa  448  1.0000000000000001e-124  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.966605  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  45.93 
 
 
619 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01760  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  47.48 
 
 
584 aa  443  1e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2662  ABC transporter related  49.91 
 
 
538 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2746  ABC transporter related  48.01 
 
 
575 aa  445  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212206  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1832  ABC transporter related  46.36 
 
 
606 aa  443  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2574  ABC transporter related  46.58 
 
 
552 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  44.89 
 
 
562 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  44.54 
 
 
586 aa  438  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2314  ABC transporter related  49.91 
 
 
536 aa  437  1e-121  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.399989  normal  0.717185 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  44.12 
 
 
593 aa  434  1e-120  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.5 
 
 
617 aa  432  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05580  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  47.77 
 
 
583 aa  435  1e-120  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.158462  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  43.58 
 
 
612 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4449  ABC transporter related  46.67 
 
 
545 aa  431  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.875798 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  45.86 
 
 
547 aa  429  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.81 
 
 
611 aa  431  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  45.22 
 
 
576 aa  431  1e-119  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  44.2 
 
 
613 aa  428  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0625  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.83 
 
 
623 aa  427  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4135  ABC transporter related  46.3 
 
 
545 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7329  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.76 
 
 
626 aa  427  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148864  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3130  ABC transporter related  45.84 
 
 
552 aa  428  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3646  ABC transporter related  42.32 
 
 
609 aa  428  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0147  ABC transporter related  43.37 
 
 
624 aa  427  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888744  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  43.36 
 
 
555 aa  426  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0889  glutathione transporter ATP-binding protein  43.49 
 
 
623 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.448185  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0006  ABC transporter, ATP-binding protein  46.34 
 
 
541 aa  425  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0978  glutathione transporter ATP-binding protein  43.49 
 
 
623 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0006  ABC transporter, ATP-binding protein  46.15 
 
 
550 aa  422  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0296287  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2915  ABC transporter related  45.42 
 
 
540 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0265985  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0999  glutathione transporter ATP-binding protein  43.49 
 
 
623 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.666718  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  47.09 
 
 
553 aa  425  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  42.5 
 
 
615 aa  424  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7191  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.1 
 
 
564 aa  424  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453207  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0609  ABC transporter related  43.92 
 
 
609 aa  425  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436309  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4108  ABC transporter related  42.47 
 
 
623 aa  421  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.486076  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0658  ABC peptide transporter  44.24 
 
 
533 aa  420  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1222  ABC transporter related  44.07 
 
 
553 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1407  ABC transporter related  43.2 
 
 
550 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.288538  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  41.96 
 
 
623 aa  420  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0916  glutathione transporter ATP-binding protein  43.32 
 
 
623 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1804  ABC transporter related  45.28 
 
 
537 aa  421  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.147708 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  42.62 
 
 
543 aa  420  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  43.9 
 
 
539 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3970  ABC transporter related  42.37 
 
 
640 aa  416  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1868  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  43.43 
 
 
633 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0245  ABC transporter related  45.49 
 
 
542 aa  416  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0021  ABC transporter related  40.43 
 
 
610 aa  417  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1555  ABC transporter related protein  41.65 
 
 
593 aa  416  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2549  ABC transporter related  44.69 
 
 
530 aa  417  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  41.05 
 
 
611 aa  416  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  46.27 
 
 
542 aa  416  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0949  glutathione transporter ATP-binding protein  43.32 
 
 
623 aa  418  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  42.65 
 
 
611 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2975  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.47 
 
 
633 aa  416  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2005  ABC transporter related  44.02 
 
 
552 aa  416  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.91 
 
 
632 aa  413  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0701  peptide ABC transporter ATPase  44.24 
 
 
543 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  45.66 
 
 
539 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3131  ABC transporter related  42.56 
 
 
640 aa  413  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022829  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4143  ABC transporter related  43.44 
 
 
556 aa  414  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.538724 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4026  ABC transporter related  43.96 
 
 
557 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1252  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.11 
 
 
629 aa  415  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0894712  normal  0.866591 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6665  ABC transporter related  42.11 
 
 
611 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00669103 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3988  ABC transporter related  46.7 
 
 
547 aa  414  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  41.8 
 
 
546 aa  412  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2386  peptide ABC transporter  45.6 
 
 
536 aa  413  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  42.55 
 
 
568 aa  412  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3002  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.7 
 
 
625 aa  414  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  45.66 
 
 
539 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2356  ABC transporter related  44.42 
 
 
543 aa  413  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.10022 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>