More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2555 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2555  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
277 aa  558  1e-158  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.205375  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2247  ABC transporter  93.5 
 
 
277 aa  523  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20300  ATP-binding component of ABC phosphonate transporter  75.45 
 
 
278 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.540657  normal  0.410183 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1745  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  76.6 
 
 
278 aa  417  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.35608  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2890  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  76.53 
 
 
274 aa  410  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0336941  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0829  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  58.65 
 
 
280 aa  320  2e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5619  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  63.05 
 
 
262 aa  312  4e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03977  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  62.65 
 
 
262 aa  311  7e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03938  hypothetical protein  62.65 
 
 
262 aa  311  7e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4571  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  62.65 
 
 
262 aa  311  8e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3921  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  62.25 
 
 
262 aa  309  3e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4346  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  62.25 
 
 
262 aa  308  9e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4659  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  62.25 
 
 
262 aa  308  9e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2964  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  60.47 
 
 
296 aa  307  1e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.245669  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3886  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  62.25 
 
 
262 aa  306  2e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0309  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  62.25 
 
 
262 aa  306  3e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.053951 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0775  phosphonate ABC transporter ATP-binding  60.78 
 
 
309 aa  300  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.831408  normal  0.944742 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0185  phosphonate ABC transporter ATP-binding  60 
 
 
293 aa  296  2e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.655901  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4177  ATPase  59 
 
 
281 aa  295  8e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6091  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  57.65 
 
 
288 aa  293  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0393  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  59.06 
 
 
264 aa  291  1e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.385125 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4524  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  57.6 
 
 
307 aa  290  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2916  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  59.61 
 
 
284 aa  289  4e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.178582  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0839  ABC phophonates transporter, ATPase subunit PhnC  56.25 
 
 
301 aa  284  1e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0851593 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2593  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  56.8 
 
 
307 aa  277  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0323  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  56.8 
 
 
307 aa  277  1e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.558714  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2407  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  56.8 
 
 
307 aa  277  1e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1184  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  56.8 
 
 
307 aa  277  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3350  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  56.4 
 
 
307 aa  275  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4623  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  57.2 
 
 
269 aa  275  4e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.263735 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3304  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  54.2 
 
 
307 aa  275  4e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.296205  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3338  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  56.4 
 
 
307 aa  275  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3859  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  54.44 
 
 
267 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3908  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  54.44 
 
 
267 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.480865 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0259  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  53.91 
 
 
270 aa  263  2e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0745614 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2203  phosphonate ABC transporter ATPase subunit  46.25 
 
 
252 aa  211  8e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0130  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, ATPase component  44.72 
 
 
261 aa  206  2e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  1.63104e-05  hitchhiker  2.8065e-07 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3516  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  46.94 
 
 
261 aa  206  4e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6364  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  45.75 
 
 
275 aa  206  5e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0620834  normal  0.857375 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4431  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  45.06 
 
 
284 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.319208  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29130  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  49.57 
 
 
267 aa  202  4e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3324  ATPase  45.28 
 
 
275 aa  201  1e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0128  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  42.8 
 
 
257 aa  199  3e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0133  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  42.8 
 
 
257 aa  199  3e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6355  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  44.98 
 
 
264 aa  200  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.424299  normal  0.5531 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4117  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  44.44 
 
 
282 aa  199  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.914371  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0335  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, ATPase component  41.7 
 
 
246 aa  198  6e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4432  phosphonate ABC transporter ATP-binding  45.9 
 
 
271 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4960  phosphonate ABC transporter ATPase subunit  46.25 
 
 
269 aa  198  9e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1321  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  47.6 
 
 
271 aa  197  1e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1322  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  46.94 
 
 
269 aa  197  2e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233307  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4787  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  45.16 
 
 
272 aa  196  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.334656  normal  0.0646281 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4668  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  42.54 
 
 
300 aa  196  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.621423  decreased coverage  0.000827837 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0928  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.8 
 
 
256 aa  196  3e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00101449  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0181  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  43.08 
 
 
252 aa  196  4e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3820  phosphonate ABC transporter ATP-binding  45.78 
 
 
270 aa  195  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.693168  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3862  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  46.12 
 
 
282 aa  195  7e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4994  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  43.36 
 
 
260 aa  195  8e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463894  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2285  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  41.6 
 
 
257 aa  194  1e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  7.78372e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2299  ABC phosphate/phosphonate transport system ATPase  46.15 
 
 
259 aa  194  1e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3709  phosphonate ABC transporter ATP-binding  43.87 
 
 
272 aa  193  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.144608 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5858  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  44.76 
 
 
269 aa  193  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289421  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4084  phosphonate ABC transporter ATP-binding  44.11 
 
 
274 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.620388  normal  0.0392209 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3865  phosphonate ABC transporter ATP-binding  43.87 
 
 
272 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0768  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  43.65 
 
 
270 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1594  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  44.31 
 
 
261 aa  192  6e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0278  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  44.76 
 
 
279 aa  191  8e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0225  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  45.32 
 
 
310 aa  191  1e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3474  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  42.34 
 
 
257 aa  189  4e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3703  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  42.34 
 
 
257 aa  189  4e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5251e-14 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2920  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  46.94 
 
 
272 aa  189  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3749  phosphonate ABC transporter ATP-binding  42.34 
 
 
257 aa  189  4e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2156  phosphonate ABC transporter ATP-binding  47.28 
 
 
253 aa  189  5e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.440278 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1449  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  42.4 
 
 
254 aa  189  5e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00372903  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3440  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  41.7 
 
 
257 aa  189  6e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3372  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  42.11 
 
 
257 aa  187  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014777  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3745  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  41.94 
 
 
257 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000397952  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2339  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  40.96 
 
 
257 aa  187  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  3.37848e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3391  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  41.94 
 
 
257 aa  187  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.193005  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5876  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  46.18 
 
 
267 aa  187  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4575  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  42.91 
 
 
281 aa  186  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0857  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  40.87 
 
 
264 aa  186  3e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0840663  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1927  phosphonate ABC transporter ATP-binding  41.18 
 
 
287 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.75646  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3722  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  41.53 
 
 
257 aa  186  4e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.156195  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4201  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  45.49 
 
 
273 aa  185  6e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.171703  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2187  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  43.13 
 
 
275 aa  185  6e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2286  ABC transporter related  42.35 
 
 
266 aa  184  2e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4152  ABC transporter related  42.35 
 
 
266 aa  184  2e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0894  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  42.13 
 
 
275 aa  182  6e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.658454  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl572  phosphonate ABC transporter ATP-binding component  38.4 
 
 
249 aa  182  7e-45  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3264  hypothetical protein  43.08 
 
 
273 aa  182  7e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.634787 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1097  ATPase  43.36 
 
 
254 aa  181  8e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1521  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  42.79 
 
 
248 aa  181  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115947  normal  0.0212059 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2409  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  44.62 
 
 
292 aa  181  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3963  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  41.54 
 
 
284 aa  180  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.704771 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3381  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  46.72 
 
 
232 aa  176  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2905  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  46.8 
 
 
273 aa  176  5e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.217934  normal  0.0141495 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1345  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  39.92 
 
 
278 aa  174  2e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0502345 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2799  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  39.92 
 
 
278 aa  174  2e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2878  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  39.92 
 
 
278 aa  174  2e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>