More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2995 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2995  ribose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  100 
 
 		 522 aa  1035    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2876  ABC transporter  85.66 
 
 		 523 aa  877    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.256251 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43610  ABC transporter  67.13 
 
 		 516 aa  630  1e-179  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00213135  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2759  ribose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  64.57 
 
 		 512 aa  626  1e-178  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2994  ABC transporter related  64.57 
 
 		 512 aa  626  1e-178  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6460  ABC transporter related  57.52 
 
 		 516 aa  535  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.121658  normal  0.108747 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5973  ABC transporter related  57.52 
 
 		 516 aa  536  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5167  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  55.88 
 
 		 517 aa  535  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2366  ABC sugar (ribose) transporter, fused ATPase subunits  53.24 
 
 		 502 aa  496  1e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1027  ABC transporter related  53.24 
 
 		 502 aa  497  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.8293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4172  ABC transporter related  48.57 
 
 		 504 aa  485  1e-136  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0023  ABC transporter ATP-binding protein  42.99 
 
 		 875 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1425  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  43.15 
 
 		 601 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.148525  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0136  ribose transport ATP-binding protein RbsA  42.65 
 
 		 605 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.155752  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0415  ribose transport ATP-binding protein rbsA  42.83 
 
 		 605 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.150209  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1512  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  42.83 
 
 		 605 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1165  ribose transport ATP-binding protein RbsA  42.83 
 
 		 605 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.20892  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1620  ABC transporter related  36.2 
 
 		 493 aa  373  1e-102  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  40.16 
 
 		 506 aa  374  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  38.21 
 
 		 497 aa  372  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  40.73 
 
 		 499 aa  371  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  40.28 
 
 		 520 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  40.49 
 
 		 515 aa  365  1e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  36.97 
 
 		 495 aa  365  1e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  41.62 
 
 		 519 aa  365  1e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2723  ABC transporter related  42.6 
 
 		 515 aa  363  3e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  38.97 
 
 		 507 aa  361  2e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  38.97 
 
 		 507 aa  361  2e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  38.97 
 
 		 507 aa  360  3e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3675  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.07 
 
 		 495 aa  360  4e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.973573  normal  0.0920445 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  40.12 
 
 		 517 aa  360  4e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  39.96 
 
 		 501 aa  360  4e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  39.08 
 
 		 504 aa  359  7e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2244  ABC transporter related  42.22 
 
 		 495 aa  359  8e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  39.92 
 
 		 514 aa  358  9e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  39.09 
 
 		 506 aa  358  9.999999999999999e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  36.71 
 
 		 496 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  35.63 
 
 		 496 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4335  ABC transporter related  41.19 
 
 		 511 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.975481  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4598  ABC transporter related  41.19 
 
 		 506 aa  356  5e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0392025 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  35.56 
 
 		 494 aa  355  1e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3207  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.75 
 
 		 515 aa  355  1e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0341  D-ribose transporter ATP binding protein  39.1 
 
 		 501 aa  355  1e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  35.63 
 
 		 494 aa  355  1e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1627  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.94 
 
 		 525 aa  354  2e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  38.74 
 
 		 504 aa  354  2e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  36.57 
 
 		 497 aa  354  2e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  35.09 
 
 		 494 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0046  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.41 
 
 		 522 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.54995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4589  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.68 
 
 		 515 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173683 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5219  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.68 
 
 		 515 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09550  ABC transporter related  37.6 
 
 		 500 aa  353  2.9999999999999997e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.58805  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3279  ABC transporter related  37.22 
 
 		 505 aa  353  2.9999999999999997e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5640  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.68 
 
 		 515 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.273168  normal  0.0496803 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  36.33 
 
 		 492 aa  353  4e-96  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  35.63 
 
 		 494 aa  353  4e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  35.63 
 
 		 494 aa  353  4e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  40.9 
 
 		 504 aa  353  4e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  36.75 
 
 		 502 aa  353  4e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  41.68 
 
 		 508 aa  353  4e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  35.63 
 
 		 494 aa  353  4e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  35.02 
 
 		 501 aa  353  5e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0809  ABC transporter related  37.01 
 
 		 509 aa  352  8e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  35.09 
 
 		 494 aa  352  8e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  35.63 
 
 		 494 aa  352  8e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  37.34 
 
 		 494 aa  352  8e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  41.12 
 
 		 506 aa  352  8.999999999999999e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0157  ABC transporter related  35.79 
 
 		 507 aa  352  8.999999999999999e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0274  ABC transporter related protein  35.02 
 
 		 498 aa  352  1e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2372  L-arabinose transporter ATP-binding protein  40.76 
 
 		 507 aa  352  1e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179136  normal  0.245048 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  35.7 
 
 		 496 aa  352  1e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  39.6 
 
 		 514 aa  352  1e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4920  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.5 
 
 		 519 aa  352  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.671617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  39.6 
 
 		 514 aa  352  1e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  37.97 
 
 		 506 aa  351  2e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  37.12 
 
 		 503 aa  351  2e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  40 
 
 		 516 aa  350  3e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  39.6 
 
 		 514 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2639  L-arabinose ABC transporter, ATP-binding protein  40.56 
 
 		 507 aa  350  5e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0558785  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0832  ABC transporter related  36.81 
 
 		 520 aa  350  5e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1060  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  37.03 
 
 		 506 aa  349  5e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  37.45 
 
 		 495 aa  349  6e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  38 
 
 		 517 aa  349  7e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5475  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.43 
 
 		 520 aa  349  7e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0511877 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  35.54 
 
 		 501 aa  349  8e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0962  ABC transporter related  40.45 
 
 		 495 aa  349  8e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2884  ABC transporter-like protein  43.5 
 
 		 502 aa  348  1e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.913699 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06145  D-ribose transporter ATP binding protein  38.18 
 
 		 501 aa  348  1e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  36.54 
 
 		 513 aa  348  2e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  38.76 
 
 		 501 aa  348  2e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2996  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  36.83 
 
 		 506 aa  348  2e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3282  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  36.04 
 
 		 506 aa  348  2e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.684279 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  39.52 
 
 		 512 aa  347  4e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  38.38 
 
 		 501 aa  347  4e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  39.03 
 
 		 512 aa  346  5e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02078  fused methyl-galactoside transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  35.84 
 
 		 506 aa  345  1e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.833223  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2444  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  35.84 
 
 		 506 aa  345  1e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  38.43 
 
 		 514 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1601  ribose transport ATP-binding protein rbsA  35.34 
 
 		 501 aa  345  1e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0126293  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2296  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  35.84 
 
 		 506 aa  345  1e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020685 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>