More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2696 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  100 
 
 		 128 aa  265  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2430  NUDIX hydrolase  86.07 
 
 		 132 aa  206  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0238883 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3290  NUDIX hydrolase  46.22 
 
 		 120 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3522  NUDIX hydrolase  49.12 
 
 		 141 aa  110  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.478841 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4365  NUDIX hydrolase  48.25 
 
 		 141 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4001  NUDIX hydrolase  48.25 
 
 		 141 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4812  NUDIX hydrolase  45.61 
 
 		 140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1577  NUDIX hydrolase  49.12 
 
 		 137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.479976  normal  0.0612307 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1638  NUDIX hydrolase  45.61 
 
 		 140 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1184  NUDIX hydrolase  45.61 
 
 		 140 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1664  NUDIX hydrolase  45.61 
 
 		 140 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2090  NUDIX hydrolase  47.37 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.147471  normal  0.280778 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3914  NUDIX hydrolase  45.38 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.434564 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3407  NUDIX hydrolase  45.38 
 
 		 140 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4759  NUDIX hydrolase  47.32 
 
 		 203 aa  104  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.420324 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1582  NUDIX hydrolase  43.86 
 
 		 142 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.4234  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1563  NUDIX hydrolase  43.86 
 
 		 142 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2082  NUDIX hydrolase  43.36 
 
 		 146 aa  100  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.494024 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2492  NUDIX hydrolase  44.07 
 
 		 132 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5518  NUDIX hydrolase  46.96 
 
 		 183 aa  98.2  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2939  NUDIX hydrolase  46.36 
 
 		 130 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3268  MutT/nudix family protein  44.07 
 
 		 132 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1837  MutT/NUDIX family hydrolase  41.67 
 
 		 158 aa  96.7  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158104  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1264  putative MutT/Nudix family protein  44.54 
 
 		 132 aa  96.7  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0696899 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6153  NUDIX hydrolase  43.22 
 
 		 185 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.292779 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1285  NUDIX hydrolase  42.37 
 
 		 185 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270966  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6546  NUDIX hydrolase  42.37 
 
 		 185 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.293619  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  37.5 
 
 		 146 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4233  NUDIX hydrolase  40.35 
 
 		 135 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257262  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5852  NUDIX hydrolase  39.47 
 
 		 122 aa  89  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2944  NUDIX hydrolase  41.23 
 
 		 140 aa  88.6  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5170  NUDIX hydrolase  41.23 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.140908  normal  0.555587 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4397  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0874525  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5533  NUDIX hydrolase  42 
 
 		 147 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00579175 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6007  NUDIX hydrolase  38.26 
 
 		 165 aa  84.7  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2976  NUDIX hydrolase  48.72 
 
 		 106 aa  67  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.505456  normal  0.467098 
 
 
-
 
NC_004310  BR0672  MutT/nudix family protein  31.3 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0666  MutT/nudix family protein  31.3 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2614  NUDIX hydrolase  31.34 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349258  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  32.77 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  31.91 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06372  hypothetical protein  34.33 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2230  hypothetical protein  51.85 
 
 		 310 aa  57  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.328266  normal  0.270342 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  32.2 
 
 		 141 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2700  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0600757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0401  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  35.56 
 
 		 758 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.932196  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  32.77 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13370  hypothetical protein  33.9 
 
 		 313 aa  55.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00160  ADP-ribose pyrophosphatase  36.45 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119195 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  29.46 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2973  putative mutT-like protein  31.48 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2930  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  32.69 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3976  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  31.93 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495493  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  31.93 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0011  NUDIX hydrolase  35.45 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.695589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1007  NUDIX hydrolase  42.5 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.175488  hitchhiker  0.000423095 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1843  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  31.01 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.910246  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1243  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  34.26 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_004310  BR1939  mutator mutT protein, putative  30.25 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2859  NUDIX hydrolase  38.32 
 
 		 398 aa  53.5  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.010676 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0490  NUDIX/MutT family protein  33.85 
 
 		 168 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000225283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1866  putative mutator mutT protein  30.25 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2054  NUDIX hydrolase  52.73 
 
 		 226 aa  53.5  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.762923  normal  0.0850915 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  30 
 
 		 306 aa  52.8  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1395  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  29.91 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0511972 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3241  dinucleoside polyphosphate hydrolase  48.28 
 
 		 175 aa  53.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000341046  normal  0.0858473 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1033  dinucleoside polyphosphate hydrolase  48.28 
 
 		 175 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000236129  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0981  dinucleoside polyphosphate hydrolase  48.28 
 
 		 175 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.12815e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1412  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  29.06 
 
 		 138 aa  52.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3399  dinucleoside polyphosphate hydrolase  46.55 
 
 		 178 aa  53.5  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000267349  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1988  NUDIX hydrolase  52.27 
 
 		 164 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0344946  normal  0.279217 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4015  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3272  dinucleoside polyphosphate hydrolase  46.55 
 
 		 176 aa  53.5  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000105899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1483  NUDIX hydrolase  45 
 
 		 210 aa  53.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163061 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1163  NUDIX hydrolase  36.54 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3328  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.672481  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2441  mutator MutT protein  32.23 
 
 		 329 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  38.96 
 
 		 154 aa  52  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  28.24 
 
 		 159 aa  52  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1874  pyrimidine (deoxy)nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  29.06 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400032  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2667  hypothetical protein  31.91 
 
 		 105 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0224817  normal  0.186167 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  30.51 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  36.63 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  35.05 
 
 		 195 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12360  ADP-ribose pyrophosphatase  32.8 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1103  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.440474 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0612  hypothetical protein  32.56 
 
 		 318 aa  52.4  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.362633  normal  0.329408 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3824  dinucleoside polyphosphate hydrolase  48.28 
 
 		 175 aa  51.6  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000167151  normal  0.427646 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4549  NUDIX hydrolase  29.37 
 
 		 144 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0460835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1148  hypothetical protein  25.64 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000504849  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  29.91 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1182  NUDIX hydrolase  32.23 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  28.8 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  28.1 
 
 		 146 aa  51.6  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>