More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2519 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2519  oxidoreductase, FAD-binding protein  100 
 
 		 394 aa  789    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105812  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  89.59 
 
 		 394 aa  691    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  76.02 
 
 		 378 aa  561  1e-158  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  61.3 
 
 		 385 aa  473  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  65.38 
 
 		 377 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  64.77 
 
 		 376 aa  452  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0753  FAD dependent oxidoreductase  62.67 
 
 		 384 aa  411  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  56.91 
 
 		 380 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  53.74 
 
 		 383 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  53.74 
 
 		 383 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4426  FAD dependent oxidoreductase  55.43 
 
 		 375 aa  363  4e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.767277 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  51.34 
 
 		 383 aa  352  7e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0746  putative oxidoreductase  55.16 
 
 		 375 aa  350  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3536  FAD dependent oxidoreductase  56.52 
 
 		 382 aa  347  3e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5371  FAD dependent oxidoreductase  55.73 
 
 		 382 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4434  FAD dependent oxidoreductase  52.02 
 
 		 378 aa  339  5.9999999999999996e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862237  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  44.8 
 
 		 376 aa  298  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  46.54 
 
 		 389 aa  296  5e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  43.04 
 
 		 394 aa  295  1e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5063  FAD dependent oxidoreductase  54.05 
 
 		 383 aa  294  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.200843 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6585  FAD dependent oxidoreductase  46.81 
 
 		 389 aa  293  4e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  45.97 
 
 		 378 aa  293  5e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  44.24 
 
 		 389 aa  281  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  43.94 
 
 		 391 aa  271  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  44.09 
 
 		 394 aa  264  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  44.2 
 
 		 384 aa  256  4e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  43.67 
 
 		 389 aa  251  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  37.03 
 
 		 385 aa  231  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  36.8 
 
 		 388 aa  222  7e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  36.6 
 
 		 393 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1830  SoxB protein  35.29 
 
 		 377 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.260331 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  34.95 
 
 		 390 aa  209  6e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  33.69 
 
 		 390 aa  204  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  34.6 
 
 		 386 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  31.69 
 
 		 374 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  28.91 
 
 		 390 aa  175  9.999999999999999e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  31.42 
 
 		 376 aa  169  6e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  27.17 
 
 		 373 aa  160  4e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4894  FAD dependent oxidoreductase  32.97 
 
 		 397 aa  145  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  28.26 
 
 		 382 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  28.72 
 
 		 396 aa  142  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  30.59 
 
 		 960 aa  138  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  29.43 
 
 		 387 aa  136  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  24.8 
 
 		 382 aa  134  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4659  FAD dependent oxidoreductase  29.57 
 
 		 444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  29.57 
 
 		 444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1362  FAD-dependent oxidoreductase  29.13 
 
 		 442 aa  131  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1294  hypothetical protein  29.13 
 
 		 442 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2539  agaE protein  29.13 
 
 		 442 aa  131  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5640  FAD dependent oxidoreductase  29.57 
 
 		 444 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738738  normal  0.548415 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1284  FAD-dependent oxidoreductase  29.13 
 
 		 442 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0543  hypothetical protein  29.13 
 
 		 442 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1023  FAD-dependent oxidoreductase  29.13 
 
 		 442 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0272  hypothetical protein  29.13 
 
 		 442 aa  131  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655938  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  27.42 
 
 		 984 aa  129  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0928  FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 		 383 aa  129  9.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  31.44 
 
 		 392 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 		 983 aa  127  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  29.84 
 
 		 492 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 381 aa  127  3e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  30.25 
 
 		 500 aa  127  5e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  30.42 
 
 		 496 aa  126  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  30.25 
 
 		 500 aa  127  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4833  FAD dependent oxidoreductase  29.05 
 
 		 385 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.866256 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4505  FAD dependent oxidoreductase  28.92 
 
 		 444 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2371  FAD dependent oxidoreductase  32.63 
 
 		 377 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3532  FAD dependent oxidoreductase  30.03 
 
 		 392 aa  124  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  27.72 
 
 		 383 aa  124  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  29.66 
 
 		 816 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1548  FAD dependent oxidoreductase  26.12 
 
 		 441 aa  122  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.746039 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4047  FAD dependent oxidoreductase  28.67 
 
 		 455 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.812767 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  27.79 
 
 		 394 aa  119  7e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  29.29 
 
 		 816 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 428 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  27.68 
 
 		 439 aa  118  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  30.99 
 
 		 823 aa  117  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1161  FAD dependent oxidoreductase  28.19 
 
 		 444 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.309102 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  27.89 
 
 		 395 aa  117  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4107  FAD dependent oxidoreductase  29.26 
 
 		 393 aa  116  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0968917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1461  putative lipoprotein  27.43 
 
 		 436 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3866  FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 		 843 aa  113  5e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6616  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 		 389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6383  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 		 389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  28.91 
 
 		 385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  26.73 
 
 		 460 aa  112  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6214  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 389 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2740  FAD dependent oxidoreductase  28.94 
 
 		 401 aa  111  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0112073  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  28.07 
 
 		 385 aa  111  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  27.75 
 
 		 394 aa  111  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31600  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  28.76 
 
 		 389 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  26.22 
 
 		 395 aa  109  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3761  FAD dependent oxidoreductase  27.05 
 
 		 431 aa  109  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  28.46 
 
 		 385 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6548  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 374 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490591  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 		 385 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1879  FAD dependent oxidoreductase  31.74 
 
 		 447 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  25.98 
 
 		 394 aa  107  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4416  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 378 aa  107  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.426575  normal  0.912547 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  24.86 
 
 		 385 aa  107  5e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0236  AgaE protein  31.3 
 
 		 447 aa  106  6e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>