More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2694 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  89.23 
 
 		 427 aa  808    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  73.36 
 
 		 428 aa  671    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  89.7 
 
 		 427 aa  810    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1274  hypothetical protein  72.37 
 
 		 428 aa  661    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  100 
 
 		 427 aa  877    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  97.66 
 
 		 427 aa  840    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20380  FAD-dependent oxidoreductase  77.93 
 
 		 427 aa  701    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  90.4 
 
 		 427 aa  811    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  85.21 
 
 		 427 aa  768    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  72.9 
 
 		 428 aa  681    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2638  putative oxidoreductase  71.5 
 
 		 428 aa  656    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000755871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  88.76 
 
 		 427 aa  808    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  73.36 
 
 		 428 aa  671    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0977  FAD dependent oxidoreductase  73.54 
 
 		 428 aa  675    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  71.9 
 
 		 440 aa  675    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  73.13 
 
 		 428 aa  677    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  72.9 
 
 		 428 aa  667    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  86.62 
 
 		 427 aa  778    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1135  FAD dependent oxidoreductase  72.2 
 
 		 428 aa  659    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  73.36 
 
 		 428 aa  671    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  72.9 
 
 		 428 aa  668    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  89.46 
 
 		 427 aa  809    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  84.74 
 
 		 427 aa  779    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  72.9 
 
 		 428 aa  666    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  72.66 
 
 		 428 aa  665    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  73.83 
 
 		 428 aa  681    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  73.13 
 
 		 428 aa  670    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  63.68 
 
 		 433 aa  587  1e-166  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  65.57 
 
 		 426 aa  578  1e-164  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  65.57 
 
 		 426 aa  578  1e-164  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  65.57 
 
 		 426 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  65.57 
 
 		 426 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  65.57 
 
 		 426 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  65.57 
 
 		 426 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  65.57 
 
 		 426 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  65.57 
 
 		 426 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  64.61 
 
 		 427 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  65.33 
 
 		 426 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  63.92 
 
 		 426 aa  569  1e-161  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4676  oxidoreductase, FAD-dependent  61.36 
 
 		 427 aa  562  1.0000000000000001e-159  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  58.31 
 
 		 427 aa  525  1e-148  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  55.16 
 
 		 436 aa  503  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  47.65 
 
 		 438 aa  399  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  47.73 
 
 		 437 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  46.62 
 
 		 437 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  47.98 
 
 		 437 aa  393  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  47.89 
 
 		 436 aa  394  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  46.5 
 
 		 431 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  46.5 
 
 		 431 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  46.26 
 
 		 431 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  46.26 
 
 		 431 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  47.16 
 
 		 439 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  47.16 
 
 		 439 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0942  FAD dependent oxidoreductase  44.08 
 
 		 435 aa  385  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  47.93 
 
 		 430 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5325  FAD dependent oxidoreductase  47.93 
 
 		 430 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0381154 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3014  FAD dependent oxidoreductase  41.98 
 
 		 435 aa  372  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  45.33 
 
 		 430 aa  368  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0969  FAD dependent oxidoreductase  41.81 
 
 		 434 aa  371  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  43.84 
 
 		 435 aa  369  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1127  FAD dependent oxidoreductase  42.42 
 
 		 435 aa  367  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  45.61 
 
 		 423 aa  367  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  41.8 
 
 		 435 aa  365  1e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  41.34 
 
 		 435 aa  363  3e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  41.34 
 
 		 435 aa  363  4e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2922  FAD dependent oxidoreductase  42.18 
 
 		 435 aa  363  4e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  44.24 
 
 		 430 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  41.11 
 
 		 435 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  44.84 
 
 		 430 aa  362  8e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  41.11 
 
 		 435 aa  362  8e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3101  FAD dependent oxidoreductase  42.18 
 
 		 435 aa  361  1e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3004  FAD dependent oxidoreductase  41.71 
 
 		 435 aa  360  2e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  45.39 
 
 		 433 aa  358  8e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  44.24 
 
 		 430 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  44.24 
 
 		 430 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  44.94 
 
 		 430 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  44.24 
 
 		 430 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5273  oxidoreductase, putative  48.18 
 
 		 430 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.194713  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1264  oxidoreductase  40.76 
 
 		 435 aa  354  1e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1839  FAD dependent oxidoreductase  45.63 
 
 		 436 aa  354  1e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.131772  normal  0.38658 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1057  FAD dependent oxidoreductase  41.94 
 
 		 435 aa  354  2e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  44.13 
 
 		 433 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5183  FAD dependent oxidoreductase  47.93 
 
 		 430 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0718586 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2032  FAD dependent oxidoreductase  43.03 
 
 		 433 aa  352  8.999999999999999e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6070  FAD dependent oxidoreductase  44.84 
 
 		 430 aa  351  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2911  FAD dependent oxidoreductase  44.86 
 
 		 433 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  43.84 
 
 		 429 aa  350  2e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  43.22 
 
 		 433 aa  349  5e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3049  FAD dependent oxidoreductase  44.16 
 
 		 433 aa  349  5e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  43.69 
 
 		 433 aa  348  7e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0378  hypothetical protein  42.79 
 
 		 433 aa  348  1e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.18492  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  43.69 
 
 		 433 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1019  FAD dependent oxidoreductase  44.21 
 
 		 424 aa  347  2e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  43.22 
 
 		 433 aa  344  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4055  FAD dependent oxidoreductase  41.33 
 
 		 435 aa  342  9e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.80988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  41.41 
 
 		 435 aa  341  2e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1341  FAD dependent oxidoreductase  41.09 
 
 		 435 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268345  normal  0.168111 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3843  FAD dependent oxidoreductase  41.33 
 
 		 435 aa  340  4e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  40.86 
 
 		 425 aa  337  1.9999999999999998e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0934  putative oxidoreductase  43.41 
 
 		 440 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154441  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>