More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2618 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2618  acetylornithine aminotransferase  100 
 
 		 400 aa  815    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00459682  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2358  acetylornithine aminotransferase  87.25 
 
 		 400 aa  721    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284538  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4636  acetylornithine aminotransferase  76.41 
 
 		 395 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621133  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0982  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  58.79 
 
 		 410 aa  442  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1346  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  55.61 
 
 		 399 aa  440  9.999999999999999e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3708  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  57.29 
 
 		 412 aa  436  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.339324  normal  0.0114471 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  54.21 
 
 		 390 aa  414  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  53.77 
 
 		 392 aa  414  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  52.67 
 
 		 391 aa  404  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2429  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  53.19 
 
 		 393 aa  402  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1102  acetylornithine aminotransferase  55.26 
 
 		 394 aa  402  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0946  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  52.73 
 
 		 398 aa  396  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104291  normal  0.0999204 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1851  acetylornithine aminotransferase  54.03 
 
 		 394 aa  396  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  51.45 
 
 		 394 aa  395  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1710  acetylornithine aminotransferase  54.35 
 
 		 392 aa  393  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00335003 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0570  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  53.61 
 
 		 388 aa  390  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0406  acetylornithine aminotransferase  53.61 
 
 		 388 aa  390  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3033  acetylornithine aminotransferase  50.93 
 
 		 390 aa  377  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.850335  normal  0.390329 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3040  acetylornithine aminotransferase  47.4 
 
 		 389 aa  374  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2898  acetylornithine aminotransferase  47.4 
 
 		 389 aa  373  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2676  acetylornithine aminotransferase  50.26 
 
 		 391 aa  373  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  46.19 
 
 		 388 aa  370  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3572  acetylornithine aminotransferase  50.8 
 
 		 404 aa  371  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1452  acetylornithine aminotransferase  50.13 
 
 		 402 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1423  acetylornithine aminotransferase  48.7 
 
 		 398 aa  367  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.050105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3011  acetylornithine aminotransferase  49.73 
 
 		 404 aa  367  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1405  acetylornithine aminotransferase  48.71 
 
 		 393 aa  363  3e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.966648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1164  acetylornithine aminotransferase  50.4 
 
 		 398 aa  362  7.0000000000000005e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1057  acetylornithine aminotransferase  48.45 
 
 		 393 aa  361  1e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00148742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2429  acetylornithine aminotransferase  50.66 
 
 		 398 aa  361  1e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3002  acetylornithine aminotransferase  50.4 
 
 		 398 aa  360  3e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.555766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0906  acetylornithine aminotransferase  49.2 
 
 		 402 aa  360  3e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2121  acetylornithine aminotransferase  49.08 
 
 		 404 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00994118  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3029  acetylornithine aminotransferase  49.6 
 
 		 410 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.51469  normal  0.939431 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2179  acetylornithine aminotransferase  47.76 
 
 		 398 aa  352  5.9999999999999994e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.569965  normal  0.442274 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0063  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  46.23 
 
 		 396 aa  344  2e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.857354  normal  0.372491 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0727  acetylornithine aminotransferase  52.24 
 
 		 389 aa  336  5e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1901  acetylornithine aminotransferase  46.7 
 
 		 400 aa  335  5.999999999999999e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.133726  normal  0.687258 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  44.33 
 
 		 395 aa  331  1e-89  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  43.8 
 
 		 403 aa  331  1e-89  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  45.05 
 
 		 402 aa  330  4e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  41.56 
 
 		 396 aa  327  3e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  43.27 
 
 		 395 aa  325  6e-88  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3744  acetylornithine aminotransferase  45.55 
 
 		 391 aa  323  4e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  43.3 
 
 		 400 aa  319  3.9999999999999996e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.77 
 
 		 399 aa  319  7e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  42.74 
 
 		 395 aa  318  7.999999999999999e-86  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.29 
 
 		 417 aa  318  2e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.21 
 
 		 397 aa  317  3e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3311  acetylornithine aminotransferase  45.01 
 
 		 390 aa  317  3e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0246414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11673  acetylornithine aminotransferase  46.55 
 
 		 400 aa  315  7e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000327992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0943  acetylornithine aminotransferase  44.68 
 
 		 422 aa  314  9.999999999999999e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2969  acetylornithine aminotransferase  46.04 
 
 		 402 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435478  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2984  acetylornithine aminotransferase  46.04 
 
 		 402 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0590766 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3013  acetylornithine aminotransferase  46.04 
 
 		 402 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.686794 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3527  acetylornithine aminotransferase  45.01 
 
 		 395 aa  313  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.327175  normal  0.819815 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5468  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.53 
 
 		 436 aa  311  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  42.93 
 
 		 396 aa  311  1e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1260  acetylornithine aminotransferase  44.7 
 
 		 399 aa  310  2e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.161601 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  45.24 
 
 		 396 aa  310  4e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  42.19 
 
 		 394 aa  309  4e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3172  acetylornithine aminotransferase  45.41 
 
 		 444 aa  308  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.22064  normal  0.239102 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  42.67 
 
 		 399 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  42.25 
 
 		 394 aa  307  2.0000000000000002e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  42.74 
 
 		 390 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  43.08 
 
 		 399 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  42.39 
 
 		 418 aa  306  3e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  43.23 
 
 		 396 aa  306  4.0000000000000004e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0858  acetylornithine aminotransferase  44.22 
 
 		 434 aa  305  9.000000000000001e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1986  acetylornithine aminotransferase  40.87 
 
 		 418 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2013  acetylornithine aminotransferase  40.87 
 
 		 418 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.152714 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2838  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.5 
 
 		 393 aa  304  2.0000000000000002e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0375409  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2028  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.85 
 
 		 399 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.832641  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3962  acetylornithine aminotransferase  40.9 
 
 		 386 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3277  acetylornithine aminotransferase  47.37 
 
 		 396 aa  301  1e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  42.44 
 
 		 396 aa  300  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2154  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.28 
 
 		 401 aa  300  3e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000952275  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.99 
 
 		 399 aa  300  4e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2872  acetylornithine aminotransferase  44.44 
 
 		 397 aa  299  5e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  41.49 
 
 		 398 aa  299  5e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.18 
 
 		 400 aa  299  6e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  40.4 
 
 		 400 aa  299  7e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  41.6 
 
 		 399 aa  298  1e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2649  acetylornithine aminotransferase  41.84 
 
 		 423 aa  298  1e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.46775  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1740  acetylornithine aminotransferase  44.47 
 
 		 414 aa  298  1e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212917 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5154  acetylornithine aminotransferase  40.2 
 
 		 426 aa  297  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000762221 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  41.82 
 
 		 397 aa  296  3e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1041  acetylornithine aminotransferase  41.27 
 
 		 398 aa  296  4e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0101251  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.42 
 
 		 395 aa  296  5e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  42.08 
 
 		 397 aa  296  5e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0395  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.18 
 
 		 413 aa  296  5e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.538676 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  42.6 
 
 		 385 aa  296  6e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4200  acetylornithine aminotransferase  40.11 
 
 		 386 aa  295  8e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1907  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.56 
 
 		 387 aa  295  1e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0119007  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3065  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.56 
 
 		 401 aa  295  1e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110355  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0009  acetylornithine transaminase protein  40.82 
 
 		 401 aa  294  2e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1218  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.59 
 
 		 402 aa  293  3e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.525687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3158  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.83 
 
 		 416 aa  293  3e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1499  acetylornithine aminotransferase  42.14 
 
 		 426 aa  293  3e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3730  acetylornithine aminotransferase  42.39 
 
 		 427 aa  293  4e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000174283  normal  0.451197 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>