More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2121 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2121  RulA protein, putative  100 
 
 		 147 aa  299  9e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1916  peptidase S24, S26A and S26B  85.71 
 
 		 147 aa  259  6e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132247 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2762  peptidase S24, S26A and S26B  54.35 
 
 		 143 aa  146  9e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0232979 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1424  peptidase S24, S26A and S26B  53.96 
 
 		 144 aa  139  9e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0735  peptidase S24, S26A and S26B  53.24 
 
 		 144 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2951  putative prophage repressor  47.83 
 
 		 158 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2746  peptidase S24/S26 domain-containing protein  47.1 
 
 		 152 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5031  putative prophage repressor  41.61 
 
 		 142 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.916136  normal  1 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0002  ultraviolet light resistance protein A  35 
 
 		 141 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0100  protein MucA  37.14 
 
 		 147 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.903241  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1967  putative prophage repressor  28.06 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44891  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1435  peptidase S24 and S26 domain protein  35.77 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1981  putative prophage repressor  31.43 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1208  putative prophage repressor  34.03 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00934288  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2341  putative prophage repressor  36.89 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2457  peptidase S24/S26 domain-containing protein  36.89 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2006  peptidase S24 and S26 domain protein  36.89 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000362452 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2352  putative prophage repressor  36.89 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2216  DNA polymerase V subunit UmuD  36.22 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.113166  normal  0.676536 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2163  DNA polymerase V subunit UmuD  36.22 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.21769  normal  0.16696 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2159  DNA polymerase V subunit UmuD  36.22 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0649907  normal  0.799601 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1278  putative prophage repressor  35.25 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.824294  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0176  peptidase S24 and S26 domain protein  42.11 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1669  hypothetical protein  34.58 
 
 		 138 aa  72  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1663  hypothetical protein  34.58 
 
 		 138 aa  72  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2213  DNA polymerase V subunit UmuD  34.92 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0542538 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1907  putative prophage repressor  35.34 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2081  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.91 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0527419 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1549  SOS mutagenesis protein UmuD  33.08 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.093809 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0858  putative prophage repressor  35.96 
 
 		 206 aa  67.8  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10191  putative SOS mutagenesis protein UmuD  29.32 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4001  putative prophage repressor  35.48 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1963  putative prophage repressor  33.9 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2039  peptidase S24/S26 domain-containing protein  33.33 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0772285 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0458  putative prophage repressor  32.79 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0671085  normal  0.466912 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4269  putative prophage repressor  32.2 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4408  peptidase S24/S26 domain-containing protein  32.2 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2974  SOS mutagenesis protein UmuD  35.9 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.979623  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1201  SOS-response transcriptional repressors (RecA-mediated autopeptidase)-like  36.67 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3554  putative prophage repressor  33.33 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6256  peptidase S24/S26 domain-containing protein  31.01 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.836968 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3751  peptidase S24/S26 domain-containing protein  34.17 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2201  peptidase S24 and S26 domain protein  32.14 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09241  putative SOS mutagenesis protein UmuD  27.27 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1483  SOS-response transcriptional repressor, LexA  33.58 
 
 		 261 aa  63.5  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.639619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09221  putative SOS mutagenesis protein UmuD  27.27 
 
 		 138 aa  63.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00588824  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1337  umuD protein  30.34 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0885  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  35.96 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0863  SOS mutagenesis protein UmuD  27.27 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0265877  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0052  mutagenesis and repair protein MucA  34.45 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00205855  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3840  SOS mutagenesis protein UmuD  37.65 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0899  Peptidase S24, S26A and S26B, conserved region  33.96 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3236  peptidase S24, S26A and S26B  30.7 
 
 		 135 aa  62  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2105  SOS mutagenesis protein UmuD  38.37 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.499933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4497  peptidase S24 and S26 domain protein  41.77 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0001  protein SamA  33.06 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0013  SOS mutagenesis protein RulA  32.74 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2345  putative prophage repressor  34.13 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2683  umuD protein  31.62 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0640806  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0048  DNA polymerase V  36.36 
 
 		 137 aa  60.8  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109264 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1966  DNA polymerase V subunit UmuD  28.69 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000484403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6846  Peptidase S24, S26A and S26B, conserved region  36.04 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.391579  normal  0.145831 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2606  peptidase S24 and S26 domain protein  33.33 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.399777  normal  0.0172558 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2061  peptidase S24 and S26 domain protein  33.96 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0332748  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01158  DNA polymerase V, subunit D  28.3 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000619271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2465  peptidase S24 and S26 domain protein  28.3 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000224053  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2442  DNA polymerase V subunit UmuD  28.3 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000116875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1340  DNA polymerase V subunit UmuD  28.3 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000577771  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01168  hypothetical protein  28.3 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000352689  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1328  DNA polymerase V subunit UmuD  28.3 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143224  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1670  DNA polymerase V subunit UmuD  28.3 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0267382  normal  0.982493 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1286  DNA polymerase V subunit UmuD  28.3 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137402  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0175  putative prophage repressor  33.33 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0221  peptidase S24 and S26 domain protein  35.29 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1932  LexA repressor  29.77 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.424325  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0037  protein ImpA  27.21 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0603297 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3779  SOS-response transcriptional repressor, LexA  31.2 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0056  hypothetical protein  30.95 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.221897  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1004  hypothetical protein  30.95 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16001  putative SOS mutagenesis protein UmuD  37.89 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.805764 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1739  LexA repressor  35.2 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4320  peptidase S24 and S26 domain protein  41.18 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.381106 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1039  hypothetical protein  33.71 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0919  peptidase S24 and S26 domain protein  31.2 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.391106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3515  LexA repressor  33.03 
 
 		 205 aa  57.8  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1750  umuD protein  32 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07081  putative SOS mutagenesis protein UmuD  30.77 
 
 		 153 aa  57  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0803785 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1032  SOS mutagenesis protein UmuD  28.89 
 
 		 150 aa  57  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0704  putative prophage repressor  34.48 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4342  putative prophage repressor  30.48 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3997  LexA repressor  31.93 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1918  LexA repressor  30.83 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.726734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2070  SOS-response transcriptional repressor, LexA  36.79 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.189271  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0200  LexA repressor  31.78 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0809  LexA repressor  33.33 
 
 		 815 aa  56.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.642499  hitchhiker  0.0000861607 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3076  SOS mutagenesis protein UmuD  28.35 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2469  putative prophage repressor  28.76 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.244846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3941  peptidase S24 and S26 domain protein  27.34 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0340  peptidase S24 and S26 domain protein  25.95 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2636  LexA repressor  32.5 
 
 		 227 aa  54.3  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.270851  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>