More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2435 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2435  oxidoreductase, FAD-binding, putative  100 
 
 		 471 aa  968    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0684957  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  33.26 
 
 		 479 aa  240  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  32.75 
 
 		 479 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.26 
 
 		 479 aa  233  5e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.02 
 
 		 461 aa  222  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  30.26 
 
 		 461 aa  218  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  31.8 
 
 		 461 aa  215  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  30.07 
 
 		 474 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  32.75 
 
 		 462 aa  211  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.92 
 
 		 464 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  30.55 
 
 		 463 aa  209  7e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  30.15 
 
 		 479 aa  209  9e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  31.67 
 
 		 462 aa  201  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  32.32 
 
 		 499 aa  198  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.64 
 
 		 472 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  31.85 
 
 		 461 aa  194  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  29.61 
 
 		 459 aa  189  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  31.72 
 
 		 478 aa  189  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  29.96 
 
 		 473 aa  189  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  30.16 
 
 		 463 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.32 
 
 		 461 aa  187  3e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2408  FAD linked oxidase domain protein  32.46 
 
 		 469 aa  187  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359898  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04780  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  32.76 
 
 		 469 aa  186  8e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.62663  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  29.61 
 
 		 458 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  29.52 
 
 		 456 aa  181  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  31.14 
 
 		 465 aa  177  4e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1804  FAD linked oxidase-like  30.74 
 
 		 473 aa  177  5e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  29.89 
 
 		 473 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3463  FAD linked oxidase domain protein  31.03 
 
 		 465 aa  174  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1407  FAD linked oxidase-like  31.29 
 
 		 460 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  31.28 
 
 		 465 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.88 
 
 		 478 aa  161  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4023  FAD linked oxidase domain protein  28.2 
 
 		 602 aa  161  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11743  oxidoreductase  32.28 
 
 		 461 aa  159  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0117669  normal  0.752588 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1637  FAD linked oxidase, N-terminal  29.69 
 
 		 461 aa  154  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1926  FAD linked oxidase domain protein  29.01 
 
 		 476 aa  154  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  26.75 
 
 		 705 aa  152  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  26.68 
 
 		 468 aa  150  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1030  FAD linked oxidase domain protein  28.26 
 
 		 477 aa  146  8.000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.64 
 
 		 444 aa  146  9e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4138  FAD linked oxidase domain protein  28.82 
 
 		 470 aa  144  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4534  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.42 
 
 		 490 aa  143  6e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.021743 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.46 
 
 		 465 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4415  FAD linked oxidase, N-terminal  29.5 
 
 		 456 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3462  FAD linked oxidase domain protein  28.32 
 
 		 477 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0351  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.59 
 
 		 466 aa  140  7e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  25.23 
 
 		 448 aa  138  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3339  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.6 
 
 		 448 aa  138  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.235624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0426  FAD linked oxidase-like protein  27.27 
 
 		 465 aa  135  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4113  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.68 
 
 		 492 aa  131  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4892  FAD-dependent oxidase  24.62 
 
 		 444 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  normal  0.492965 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2260  FAD linked oxidase domain protein  26.27 
 
 		 466 aa  130  6e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00839199  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1304  FAD linked oxidase domain protein  28.07 
 
 		 456 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0717469  normal  0.684944 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0071  FAD linked oxidase domain protein  30.4 
 
 		 466 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6331  FAD linked oxidase domain protein  28.89 
 
 		 480 aa  128  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00000929143  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0426  FAD-dependent oxidase  24.4 
 
 		 444 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3628  FAD linked oxidase domain protein  29.08 
 
 		 451 aa  124  5e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4161  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.87 
 
 		 481 aa  123  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1637  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.31 
 
 		 449 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.86 
 
 		 474 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0347  FAD linked oxidase-like  34.95 
 
 		 459 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.604176  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0404  putative reticuline oxidase  25.34 
 
 		 448 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.993736  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3854  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.16 
 
 		 574 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0060  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  25.69 
 
 		 465 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.77 
 
 		 484 aa  113  9e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.778905  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  33.73 
 
 		 446 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10062  oxidoreductase  39.8 
 
 		 479 aa  111  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.761932 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2044  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.86 
 
 		 490 aa  110  5e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0408  putative reticuline oxidase  24.61 
 
 		 448 aa  110  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02387  conserved hypothetical protein  33.52 
 
 		 502 aa  110  6e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.870175 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2448  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.33 
 
 		 476 aa  110  6e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.370857  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09308  FAD binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G00730)  25.15 
 
 		 473 aa  109  9.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.898615 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1510  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.7 
 
 		 614 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0454075  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2842  FAD linked oxidase domain protein  33.7 
 
 		 864 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0215386 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2149  FAD linked oxidase domain protein  26.9 
 
 		 458 aa  108  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1539  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.15 
 
 		 864 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.416598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1503  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.15 
 
 		 864 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3122  FAD linked oxidase domain protein  34.91 
 
 		 449 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3156  FAD linked oxidase-like protein  33.02 
 
 		 577 aa  107  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000469  probable oxidoreductase  32.97 
 
 		 563 aa  106  9e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0940249  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3943  FAD linked oxidase domain protein  25.68 
 
 		 448 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0061  FAD linked oxidase domain protein  25.32 
 
 		 474 aa  105  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0127  FAD linked oxidase domain protein  25.8 
 
 		 775 aa  105  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.48716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1448  histidine kinase  35.16 
 
 		 487 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1145  FAD/FMN-containing dehydrogenase  31.11 
 
 		 456 aa  104  3e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1131  FAD linked oxidase domain protein  27.63 
 
 		 447 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1694  FAD-binding protein  31.72 
 
 		 894 aa  103  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05846  FAD binding oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14630)  36.84 
 
 		 472 aa  103  8e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06290  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  37.16 
 
 		 734 aa  103  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.945102  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  35.14 
 
 		 764 aa  102  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2763  putative F420-dependent oxidoreductase  30.62 
 
 		 758 aa  101  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2583  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.65 
 
 		 896 aa  101  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.15241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2650  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.65 
 
 		 896 aa  101  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0042  FAD linked oxidase domain protein  36.02 
 
 		 545 aa  100  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2758  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.65 
 
 		 896 aa  100  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0376  FAD linked oxidase domain protein  33.86 
 
 		 753 aa  99  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3087  FAD linked oxidase-like protein  32.6 
 
 		 752 aa  99  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1411  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.07 
 
 		 891 aa  97.4  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2731  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.55 
 
 		 472 aa  97.1  6e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0114478  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4792  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.03 
 
 		 462 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.528841  normal  0.944989 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>