43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2277 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2277  5'-nucleotidase, putative  100 
 
 		 306 aa  616  1e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000234456  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2075  5-nucleotidase  94.77 
 
 		 306 aa  586  1e-166  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.481427  decreased coverage  0.00126317 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4005  5-nucleotidase  86.58 
 
 		 301 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0143128  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2548  5'-nucleotidase  81.63 
 
 		 301 aa  490  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0352876  hitchhiker  0.0000000276968 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1318  5'-nucleotidase  67.44 
 
 		 300 aa  409  1e-113  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0737882  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1377  5'-nucleotidase  67.77 
 
 		 300 aa  409  1e-113  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.4775  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1665  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  66.11 
 
 		 304 aa  402  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000892807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1810  5-nucleotidase  65.53 
 
 		 313 aa  384  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1322  5'-nucleotidase  66.09 
 
 		 314 aa  362  3e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2603  5'-nucleotidase  58.15 
 
 		 314 aa  342  5e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.100463  normal  0.246246 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0936  5'-nucleotidase  56.15 
 
 		 319 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00766  cytosolic 5'-nucleotidase 1A  57.7 
 
 		 306 aa  324  1e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0831  5'-nucleotidase  55.7 
 
 		 318 aa  322  4e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1981  5'-nucleotidase  52.41 
 
 		 298 aa  304  1.0000000000000001e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5142  5'-nucleotidase  52.25 
 
 		 322 aa  292  6e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.311146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1606  5'-nucleotidase  52.56 
 
 		 302 aa  288  7e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.521247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0639  5-nucleotidase  50.31 
 
 		 326 aa  287  1e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1901  5-nucleotidase  52.4 
 
 		 305 aa  286  4e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0734  5-nucleotidase  52.96 
 
 		 301 aa  280  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0738  5-nucleotidase  49.69 
 
 		 328 aa  280  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4055  hypothetical protein  54.08 
 
 		 300 aa  279  5e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.313744 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0662  5-nucleotidase  51.63 
 
 		 313 aa  278  7e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.56412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0641  5'-nucleotidase  51.63 
 
 		 313 aa  278  7e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.741997  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0644  5'-nucleotidase  53.74 
 
 		 300 aa  277  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1070  5'-nucleotidase  52.33 
 
 		 299 aa  275  5e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0768314  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0369  5'-nucleotidase  52.49 
 
 		 300 aa  275  6e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3975  5-nucleotidase  51.82 
 
 		 313 aa  275  9e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5585  5'-nucleotidase  45.18 
 
 		 340 aa  271  9e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5704  5'-nucleotidase  51.88 
 
 		 306 aa  265  7e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0477991  normal  0.0340537 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3141  5-nucleotidase, putative  53.08 
 
 		 298 aa  264  2e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000206267 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1630  5-nucleotidase  52.13 
 
 		 312 aa  262  6e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.891126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1307  5-nucleotidase  46.15 
 
 		 308 aa  241  9e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0862538  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2015  5'-nucleotidase  43.56 
 
 		 335 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0789  5'-nucleotidase, putative  44.87 
 
 		 327 aa  236  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00475303  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2531  5'-nucleotidase  42.76 
 
 		 331 aa  235  7e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.102329  normal  0.295245 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3189  5'-nucleotidase  42.76 
 
 		 331 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43917  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2065  5'-nucleotidase  44.63 
 
 		 329 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.971037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2257  5-nucleotidase  40.45 
 
 		 350 aa  228  1e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.689713  normal  0.052298 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2135  5'-nucleotidase  41.61 
 
 		 335 aa  227  2e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0823171  decreased coverage  0.000000198114 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3043  5'-nucleotidase, putative  38.36 
 
 		 318 aa  226  4e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.198153  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2729  5'-nucleotidase  40.34 
 
 		 331 aa  215  8e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.810297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1962  hypothetical protein  38.93 
 
 		 158 aa  106  4e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.112396  normal  0.398312 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0483  hypothetical protein  43.64 
 
 		 134 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>