98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2146 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2146  pyoverdine biosynthesis regulatory gene, putative  100 
 
 		 325 aa  679    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1956  pyoverdine biosynthesis regulatory gene, putative  96.31 
 
 		 325 aa  660    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0908494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4087  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  80.86 
 
 		 327 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.744536  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25610  pyoverdine biosynthesis regulatory protein-TauD/TfdA family protein  76.92 
 
 		 327 aa  541  1e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4222  syrP protein, putative  74.38 
 
 		 327 aa  521  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.824381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1086  hypothetical protein  64.05 
 
 		 320 aa  417  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2863  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  62.66 
 
 		 328 aa  409  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.160357  normal  0.0373471 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3734  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  59.68 
 
 		 330 aa  376  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.128329  normal  0.214027 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4065  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  56.83 
 
 		 344 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.669565 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1876  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  56.09 
 
 		 349 aa  372  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0519  hypothetical protein  56.35 
 
 		 340 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.514257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2425  syringomycin biosynthesis enzyme, putative  57.32 
 
 		 363 aa  364  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.70135  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1933  putative syringomycin biosynthesis enzyme  57.46 
 
 		 333 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00299028  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1189  syringomycin biosynthesis enzyme, putative  57.46 
 
 		 338 aa  361  1e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.889509  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1919  putative syringomycin biosynthesis enzyme  57.46 
 
 		 338 aa  361  1e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.960383  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0295  putative syringomycin biosynthesis enzyme  57.46 
 
 		 333 aa  361  1e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.313093  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2078  SyrP-like protein  57.46 
 
 		 338 aa  361  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.09225  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1632  putative syringomycin biosynthesis enzyme  57.46 
 
 		 338 aa  361  1e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.224284  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0866  putative syringomycin biosynthesis enzyme  57.46 
 
 		 333 aa  361  1e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00835773  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4045  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  56.77 
 
 		 343 aa  359  3e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4757  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  58.86 
 
 		 329 aa  358  6e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1604  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  56.86 
 
 		 336 aa  358  9e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235316  hitchhiker  0.000432295 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3747  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  55.79 
 
 		 330 aa  355  3.9999999999999996e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.378977  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1552  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  56.19 
 
 		 339 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.460202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1531  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  56.19 
 
 		 339 aa  353  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0837838  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1154  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  57.29 
 
 		 335 aa  349  3e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0263219  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1609  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  55.85 
 
 		 335 aa  349  3e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.573686  normal  0.0746816 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1634  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  57.29 
 
 		 335 aa  349  3e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112871  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4780  hypothetical protein  57.29 
 
 		 335 aa  348  6e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107558  normal  0.342828 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5755  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  49.68 
 
 		 337 aa  342  5.999999999999999e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.799717 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0007  condensation domain-containing protein  51.47 
 
 		 798 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.441594  normal  0.0181415 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3028  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  51.32 
 
 		 345 aa  336  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4100  SyrP protein, putative  51.11 
 
 		 340 aa  336  3.9999999999999995e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3093  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  50.99 
 
 		 345 aa  336  3.9999999999999995e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.922109 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3030  amino acid adenylation domain protein  44.88 
 
 		 1870 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2105  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  44.13 
 
 		 352 aa  289  4e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3091  amino acid adenylation domain protein  44.88 
 
 		 1870 aa  289  4e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  45.36 
 
 		 2997 aa  286  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  45.08 
 
 		 4502 aa  280  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34830  putative regulatory protein  44.69 
 
 		 339 aa  280  3e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000120125  normal  0.210571 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3866  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  42.67 
 
 		 337 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.148075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6479  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  43.34 
 
 		 332 aa  264  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34820  putative regulatory protein  46.56 
 
 		 362 aa  262  8e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000167255  normal  0.0664831 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0364  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  41.18 
 
 		 326 aa  261  8.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0496601 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3407  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  43.68 
 
 		 341 aa  257  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.874797  normal  0.341142 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9638  SyrP-like protein  42.12 
 
 		 326 aa  253  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  41.37 
 
 		 3432 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2419  SyrP protein, putative  44.64 
 
 		 324 aa  249  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3546  amino acid adenylation domain-containing protein  41.53 
 
 		 3404 aa  248  7e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0341  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  40.88 
 
 		 329 aa  244  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.813705 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3408  amino acid adenylation domain protein  39.33 
 
 		 3207 aa  232  6e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3673  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  38.82 
 
 		 335 aa  225  8e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1676  condensation domain-containing protein  38.19 
 
 		 353 aa  222  6e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.273988  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1594  syringomycin biosynthesis enzyme  38.19 
 
 		 353 aa  222  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00454586  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2612  syrP protein, putative  36.89 
 
 		 353 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0209846  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0188  SyrP-like protein  38.19 
 
 		 374 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.801679  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1212  syringomycin biosynthesis enzyme, putative  38.19 
 
 		 331 aa  220  3e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0138176  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3402  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  37.86 
 
 		 325 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.645048 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2293  TPR repeat-containing protein  36.99 
 
 		 317 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0622  putative syringomycin biosynthesis enzyme  36.68 
 
 		 317 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0692  SyrP-like protein  36.68 
 
 		 317 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1642  putative syringomycin biosynthesis enzyme  36.68 
 
 		 317 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2210  syringomycin biosynthesis enzyme  36.68 
 
 		 317 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.716341  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1942  putative syringomycin biosynthesis enzyme  36.68 
 
 		 317 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5584  hypothetical protein  39.46 
 
 		 362 aa  205  8e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3074  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  35.96 
 
 		 326 aa  191  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0518  putative syringomycin biosynthesis enzyme  37.5 
 
 		 355 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.923384  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2893  putative syringomycin synthesis regulator SyrP  37.13 
 
 		 355 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0536  putative syringomycin biosynthesis enzyme  37.13 
 
 		 355 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.876864  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1465  putative syringomycin synthesis regulator SyrP  37.13 
 
 		 355 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0123  putative syringomycin synthesis regulator SyrP  37.13 
 
 		 355 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177421  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0702  SyrP-like protein  37.13 
 
 		 355 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.225858  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3153  syringomycin synthesis regulator SyrP, putative  36.76 
 
 		 355 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5654  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  34.69 
 
 		 357 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197039  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6510  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  34.69 
 
 		 357 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.348896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6019  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  34.69 
 
 		 357 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.232018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6133  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  35.27 
 
 		 357 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165198  decreased coverage  0.00922022 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7428  hypothetical protein  33.73 
 
 		 357 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0587207  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1907  hypothetical protein  30 
 
 		 347 aa  161  1e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1918  hypothetical protein  29.7 
 
 		 347 aa  159  4e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6018  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  32.16 
 
 		 335 aa  149  9e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45755  predicted protein  27.78 
 
 		 486 aa  131  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2876  SyrP protein, putative  31.63 
 
 		 329 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0052637  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3398  hypothetical protein  27.11 
 
 		 365 aa  115  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.15413  normal  0.22081 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0146  hypothetical protein  27.01 
 
 		 329 aa  114  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000417929 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3399  hypothetical protein  26.51 
 
 		 363 aa  112  8.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.634125  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0533  putative peptide synthase regulatory protein  26.88 
 
 		 359 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2110  hypothetical protein  25.46 
 
 		 344 aa  109  5e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1859  putative peptide synthase regulatory protein  26.52 
 
 		 341 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128866  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2164  putative syringomycin synthesis regulator SyrP  26.52 
 
 		 341 aa  109  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00000119681  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2135  hypothetical protein  25.46 
 
 		 344 aa  109  6e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1449  putative syringomycin synthesis regulator SyrP  26.52 
 
 		 341 aa  109  6e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.477833  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0437  putative peptide synthase regulatory protein  26.52 
 
 		 359 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187003  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2090  syringomycin synthesis regulator SyrP, putative  26.52 
 
 		 464 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2972  hypothetical protein  26.47 
 
 		 366 aa  98.2  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.884584  normal  0.157266 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02698  conserved hypothetical protein  28.76 
 
 		 401 aa  89.4  8e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0409748  normal  0.900915 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49639  predicted protein  28.53 
 
 		 435 aa  79  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4518  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  24.81 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>