More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2595 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2595  isochorismate synthase  100 
 
 
469 aa  959    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1345  isochorismate synthase  39.51 
 
 
467 aa  296  4e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09210  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  40.86 
 
 
476 aa  295  9e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.799478 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5284  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  40.6 
 
 
477 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283486  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0869  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  40.82 
 
 
476 aa  288  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3364  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  40.14 
 
 
476 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5003  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  40.14 
 
 
476 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0567  isochorismate synthase  39.35 
 
 
461 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0219  isochorismate synthase  38.99 
 
 
482 aa  281  1e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0140875  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0667  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  40.27 
 
 
481 aa  279  9e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.48283 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2800  isochorismate synthase  35.73 
 
 
460 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0871  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  39.73 
 
 
492 aa  269  7e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0781  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  39.5 
 
 
484 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2145  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  39.5 
 
 
484 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00728668  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4987  menaquinone-specific isochorismate synthase  35 
 
 
464 aa  264  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00107234  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4751  menaquinone-specific isochorismate synthase  34.35 
 
 
464 aa  263  4e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.424984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5112  menaquinone-specific isochorismate synthase  34.35 
 
 
464 aa  263  4e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00381916  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5016  menaquinone-specific isochorismate synthase  34.57 
 
 
464 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000376583  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1833  salicylate biosynthesis isochorismate synthase  43.42 
 
 
481 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.265148  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4589  menaquinone-specific isochorismate synthase  34.35 
 
 
464 aa  262  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000229188  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4611  menaquinone-specific isochorismate synthase  34.35 
 
 
464 aa  262  1e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4998  menaquinone-specific isochorismate synthase  34.35 
 
 
464 aa  262  1e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4969  menaquinone-specific isochorismate synthase  34.35 
 
 
464 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4698  isochorismate synthase  34.78 
 
 
464 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00246668  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0251  menaquinone-specific isochorismate synthase  34.35 
 
 
464 aa  259  8e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000139379  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3494  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.7 
 
 
464 aa  257  4e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0194086  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0814  isochorismate synthase  41.44 
 
 
451 aa  240  2.9999999999999997e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4216  isochorismate synthase  36.04 
 
 
486 aa  239  9e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.410479 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1487  isochorismate synthase  40 
 
 
445 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.674496  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3649  isochorismate synthase  39.66 
 
 
485 aa  232  1e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4072  isochorismate synthases  37.39 
 
 
498 aa  229  6e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.108156  unclonable  0.0000687043 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0026  isochorismate synthase  35.39 
 
 
455 aa  228  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2398  isochorismate synthase  38.94 
 
 
415 aa  224  4e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.000000000233134  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3578  isochorismate synthase  35.36 
 
 
483 aa  219  7.999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0501054  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1784  isochorismate synthase  38.72 
 
 
451 aa  217  4e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1413  isochorismate synthase  36.25 
 
 
407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36594  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1717  isochorismate synthase  36.69 
 
 
409 aa  212  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0041  isochorismate synthase  36.87 
 
 
452 aa  209  1e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124842  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1520  isochorismate synthase  32.6 
 
 
492 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1547  isochorismate synthase  32.6 
 
 
492 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  normal  0.556355 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3570  isochorismate synthase  37.46 
 
 
554 aa  205  1e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4752  isochorismate synthase  32.96 
 
 
473 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2632  menaquinone-specific isochorismate synthase  37.57 
 
 
471 aa  204  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2562  isochorismate synthase  44.57 
 
 
449 aa  204  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.208593 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5716  isochorismate synthase  33.68 
 
 
495 aa  202  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1919  isochorismate synthase  34.65 
 
 
451 aa  202  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1395  isochorismate synthase  37.46 
 
 
471 aa  201  3e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0751  isochorismate synthase  41.9 
 
 
384 aa  199  1.0000000000000001e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4053  hypothetical protein  37.43 
 
 
412 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5120  isochorismate synthase  34.27 
 
 
506 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0857744  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4451  isochorismate synthase  32.12 
 
 
452 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0130  menaquinone-specific isochorismate synthase, putative  32.93 
 
 
452 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.331361  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0581  isochorismate synthase  36.09 
 
 
466 aa  188  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0088  isochorismate synthase  31.69 
 
 
452 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4311  isochorismate synthase  31.46 
 
 
452 aa  187  4e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.240135  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14050  isochorismate synthase family protein  34.08 
 
 
418 aa  187  4e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4256  isochorismate synthase  31.46 
 
 
452 aa  187  4e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2977  isochorismate synthase  32.87 
 
 
490 aa  187  5e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21220  Isochorismate synthase  39.77 
 
 
403 aa  181  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12454  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4071  isochorismate synthases  31.63 
 
 
452 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.381607  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1877  isochorismate synthase  30.88 
 
 
475 aa  180  5.999999999999999e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3913  isochorismate synthases  34.09 
 
 
460 aa  179  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.348383  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0130  isochorismate synthase  33.89 
 
 
414 aa  178  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000366524  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2074  isochorismate synthase  29.96 
 
 
471 aa  177  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.49442  normal  0.464953 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3868  isochorismate synthases  31.54 
 
 
452 aa  177  3e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.172754  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1234  isochorismate synthase  30.97 
 
 
465 aa  177  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21430  isochorismate synthase family protein  36.17 
 
 
465 aa  177  5e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0130324  decreased coverage  0.00000737773 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0774  menaquinone-specific isochorismate synthase  36.82 
 
 
379 aa  176  7e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2188  isochorismate synthase  43.08 
 
 
467 aa  176  9e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.976142  normal  0.55094 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3873  isochorismate synthase  31.07 
 
 
452 aa  176  9e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.971486  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0093  isochorismate synthase  33.43 
 
 
452 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.229971  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4561  isochorismate synthase  42.58 
 
 
424 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4713  menaquinone-specific isochorismate synthase, putative  31.08 
 
 
452 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2897  isochorismate synthases  33.41 
 
 
473 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0157993  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1098  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.24 
 
 
440 aa  174  3.9999999999999995e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.994822  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3677  isochorismate synthase  31.87 
 
 
452 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1101  isochorismate synthase  30.66 
 
 
453 aa  173  5.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.293391  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4089  isochorismate synthase  34.17 
 
 
452 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1124  isochorismate synthase  30.66 
 
 
453 aa  173  5.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0744105  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0332  isochorismate synthase  30 
 
 
473 aa  171  3e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0246955  normal  0.0588972 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3961  isochorismate synthases  30.51 
 
 
452 aa  171  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.338247  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02521  isochorismate synthase  30.65 
 
 
466 aa  171  3e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1802  isochorismate synthase  40.61 
 
 
395 aa  170  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3421  isochorismate synthase  38.08 
 
 
402 aa  171  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00440407  normal  0.516304 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0970  isochorismate synthase  38.93 
 
 
425 aa  170  4e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01951  isochorismate synthase  32.79 
 
 
465 aa  169  7e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.109371  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6694  isochorismate synthase  33.43 
 
 
413 aa  167  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1545  isochorismate synthase  29.86 
 
 
466 aa  167  4e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1318  isochorismate synthase  32.08 
 
 
395 aa  166  9e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00818853  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2439  isochorismate synthase  33.52 
 
 
468 aa  165  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0302  vibriobactin-specific isochorismate synthase  31.2 
 
 
395 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01398  hypothetical protein  34.39 
 
 
406 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20870  isochorismate synthase family protein  38.15 
 
 
390 aa  164  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.483877  normal  0.0157067 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2120  isochorismate synthase  34.36 
 
 
475 aa  164  3e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0629  isochorismate synthase family protein  35.14 
 
 
456 aa  163  5.0000000000000005e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.940112  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1126  isochorismate synthases  32.02 
 
 
471 aa  163  5.0000000000000005e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2823  isochorismate synthase  31.82 
 
 
444 aa  163  6e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4515  isochorismate synthase  40 
 
 
401 aa  162  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.589784  normal  0.140007 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1701  isochorismate synthase  30.43 
 
 
482 aa  161  3e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004033  menaquinone-specific isochorismate synthase  33.71 
 
 
435 aa  160  6e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>