202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2969 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2969  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  333  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0448916  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  86.27 
 
 		 219 aa  277  5e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18450  transcriptional regulator, TetR family  62.91 
 
 		 179 aa  206  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  61.18 
 
 		 212 aa  204  4e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25370  Transcriptional regulatory protein, TetR  60.78 
 
 		 209 aa  201  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  58.28 
 
 		 214 aa  189  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  58.17 
 
 		 212 aa  189  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  58.17 
 
 		 210 aa  185  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  54.32 
 
 		 222 aa  183  8e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  57.52 
 
 		 212 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  57.52 
 
 		 186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  56.86 
 
 		 212 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  56.86 
 
 		 212 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  56.86 
 
 		 186 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2638  TetR family transcriptional regulator  53.09 
 
 		 210 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  52.7 
 
 		 212 aa  172  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  57.62 
 
 		 211 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  51.35 
 
 		 213 aa  170  7.999999999999999e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4476  TetR family transcriptional regulator  51.66 
 
 		 220 aa  168  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000182515 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0083  TetR family transcriptional regulator  51.68 
 
 		 219 aa  156  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.201393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1674  transcriptional regulator, TetR family  50.68 
 
 		 204 aa  155  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1435  TetR family regulatory protein  51.68 
 
 		 219 aa  155  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 215 aa  140  7e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4749  TetR family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 207 aa  137  6e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 196 aa  134  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  43.06 
 
 		 193 aa  134  7.000000000000001e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0730  TetR family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 214 aa  132  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 196 aa  130  9e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 227 aa  129  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  40.52 
 
 		 198 aa  124  5e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 193 aa  120  7e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2518  TetR family transcriptional regulator  49.35 
 
 		 221 aa  114  6e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  39.58 
 
 		 205 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 202 aa  92.8  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0208  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 191 aa  89.4  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 198 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1980  transcriptional regulator, TetR family  32.17 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  32.87 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0316  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53410  transcriptional regulator  34.9 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.733487  normal  0.037637 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0962  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 200 aa  77.8  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4681  transcriptional regulator  34.9 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4221  TetR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1606  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0686792  normal  0.0717181 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0971  TetR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 200 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.325702 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5954  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.419182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3964  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4403  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3993  transcriptional regulator, TetR family protein  32.12 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000102791  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4292  TetR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3438  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 190 aa  67.4  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.547681  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4097  transcriptional regulator, TetR family  30.71 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1388  regulatory protein, TetR  30.34 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4102  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2231  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 194 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.558633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3100  putative transcriptional regulator  32.87 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2475  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000212819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3824  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0162  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1408  TetR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 200 aa  62  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1351  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2293  TetR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 247 aa  62  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.887651  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1702  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 311 aa  62  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0527  TetR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 200 aa  62  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.474473  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0121  TetR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 200 aa  62  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1058  TetR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 200 aa  62  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0974  TetR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 200 aa  62  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.543907  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1493  TetR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 200 aa  62  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2933  regulatory protein, TetR  34.31 
 
 		 193 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316351  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01619  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.97 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000798557  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1991  transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000115862  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1841  transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.170954  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1980  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00264568  hitchhiker  0.00106159 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2361  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000141293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01609  hypothetical protein  28.97 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000476829  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1726  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.716564  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1549  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0178403  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  33.6 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2209  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1797  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0497705  normal  0.0268872 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1864  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0665556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C37  transcriptional regulator  36.27 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1534  transcriptional regulator, TetR family  29.66 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.239413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1547  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.58457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1607  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1906  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  29.66 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3076  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192901  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0268  transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 		 198 aa  57.4  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0272  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>