162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2980 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2980  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  100 
 
 		 337 aa  702    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00391841  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2858  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  91.99 
 
 		 337 aa  651    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.863693  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  68.96 
 
 		 334 aa  483  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4351  2OG-Fe(II) oxygenase  61.06 
 
 		 337 aa  423  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01810  putative oxidoreductase  37.8 
 
 		 320 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.773533  normal  0.461944 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0225  putative oxidoreductase  38.1 
 
 		 320 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2994  2OG-Fe(II) oxygenase  37.08 
 
 		 320 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.12104 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0758  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  38.15 
 
 		 321 aa  215  7e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0662  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  38.82 
 
 		 321 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.937654 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0672  2OG-Fe(II) oxygenase  37.31 
 
 		 321 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4357  2OG-Fe(II) oxygenase  35.08 
 
 		 327 aa  206  5e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2035  2OG-Fe(II) oxygenase  36.76 
 
 		 323 aa  203  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.577348 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1716  2OG-Fe(II) oxygenase  37.07 
 
 		 323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.863963 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1098  2OG-Fe(II) oxygenase  37.38 
 
 		 323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00260099  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5574  2OG-Fe(II) oxygenase  39.41 
 
 		 321 aa  193  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2435  2OG-Fe(II) oxygenase  36.14 
 
 		 318 aa  189  5e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000377785  normal  0.0745566 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1265  2OG-Fe(II) oxygenase  35.28 
 
 		 356 aa  189  5.999999999999999e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.602158  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00051  conserved hypothetical protein: thymine dioxygenase (Eurofung)  34.62 
 
 		 350 aa  186  4e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.862893  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07953  conserved hypothetical protein  34.1 
 
 		 338 aa  183  4.0000000000000006e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.679163  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0258  2OG-Fe(II) oxygenase  36.06 
 
 		 343 aa  183  4.0000000000000006e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11188  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00230)  34.88 
 
 		 349 aa  181  1e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0856  2OG-Fe(II) oxygenase  36.21 
 
 		 313 aa  179  4e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.46878  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5111  2OG-Fe(II) oxygenase  33.75 
 
 		 335 aa  168  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141171  normal  0.0243264 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  34.45 
 
 		 329 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.266793  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02720  conserved hypothetical protein  32.41 
 
 		 345 aa  166  5e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1242  2OG-Fe(II) oxygenase  33.13 
 
 		 352 aa  166  8e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888679 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5231  2OG-Fe(II) oxygenase  33.33 
 
 		 351 aa  162  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1818  putative oxidoreductase  33.24 
 
 		 329 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1377  2OG-Fe(II) oxygenase  37.04 
 
 		 300 aa  158  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.537796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1380  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  31.83 
 
 		 353 aa  158  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.87154  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1002  2OG-Fe(II) oxygenase  31.65 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1850  2OG-Fe(II) oxygenase  33.86 
 
 		 346 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.617074  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1897  2OG-Fe(II) oxygenase  33.86 
 
 		 346 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1831  2OG-Fe(II) oxygenase  33.86 
 
 		 346 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2839  2OG-Fe(II) oxygenase  28 
 
 		 316 aa  147  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.323961  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1362  2OG-Fe(II) oxygenase  34.78 
 
 		 341 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.310836  normal  0.0218299 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2219  2OG-Fe(II) oxygenase  34.16 
 
 		 341 aa  145  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.127604  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01276  oxidoreductase  34.58 
 
 		 312 aa  144  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192671  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2834  2OG-Fe(II) oxygenase  31.9 
 
 		 311 aa  144  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.155948  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02390  conserved hypothetical protein  29.14 
 
 		 341 aa  143  4e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1602  2OG-Fe(II) oxygenase  30.31 
 
 		 318 aa  143  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.29559 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10948  oxidoreductase  27.66 
 
 		 316 aa  141  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.452034  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1330  2OG-Fe(II) oxygenase  34.06 
 
 		 311 aa  142  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.000246979  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3772  2OG-Fe(II) oxygenase  34.24 
 
 		 348 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4054  2OG-Fe(II) oxygenase  33.44 
 
 		 319 aa  139  7e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.96316 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1698  2OG-Fe(II) oxygenase  34.1 
 
 		 317 aa  137  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.199962  normal  0.108876 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5009  2OG-Fe(II) oxygenase  34.18 
 
 		 330 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.455169  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2580  2OG-Fe(II) oxygenase  31.74 
 
 		 319 aa  136  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3600  2OG-Fe(II) oxygenase  35.16 
 
 		 317 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.105776  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3673  2OG-Fe(II) oxygenase  35.16 
 
 		 317 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3605  2OG-Fe(II) oxygenase  35.16 
 
 		 317 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138274  normal  0.571446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4252  2OG-Fe(II) oxygenase  29.63 
 
 		 344 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03672  conserved hypothetical protein  26.44 
 
 		 335 aa  134  3e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.278231  normal  0.0460454 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3490  2OG-Fe(II) oxygenase  32.73 
 
 		 343 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.948158  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3553  2OG-Fe(II) oxygenase  32.73 
 
 		 343 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.379896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3503  2OG-Fe(II) oxygenase  32.73 
 
 		 343 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00994559  normal  0.800786 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2334  2OG-Fe(II) oxygenase  33.02 
 
 		 350 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2706  2OG-Fe(II) oxygenase  28.66 
 
 		 318 aa  130  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17574  predicted protein  31.35 
 
 		 323 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.769732  normal  0.690692 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4042  2OG-Fe(II) oxygenase  31.76 
 
 		 339 aa  130  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1140  2OG-Fe(II) oxygenase  30.35 
 
 		 316 aa  125  9e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.592265  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01370  conserved hypothetical protein  29.65 
 
 		 330 aa  125  1e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1639  2OG-Fe(II) oxygenase  33.44 
 
 		 346 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.459164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0316  2OG-Fe(II) oxygenase  30.96 
 
 		 334 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2744  2OG-Fe(II) oxygenase  32.04 
 
 		 355 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2663  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  32.04 
 
 		 355 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51291  predicted protein  29.91 
 
 		 300 aa  123  5e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.964092  normal  0.399853 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36774  predicted protein  29.91 
 
 		 300 aa  123  5e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169141  normal  0.0126038 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0477  2OG-Fe(II) oxygenase  27.58 
 
 		 320 aa  122  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.784236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1625  2OG-Fe(II) oxygenase  33.02 
 
 		 339 aa  122  8e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179201 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1673  2OG-Fe(II) oxygenase  27.11 
 
 		 340 aa  120  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120269  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1734  2OG-Fe(II) oxygenase  28.18 
 
 		 306 aa  119  7e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00619984  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3331  2OG-Fe(II) oxygenase  30.15 
 
 		 340 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1040  2OG-Fe(II) oxygenase  31.35 
 
 		 309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5408  flavonol synthase/dioxygenase  30.3 
 
 		 327 aa  117  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.293243  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00526  conserved hypothetical protein  27.78 
 
 		 332 aa  117  3.9999999999999997e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.333094 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4256  2OG-Fe(II) oxygenase  29.75 
 
 		 406 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.798604  normal  0.385246 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0728  2OG-Fe(II) oxygenase  30.36 
 
 		 334 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2632  2OG-Fe(II) oxygenase  30.33 
 
 		 344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4579  2OG-Fe(II) oxygenase  28.87 
 
 		 349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1135  2OG-Fe(II) oxygenase  31.73 
 
 		 340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1340  2OG-Fe(II) oxygenase  30.23 
 
 		 343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0498174  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3655  2OG-Fe(II) oxygenase  29.61 
 
 		 340 aa  114  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3169  2OG-Fe(II) oxygenase  29.57 
 
 		 346 aa  112  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235169 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0315  2OG-Fe(II) oxygenase  30.96 
 
 		 334 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0672  2OG-Fe(II) oxygenase  27.69 
 
 		 343 aa  110  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2705  2OG-Fe(II) oxygenase  27.66 
 
 		 328 aa  109  7.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.384991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1545  iron/ascorbate-dependent oxidoreductase  29.64 
 
 		 326 aa  108  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0188  2OG-Fe(II) oxygenase  29.25 
 
 		 343 aa  108  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.406722  normal  0.181391 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0311  2OG-Fe(II) oxygenase  30.96 
 
 		 334 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39543  predicted protein  28.53 
 
 		 355 aa  107  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159789  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31468  predicted protein  27.73 
 
 		 341 aa  107  3e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5615  2OG-Fe(II) oxygenase  30.03 
 
 		 367 aa  107  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.783104  normal  0.336051 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3789  2OG-Fe(II) oxygenase  29.49 
 
 		 352 aa  106  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4741  putative 2OG-Fe(II) oxygenase  28.22 
 
 		 330 aa  105  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00486881  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45605  predicted protein  27.97 
 
 		 337 aa  105  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.147152  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1085  2OG-Fe(II) oxygenase  29.81 
 
 		 338 aa  104  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.758067  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02622  Isopenicillin N synthetase (EC 1.21.3.1)(Isopenicillin N synthase)(IPNS) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P05326]  27.06 
 
 		 331 aa  102  7e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0182  2OG-Fe(II) oxygenase  28.1 
 
 		 311 aa  102  9e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0775  2OG-Fe(II) oxygenase  32.06 
 
 		 343 aa  101  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.214657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>