More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2557 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2557  phosphonates ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 262 aa  525  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.108995  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2249  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  96.18 
 
 		 262 aa  450  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.859646  normal  0.75616 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2888  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  79.84 
 
 		 263 aa  412  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.117638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20330  phosphonate ABC tranporter permease protein  80.88 
 
 		 264 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.293398  normal  0.582568 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1747  phosphonate ABC transporter permease PhnE  80.88 
 
 		 264 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.415612  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4569  phosphonate ABC transporter, permease protein  71.6 
 
 		 259 aa  368  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0307  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  71.6 
 
 		 259 aa  369  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.685305  normal  0.115805 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5616  phosphonate ABC transporter, permease protein  72.02 
 
 		 259 aa  363  2e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4344  phosphonate ABC transporter, permease protein  71.6 
 
 		 259 aa  361  7.0000000000000005e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4657  phosphonate ABC transporter, permease protein  71.6 
 
 		 259 aa  361  8e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3923  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  71.6 
 
 		 259 aa  361  8e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03975  phosphonate/organophosphate ester transporter  71.6 
 
 		 272 aa  360  1e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4605  phosphonate ABC transporter, permease protein  72.73 
 
 		 259 aa  358  4e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6089  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  68.8 
 
 		 270 aa  356  1.9999999999999998e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2914  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  65.46 
 
 		 269 aa  353  1e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263053  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2966  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  68.85 
 
 		 266 aa  349  3e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0827  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  67.89 
 
 		 267 aa  342  2.9999999999999997e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.152622  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0773  phosphonate ABC transporter permease  69.96 
 
 		 292 aa  336  1.9999999999999998e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.741951  normal  0.989098 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0837  ABC phosphonate transporter, inner membrane subunit PhnE  66.8 
 
 		 280 aa  334  7e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0879001 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4522  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  66.4 
 
 		 280 aa  334  9e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4179  phosphonate ABC transporter permease  69.58 
 
 		 288 aa  332  4e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4621  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  65.38 
 
 		 280 aa  330  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.438003 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0183  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  69.7 
 
 		 267 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685184  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3348  phosphonates ABC transporter, permease protein  64.96 
 
 		 271 aa  318  7e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3336  phosphonate ABC transporter, permease protein  64.96 
 
 		 271 aa  317  9e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3302  phosphonate ABC transporter, permease protein  64.96 
 
 		 271 aa  317  9e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314465  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2596  phosphonates ABC transporter, permease protein  64.53 
 
 		 271 aa  316  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2409  phosphonates ABC transporter, permease protein  64.53 
 
 		 271 aa  316  3e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0326  phosphonates ABC transporter, permease protein  64.53 
 
 		 271 aa  316  3e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1187  phosphonates ABC transporter, permease protein  64.53 
 
 		 271 aa  316  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3857  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  56.33 
 
 		 277 aa  293  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3906  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  56.33 
 
 		 277 aa  293  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.482347 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0261  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  55.02 
 
 		 271 aa  264  1e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0745614 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03936  hypothetical protein  69.77 
 
 		 205 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0394  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  53.23 
 
 		 679 aa  221  9e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.417915 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3257  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  45.22 
 
 		 272 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.814913  normal  0.191415 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3326  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  43.69 
 
 		 365 aa  194  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03935  hypothetical protein  75.41 
 
 		 122 aa  191  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3473  phosphonate ABC transporter permease  36.74 
 
 		 264 aa  175  8e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3748  phosphonate ABC transporter permease  36.74 
 
 		 264 aa  175  8e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3702  phosphonate ABC transporter, permease protein  36.74 
 
 		 264 aa  175  8e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000191718 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3390  phosphonate ABC transporter, permease  36.74 
 
 		 264 aa  174  9e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0936447  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0912  phosphate ABC transporter permease  38.7 
 
 		 275 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.166132  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3240  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.84 
 
 		 276 aa  172  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.655899  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3991  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.84 
 
 		 276 aa  172  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608155  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1319  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  41.47 
 
 		 287 aa  172  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.758207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4996  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  42.25 
 
 		 264 aa  171  9e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0396446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1280  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.44 
 
 		 276 aa  171  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.61484  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3744  phosphonate ABC transporter, permease protein  35.98 
 
 		 264 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000212765  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3439  phosphonate ABC transporter, permease  36.36 
 
 		 264 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3380  putative phosphonate transport system permease protein htxC phnE  40.71 
 
 		 273 aa  169  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.590376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1522  phosphonate ABC transporter, permease protein  34.6 
 
 		 264 aa  168  7e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0252842  normal  0.0146163 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3721  phosphonate ABC transporter, permease protein  39.73 
 
 		 264 aa  167  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.254444  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0177  phosphonate ABC transporter permease  39.39 
 
 		 264 aa  167  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000132377  normal  0.0614362 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2338  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.63 
 
 		 265 aa  167  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000033517  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1320  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  43.03 
 
 		 294 aa  167  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3793  phosphonate ABC transporter, permease protein  35.74 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.893389  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3371  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.55 
 
 		 264 aa  166  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0022523  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5875  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.86 
 
 		 277 aa  165  8e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2297  ABC phosphonate permease  40 
 
 		 268 aa  163  3e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0132  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.45 
 
 		 266 aa  163  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.734689  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2185  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  46.67 
 
 		 290 aa  163  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0127  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.45 
 
 		 266 aa  163  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3822  phosphonate ABC transporter permease  41.85 
 
 		 300 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.571251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1418  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.05 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1322  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  42.79 
 
 		 533 aa  158  6e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497345  normal  0.731542 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2298  ABC phosphonate permease  39.91 
 
 		 271 aa  158  8e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2284  phosphonate ABC transporter, permease protein  36.62 
 
 		 266 aa  157  1e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0852833  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0459  ABC type permease  43.52 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.110388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5856  putative PhnE protein, phosphonate ABC transporter, putative membrane protein  40.8 
 
 		 294 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4429  phosphonate ABC transporter permease  41.25 
 
 		 282 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0423  ABC type permease  43.52 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.436548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4151  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.33 
 
 		 274 aa  156  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2906  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40 
 
 		 511 aa  156  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00115761  normal  0.0544773 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2081  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  42.86 
 
 		 335 aa  155  6e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2287  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  33.91 
 
 		 274 aa  155  7e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1342  phosphonate ABC transporter permease  38.16 
 
 		 293 aa  155  7e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2875  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.16 
 
 		 293 aa  155  9e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6365  phosphonate ABC transporter, permease component  39.2 
 
 		 289 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0563067  normal  0.924702 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2796  phosphonate ABC transporter, permease protein  38.16 
 
 		 293 aa  154  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17510  Phosphonate transport systems inner membrane component  35.46 
 
 		 269 aa  154  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2680  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.62 
 
 		 298 aa  153  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000232167  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0367  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.5 
 
 		 272 aa  154  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3693  ABC phosphonate transporter inner membrane protein  42.93 
 
 		 335 aa  154  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0873  phosphonate ABC transporter inner membrane subunit  35.59 
 
 		 265 aa  152  7e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.122179 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4576  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.74 
 
 		 269 aa  151  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6356  phosphonate ABC transporter, permease protein  36.97 
 
 		 298 aa  151  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.690717  normal  0.762824 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0766  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  45.31 
 
 		 293 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.688417  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5855  putative PhnE protein, phosphonate ABC transporter, putative membrane protein  40.86 
 
 		 282 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0463216  normal  0.82281 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1413  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40.38 
 
 		 299 aa  150  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3823  phosphonate ABC transporter permease  45.54 
 
 		 282 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.378202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4086  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  43 
 
 		 293 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0261465  normal  0.0836049 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2918  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.58 
 
 		 294 aa  149  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4995  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.66 
 
 		 245 aa  149  5e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.250762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4203  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40.33 
 
 		 294 aa  149  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.852389  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2674  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.7 
 
 		 266 aa  148  9e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2993  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  34.7 
 
 		 266 aa  148  9e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3725  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  36.14 
 
 		 262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4430  phosphonate ABC transporter permease  44 
 
 		 293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4036  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.39 
 
 		 341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.311979  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>