More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2479 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2479  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  558  1e-158  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2245  hypothetical protein  91.64 
 
 		 289 aa  511  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0596147  normal  0.358585 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  66.79 
 
 		 292 aa  386  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  43.06 
 
 		 274 aa  167  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3956  putative signal transduction protein  38.84 
 
 		 274 aa  165  8e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0283  putative signal transduction protein  41.31 
 
 		 277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3758  putative signal transduction protein  38.39 
 
 		 274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3831  putative signal transduction protein  38.39 
 
 		 274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4563  hypothetical protein  39.25 
 
 		 274 aa  159  4e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3580  putative signal transduction protein  39.42 
 
 		 275 aa  156  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0283701  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4280  putative signal transduction protein  37.85 
 
 		 274 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0660971 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4147  putative signal transduction protein  37.85 
 
 		 274 aa  153  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0187  putative signal transduction protein  37.85 
 
 		 274 aa  153  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  37.85 
 
 		 274 aa  152  7e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3501  hypothetical protein  42.16 
 
 		 274 aa  149  4e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000151947  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0532  hypothetical protein  34.54 
 
 		 274 aa  136  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0100  hypothetical protein  34.48 
 
 		 290 aa  135  7.000000000000001e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0254877  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  33.04 
 
 		 280 aa  122  8e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3755  putative signal transduction protein  32.24 
 
 		 275 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.904282  normal  0.117296 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2482  putative signal transduction protein  33.63 
 
 		 292 aa  117  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0087  hypothetical protein  31.78 
 
 		 275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000976689 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  27.92 
 
 		 298 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  32.56 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  34.88 
 
 		 286 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  28.15 
 
 		 299 aa  112  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  27.73 
 
 		 299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1469  putative signal transduction protein  37.3 
 
 		 258 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  27.15 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  32.04 
 
 		 291 aa  106  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  30.4 
 
 		 297 aa  106  4e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  30.15 
 
 		 369 aa  105  6e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  31.53 
 
 		 281 aa  103  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  29.91 
 
 		 279 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  27.27 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  26.27 
 
 		 300 aa  102  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  29.36 
 
 		 280 aa  102  9e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  30.04 
 
 		 289 aa  101  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  28.46 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  27.27 
 
 		 297 aa  101  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  28.7 
 
 		 297 aa  101  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0156  metal dependent phosphohydrolase  31.82 
 
 		 412 aa  100  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.494474  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  26.38 
 
 		 279 aa  99.4  5e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  29.69 
 
 		 283 aa  97.4  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3356  putative signal transduction protein  31.91 
 
 		 276 aa  97.4  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000102808  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  29.69 
 
 		 283 aa  97.8  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1135  metal dependent phosphohydrolase  33.02 
 
 		 340 aa  97.1  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  29.06 
 
 		 353 aa  96.7  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1996  putative signal transduction protein  29.59 
 
 		 274 aa  96.7  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.490329  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1708  putative signal transduction protein  29.59 
 
 		 274 aa  96.7  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.538449  normal  0.498965 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  25.89 
 
 		 303 aa  96.3  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  29.21 
 
 		 297 aa  95.9  6e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  31.63 
 
 		 378 aa  95.5  7e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  29.96 
 
 		 544 aa  95.5  7e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2448  HDIG domain-containing protein  30.86 
 
 		 287 aa  95.5  9e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  28.76 
 
 		 287 aa  94.7  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1043  putative signal transduction protein  30.43 
 
 		 288 aa  94.4  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3649  hypothetical protein  30.31 
 
 		 283 aa  93.6  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1965  putative signal transduction protein  33.18 
 
 		 399 aa  93.2  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.543809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2716  putative signal transduction protein  30.24 
 
 		 302 aa  92.8  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.484408  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  26.91 
 
 		 282 aa  92  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  30.15 
 
 		 284 aa  91.3  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1690  putative signal transduction protein  25.23 
 
 		 305 aa  91.3  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1787  HDIG  28.57 
 
 		 279 aa  90.9  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  28.5 
 
 		 304 aa  90.1  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  25.38 
 
 		 285 aa  90.5  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  27.78 
 
 		 730 aa  89.4  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 		 291 aa  89  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4198  putative signal transduction protein  29.13 
 
 		 288 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2207  putative signal transduction protein  28.64 
 
 		 281 aa  89  9e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00317318  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0742  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 		 427 aa  88.6  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  27.78 
 
 		 291 aa  87.4  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2233  putative signal transduction protein  27.49 
 
 		 456 aa  87.8  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  28.71 
 
 		 397 aa  87.4  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  28.38 
 
 		 425 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1367  putative signal transduction protein  29.27 
 
 		 288 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.276404  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2586  putative signal transduction protein  28.86 
 
 		 288 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0168081  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  26.84 
 
 		 289 aa  86.3  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1703  putative signal transduction protein  28.57 
 
 		 326 aa  85.9  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151129 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  30.39 
 
 		 352 aa  85.9  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2490  metal dependent phosphohydrolase  28.81 
 
 		 288 aa  85.9  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.115948  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1270  metal dependent phosphohydrolase  26.5 
 
 		 279 aa  85.9  7e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2652  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  28.11 
 
 		 412 aa  85.5  8e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  25.42 
 
 		 351 aa  85.5  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1670  putative signal transduction protein  26.56 
 
 		 297 aa  85.5  8e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1044  signal transduction protein  28.95 
 
 		 299 aa  85.5  9e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02425  putative signal transduction protein  28.29 
 
 		 281 aa  85.1  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.885003  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0674  hypothetical protein  31.58 
 
 		 284 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0339  putative signal transduction protein  31.31 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5000  putative signal transduction protein  30.81 
 
 		 290 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.415832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3373  diguanylate cyclase  25.21 
 
 		 505 aa  84.7  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  28.43 
 
 		 284 aa  84  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0944  metal dependent phosphohydrolase  28.08 
 
 		 284 aa  84  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2435  putative signal transduction protein  28.71 
 
 		 438 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  27.94 
 
 		 282 aa  84  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2349  metal dependent phosphohydrolase  33.64 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.382123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3420  putative signal transduction protein  32.02 
 
 		 275 aa  83.2  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5176  putative signal transduction protein  30.81 
 
 		 290 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1400  putative signal transduction protein  31.16 
 
 		 373 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0393  metal dependent phosphohydrolase  23.36 
 
 		 283 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2422  cyclic nucleotide-binding protein  35.61 
 
 		 430 aa  82.4  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>