200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2354 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2354  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 		 308 aa  644    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.218636  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2138  glycosyl transferase family protein  95.45 
 
 		 308 aa  620  1e-176  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.177505  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2313  putative O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase  50.66 
 
 		 314 aa  305  9.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0276977 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2311  putative O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase  50.66 
 
 		 314 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0283502  normal  0.0363291 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2424  putative O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase  50.66 
 
 		 314 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.126367  hitchhiker  0.000645643 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2210  putative O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase  49.67 
 
 		 314 aa  302  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149934  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0085  glycosyl transferase family 2  47.54 
 
 		 308 aa  282  4.0000000000000003e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0285695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0082  O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase, putative  47.54 
 
 		 308 aa  282  4.0000000000000003e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19572  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2189  glycosyl transferase, group 2 family protein  46.2 
 
 		 303 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016555  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4286  glycosyl transferase family protein  48.84 
 
 		 303 aa  268  8e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.131233 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3560  glycosyl transferase family protein  44.33 
 
 		 306 aa  259  4e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.480294  normal  0.632112 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1578  glycosyl transferase family 2  42.76 
 
 		 305 aa  254  1.0000000000000001e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3008  glycosyl transferase  49.83 
 
 		 303 aa  250  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.895358  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2861  glycosyl transferase family 2  46.41 
 
 		 305 aa  242  5e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0841  glycosyl transferase family protein  42.76 
 
 		 306 aa  227  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.913833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4927  glycosyl transferase family 2  38.54 
 
 		 309 aa  215  9e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640418  normal  0.791087 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4142  glycosyl transferase family 2  39.54 
 
 		 313 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000221538 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3103  glycosyl transferase family protein  32.28 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.532387  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0596  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.3 
 
 		 304 aa  103  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.300556  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2036  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  30.43 
 
 		 1162 aa  86.3  6e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0633  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  29.49 
 
 		 1161 aa  82.4  0.000000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5865  glycosyl transferase family 2  29.49 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3109  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 		 327 aa  70.5  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0045  glycosyl transferase family 2  26.24 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.288326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0047  glycosyl transferase family 2  26.24 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  27.94 
 
 		 403 aa  65.9  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0472  glycosyl transferase family protein  27.01 
 
 		 365 aa  65.9  0.0000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  25.3 
 
 		 1099 aa  63.2  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  23.43 
 
 		 1061 aa  62.4  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  25.74 
 
 		 752 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1959  glycosyl transferase family 2  24.84 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4770  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  23.73 
 
 		 461 aa  60.1  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1244  glycosyl transferase family 2  23.71 
 
 		 328 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.161463 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  23.93 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0426  glycosyl transferase family protein  26.81 
 
 		 366 aa  58.9  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0815896  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1214  glycosyl transferase family 2  23.71 
 
 		 328 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  24.52 
 
 		 1101 aa  57  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  23.33 
 
 		 337 aa  56.6  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2839  glycosyl transferase family protein  23.74 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0441317  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  30.97 
 
 		 333 aa  56.2  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  25.96 
 
 		 1002 aa  55.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  28.49 
 
 		 662 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  23.92 
 
 		 1120 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  25.82 
 
 		 633 aa  54.7  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  25.47 
 
 		 1124 aa  54.7  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  28.49 
 
 		 505 aa  54.7  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  25.93 
 
 		 411 aa  54.3  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0300  glycosyl transferase family protein  24.66 
 
 		 322 aa  53.9  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  26.17 
 
 		 260 aa  54.3  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  28.49 
 
 		 520 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  26.16 
 
 		 1267 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  25.71 
 
 		 637 aa  53.5  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  25.94 
 
 		 399 aa  53.1  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0288  N-glycosyltransferase  22.78 
 
 		 424 aa  52.8  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.393224  normal  0.0606217 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  23.79 
 
 		 412 aa  52.8  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.498109 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  23.79 
 
 		 412 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0472996 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  33.82 
 
 		 624 aa  52.8  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  23.79 
 
 		 441 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  23.79 
 
 		 441 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  23.41 
 
 		 1154 aa  52.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  23.79 
 
 		 441 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  23.79 
 
 		 441 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  23.79 
 
 		 441 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2528  glycosyl transferase family 2  27.64 
 
 		 307 aa  51.6  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.591132  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4841  N-glycosyltransferase  22.68 
 
 		 425 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3764  N-glycosyltransferase  22.68 
 
 		 425 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  24.43 
 
 		 1118 aa  51.6  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  34.19 
 
 		 303 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4588  glycosyl transferase family protein  25.11 
 
 		 307 aa  50.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.151626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1078  glycosyl transferase family protein  27.69 
 
 		 232 aa  50.4  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892634  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1447  glycosyl transferase family protein  24.22 
 
 		 233 aa  50.4  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0726839  normal  0.0201369 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3289  glycosyl transferase family 2  22.12 
 
 		 328 aa  50.4  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  24.19 
 
 		 422 aa  50.4  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04326  N-glycosyltransferase  24.27 
 
 		 417 aa  50.4  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.780445  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4949  glycosyl transferase family protein  25.82 
 
 		 446 aa  50.1  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816666  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2444  glycosyl transferase family protein  38.46 
 
 		 320 aa  49.3  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.181475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2350  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.49 
 
 		 248 aa  49.3  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2252  glycosyl transferase family 2  22.54 
 
 		 414 aa  48.5  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5475  glycosyl transferase family protein  29.92 
 
 		 509 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  21.65 
 
 		 428 aa  48.9  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2690  N-glycosyltransferase  24.64 
 
 		 399 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769195  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4287  N-glycosyltransferase  26.44 
 
 		 442 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2747  N-glycosyltransferase  24.64 
 
 		 399 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1377  glycosyl transferase family protein  31.13 
 
 		 297 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0605163 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1315  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 520 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375095  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3007  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  40 
 
 		 246 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0582425 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2904  glycosyl transferase family 2  28.26 
 
 		 300 aa  47.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0852  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 520 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3621  glycosyl transferase family protein  29.92 
 
 		 509 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1333  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 520 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1351  glycosyl transferase family protein  23.44 
 
 		 362 aa  47.8  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  28.35 
 
 		 476 aa  48.1  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0362  glycosyl transferase family protein  24.44 
 
 		 364 aa  47.8  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.279909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1919  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  43.86 
 
 		 241 aa  47.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025482  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  30.88 
 
 		 679 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1930  glycosyl transferase family 2  43.4 
 
 		 246 aa  47.4  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000462816 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  27.83 
 
 		 337 aa  47.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3205  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 306 aa  47.4  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.159852 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>