164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2544 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3732  hypothetical protein  66.73 
 
 
493 aa  733  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1197  hypothetical protein  66.26 
 
 
493 aa  724  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.73618  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3614  hypothetical protein  84.11 
 
 
491 aa  895  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.227382  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0314  hypothetical protein  66.24 
 
 
493 aa  700  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0869  hypothetical protein  63.64 
 
 
508 aa  664  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05862  hypothetical protein  66.81 
 
 
491 aa  711  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0237  hypothetical protein  61.81 
 
 
491 aa  657  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0279  hypothetical protein  63.93 
 
 
492 aa  678  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0239  hypothetical protein  61.81 
 
 
491 aa  657  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2126  hypothetical protein  63.29 
 
 
496 aa  678  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0030  hypothetical protein  68.28 
 
 
492 aa  734  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.599961  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0605  hypothetical protein  63.49 
 
 
508 aa  670  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43030  hypothetical protein  85.74 
 
 
491 aa  907  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.182663 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0716  hypothetical protein  63.49 
 
 
508 aa  670  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0091  hypothetical protein  84.08 
 
 
492 aa  894  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2026  hypothetical protein  63.49 
 
 
499 aa  671  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.383781  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1673  hypothetical protein  63.49 
 
 
508 aa  670  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393568  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0046  hypothetical protein  67.58 
 
 
492 aa  706  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2124  hypothetical protein  63.49 
 
 
499 aa  671  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5594  hypothetical protein  84.73 
 
 
491 aa  901  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1123  putative type VI secretion protein VasR  73.73 
 
 
491 aa  775  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34753  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3904  hypothetical protein  66.24 
 
 
493 aa  700  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1229  hypothetical protein  59.59 
 
 
490 aa  649  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.159101 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1110  type VI secretion protein, EvpB/family  59.39 
 
 
490 aa  649  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2806  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  65.4 
 
 
492 aa  701  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2528  EvpB family type VI secretion protein  63.34 
 
 
491 aa  711  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3254  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  65.19 
 
 
492 aa  697  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5432  hypothetical protein  84.29 
 
 
492 aa  895  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.682692  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2544  hypothetical protein  100 
 
 
491 aa  1024  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00544949  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1071  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  64.26 
 
 
492 aa  700  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0534  hypothetical protein  63.49 
 
 
760 aa  672  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.897456  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3173  hypothetical protein  65.4 
 
 
494 aa  676  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2623  hypothetical protein  63.71 
 
 
496 aa  680  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0743  hypothetical protein  63.49 
 
 
499 aa  671  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0585282  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3225  EvpB family type VI secretion protein  61.76 
 
 
496 aa  679  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0387  EvpB family type VI secretion protein  66.24 
 
 
493 aa  700  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000440  uncharacterized protein ImpC  67.44 
 
 
491 aa  717  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.338672  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1182  EvpB family type VI secretion protein  55.91 
 
 
482 aa  608  1e-173  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0012  hypothetical protein  54.39 
 
 
482 aa  560  1e-158  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2815  hypothetical protein  46.24 
 
 
513 aa  438  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0624  hypothetical protein  44.52 
 
 
525 aa  434  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0350498 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2915  hypothetical protein  44.12 
 
 
535 aa  429  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.376798 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1784  hypothetical protein  43.38 
 
 
515 aa  430  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.170054  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0778  hypothetical protein  43.46 
 
 
517 aa  422  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3650  EvpB family type VI secretion protein  43.67 
 
 
516 aa  416  1e-115  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.453281 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0799  EvpB family type VI secretion protein  43.24 
 
 
514 aa  418  1e-115  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.380485  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2510  hypothetical protein  42.79 
 
 
516 aa  416  1e-115  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0727  hypothetical protein  42.79 
 
 
516 aa  416  1e-115  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5265  hypothetical protein  45.96 
 
 
515 aa  416  1e-115  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0175  hypothetical protein  42.79 
 
 
512 aa  411  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.653266  hitchhiker  1.00045e-06 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3260  EvpB family type VI secretion protein  42.36 
 
 
512 aa  408  1e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.177977  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3124  hypothetical protein  41.9 
 
 
512 aa  408  1e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0160  hypothetical protein  46.88 
 
 
504 aa  400  1e-110  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.586065  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3042  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  41.14 
 
 
495 aa  386  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02046  EvpB  41.51 
 
 
498 aa  382  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.422176  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1208  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  40.72 
 
 
495 aa  382  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2269  hypothetical protein  40.59 
 
 
499 aa  375  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256541  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2176  hypothetical protein  40.04 
 
 
494 aa  372  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.22545e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2765  EvpB family type VI secretion protein  41.6 
 
 
500 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0505652  normal  0.262675 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1606  hypothetical protein  43.62 
 
 
499 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.128756  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1480  EvpB family type VI secretion protein  42.92 
 
 
500 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2872  hypothetical protein  42.92 
 
 
500 aa  370  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0134  hypothetical protein  43.62 
 
 
499 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.831371  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3004  hypothetical protein  41.13 
 
 
501 aa  370  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0158  hypothetical protein  43.62 
 
 
499 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2460  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  40.82 
 
 
499 aa  369  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1368  hypothetical protein  42.92 
 
 
500 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0122  hypothetical protein  43.62 
 
 
499 aa  371  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4954  hypothetical protein  41.18 
 
 
500 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2509  EvpB family type VI secretion protein  41.18 
 
 
500 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0777489  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3560  hypothetical protein  40.33 
 
 
496 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00109925  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0382  hypothetical protein  40.53 
 
 
496 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000637648  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2623  hypothetical protein  41.39 
 
 
500 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2929  EvpB family type VI secretion protein  40.73 
 
 
496 aa  368  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0212184  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3659  hypothetical protein  39.43 
 
 
496 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.233212  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0468  hypothetical protein  40.53 
 
 
496 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  2.82714e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26660  hypothetical protein  42.33 
 
 
500 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.930343  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2638  hypothetical protein  40.53 
 
 
496 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000879955  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3643  hypothetical protein  39.43 
 
 
496 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.012047  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3634  hypothetical protein  39.43 
 
 
496 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0294891  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3099  hypothetical protein  41.39 
 
 
500 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0403  EvpB family type VI secretion protein  40.53 
 
 
496 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  5.70497e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4090  EvpB family type VI secretion protein  41.63 
 
 
498 aa  367  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.005e-08 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0446  EvpB family type VI secretion protein  40.53 
 
 
496 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0234232  normal  0.56571 
 
 
-
 
NC_003296  RS01964  hypothetical protein  40.97 
 
 
496 aa  365  1e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.470165  normal  0.307347 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1477  hypothetical protein  42.79 
 
 
499 aa  365  1e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.640314  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2963  hypothetical protein  39.43 
 
 
496 aa  364  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6113  EvpB family type VI secretion protein  41.82 
 
 
497 aa  364  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.32673 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3851  EvpB family type VI secretion protein  42.56 
 
 
497 aa  364  2e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538189  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2094  putative cytoplasmic protein  41.3 
 
 
497 aa  363  4e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3908  EvpB family type VI secretion protein  41.59 
 
 
497 aa  361  2e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.38023 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2323  hypothetical protein  38.31 
 
 
498 aa  361  2e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0970803  normal  0.0167765 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0981  hypothetical protein  41.59 
 
 
497 aa  360  3e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0259  hypothetical protein  41.21 
 
 
502 aa  360  3e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1682  type VI secretion protein, EvpB/VC_A0108 family  40.23 
 
 
497 aa  360  4e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.509952  normal  0.0159997 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2895  hypothetical protein  40.9 
 
 
494 aa  360  4e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34050  hypothetical protein  40.9 
 
 
494 aa  359  5e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.27646  normal  0.0910485 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1587  hypothetical protein  41 
 
 
502 aa  358  2e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.261509  normal  0.190607 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2959  hypothetical protein  41 
 
 
502 aa  357  3e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1784  hypothetical protein  41 
 
 
502 aa  357  3e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>