192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2464 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2464  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  100 
 
 		 434 aa  866    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413329  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2230  Mn2+/Fe2+ transporter  94.7 
 
 		 433 aa  826    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.446003 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0233  Mn2+/Fe2+ transporter  85.45 
 
 		 435 aa  758    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2571  putative metal ion transport protein  26.62 
 
 		 415 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.662179  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01790  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  28.31 
 
 		 446 aa  124  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0297  natural resistance-associated macrophage protein  28.43 
 
 		 427 aa  123  6e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17030  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  27.23 
 
 		 429 aa  120  6e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.400291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3378  natural resistance-associated macrophage protein  23.44 
 
 		 439 aa  101  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6352  natural resistance-associated macrophage protein  25.47 
 
 		 419 aa  97.8  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1273  manganese transporter NRAMP  24.46 
 
 		 428 aa  96.3  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.387362 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39040  hypothetical protein  26.27 
 
 		 433 aa  93.2  8e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1593  natural resistance-associated macrophage protein  25.43 
 
 		 412 aa  92  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1689  natural resistance-associated macrophage protein  24.68 
 
 		 401 aa  90.5  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.973606  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2040  natural resistance-associated macrophage protein  27.09 
 
 		 432 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000137009  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3567  natural resistance-associated macrophage protein  26.43 
 
 		 401 aa  84  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08916  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family protein  22.01 
 
 		 403 aa  79  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3815  natural resistance-associated macrophage protein  23.19 
 
 		 408 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01940  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  23.95 
 
 		 415 aa  78.6  0.0000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.612589 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3408  natural resistance-associated macrophage protein  25.71 
 
 		 397 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.913071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1739  natural resistance-associated macrophage protein  26.55 
 
 		 418 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2339  natural resistance-associated macrophage protein  25.12 
 
 		 432 aa  76.6  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1755  natural resistance-associated macrophage protein  25.08 
 
 		 404 aa  76.3  0.0000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1157  natural resistance-associated macrophage protein  24.33 
 
 		 432 aa  75.9  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2655  manganese transporter NRAMP  26.51 
 
 		 415 aa  74.3  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0308  metal ion transporter, nramp family protein  24.68 
 
 		 448 aa  73.9  0.000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3239  natural resistance-associated macrophage protein  26.3 
 
 		 408 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0068  natural resistance-associated macrophage protein  26 
 
 		 452 aa  73.2  0.000000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0379  natural resistance-associated macrophage protein  26.09 
 
 		 441 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0915646 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0657  natural resistance-associated macrophage protein  24.34 
 
 		 415 aa  71.2  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000666945  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2251  natural resistance-associated macrophage protein  24.84 
 
 		 427 aa  71.2  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000998148  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1144  natural resistance-associated macrophage protein  25.51 
 
 		 406 aa  67.8  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.131374  normal  0.181979 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1894  natural resistance-associated macrophage protein  22.19 
 
 		 414 aa  68.2  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0465  natural resistance-associated macrophage protein  22.43 
 
 		 414 aa  67  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.169893  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1463  manganese transport protein MntH  23.88 
 
 		 432 aa  67  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0201328  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1960  manganese transport protein MntH  23.18 
 
 		 431 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.763494  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0168  natural resistance-associated macrophage protein  23.48 
 
 		 416 aa  66.6  0.0000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.988448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1988  manganese transport protein MntH  23.88 
 
 		 431 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.40777  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1874  manganese transport protein MntH  23.88 
 
 		 431 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.558588  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3470  manganese transport protein MntH  24.22 
 
 		 431 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00427839  hitchhiker  0.000000000922874 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0796  manganese transport protein MntH  21.75 
 
 		 434 aa  64.3  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00765423  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3647  natural resistance-associated macrophage protein  22.84 
 
 		 418 aa  63.9  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.438351  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4561  manganese transport protein MntH  21.87 
 
 		 438 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3802  manganese transport protein MntH  21.87 
 
 		 438 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3722  manganese transport protein MntH  21.87 
 
 		 438 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143868  normal  0.171771 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4677  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  23.17 
 
 		 450 aa  61.6  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4171  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  24.48 
 
 		 433 aa  60.8  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.248736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1735  manganese transport protein MntH  22.92 
 
 		 431 aa  60.8  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1743  manganese transport protein MntH  24.03 
 
 		 431 aa  60.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2294  manganese transport protein MntH  22.09 
 
 		 438 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1880  manganese transport protein MntH  24.03 
 
 		 431 aa  60.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0729  manganese transporter NRAMP  25.64 
 
 		 444 aa  60.8  0.00000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2017  natural resistance-associated macrophage protein  26.3 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2933  natural resistance-associated macrophage protein  22.91 
 
 		 453 aa  60.1  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1353  natural resistance-associated macrophage protein  24.49 
 
 		 455 aa  59.3  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.573768  normal  0.0815096 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3643  natural resistance-associated macrophage protein  23.09 
 
 		 412 aa  59.7  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.145249  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0224  natural resistance-associated macrophage protein  25.68 
 
 		 402 aa  58.9  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1693  manganese transport protein MntH  23.61 
 
 		 431 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1915  manganese transport protein MntH  23.71 
 
 		 431 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228636 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1583  natural resistance-associated macrophage protein  22.73 
 
 		 417 aa  58.9  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0932  Mn2+/Fe2+ transporter  25.41 
 
 		 622 aa  58.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0449  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  27.62 
 
 		 418 aa  58.9  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4935  manganese transport protein MntH  22.78 
 
 		 438 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.586063 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0858  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  25.9 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.929447  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0654  manganese transport protein MntH  24.81 
 
 		 421 aa  57.8  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0327142  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1718  manganese transport protein MntH  23.58 
 
 		 431 aa  57.4  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1165  manganese transport protein MntH  22.81 
 
 		 450 aa  57.4  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000527226  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1187  manganese transport protein MntH  22.81 
 
 		 450 aa  57.4  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000302407  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3704  manganese transport protein MntH  21.87 
 
 		 438 aa  57  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.33277 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0860  manganese transport protein MntH  22.25 
 
 		 437 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1384  manganese transport protein MntH  22.25 
 
 		 437 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0492  manganese transport protein MntH  22.25 
 
 		 437 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0665  manganese transport protein MntH  22.25 
 
 		 437 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.465799  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0541  Mn2+/Fe2+ transporter  26 
 
 		 457 aa  57  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1807  natural resistance-associated macrophage protein  24.29 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1781  manganese transport protein MntH  22.25 
 
 		 437 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.298832  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01595  putative manganese/divalent cation transport protein (NRAMP family)  22.61 
 
 		 398 aa  56.6  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3404  hypothetical protein  21.64 
 
 		 508 aa  56.2  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0106  natural resistance-associated macrophage protein  25.63 
 
 		 421 aa  55.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0735  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  20.45 
 
 		 432 aa  55.5  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0999  NRAMP family Mn2+ and Fe2+ transporter  23.39 
 
 		 455 aa  55.1  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.157414  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2183  manganese transporter NRAMP  23.33 
 
 		 326 aa  55.1  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0049052  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6585  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  24.68 
 
 		 625 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0105  metal ion transporter, NRAMP family  25.63 
 
 		 421 aa  55.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.746407  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1397  manganese transport protein MntH  25.39 
 
 		 429 aa  54.7  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665917  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1916  Mn2+/Fe2+ transporter  23.3 
 
 		 434 aa  54.7  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0325807  decreased coverage  0.000000836565 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0075  natural resistance-associated macrophage protein  25.36 
 
 		 438 aa  54.3  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.289103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3546  manganese transporter NRAMP  23.4 
 
 		 453 aa  54.7  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0787063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0230  manganese transport protein MntH  22.36 
 
 		 426 aa  54.3  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1556  manganese/divalent cation transport protein  21.87 
 
 		 439 aa  53.9  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.123302 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0692  manganese transport protein MntH  24.46 
 
 		 453 aa  53.9  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5787  Mn2+/Fe2+ transporter  24 
 
 		 456 aa  53.5  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.521551  hitchhiker  0.00775993 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1583  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  23.64 
 
 		 439 aa  53.1  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0745  Mn2+/Fe2+ transporter  25.11 
 
 		 446 aa  52.8  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.429153  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4410  natural resistance-associated macrophage protein  22.8 
 
 		 435 aa  52.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4366  manganese transporter NRAMP  23.69 
 
 		 408 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4453  Mn2+/Fe2+ transporter  23.69 
 
 		 408 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0420753  normal  0.0620923 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6795  natural resistance-associated macrophage protein  22.63 
 
 		 438 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2881  manganese transporter NRAMP  27.12 
 
 		 468 aa  52  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0516057  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0640  Mn2+/Fe2+ transporter  23.92 
 
 		 411 aa  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.122692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4747  Mn2+/Fe2+ transporter  23.69 
 
 		 408 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.444953  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>