18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2108 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2108  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  394  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1903  hypothetical protein  95.9 
 
 		 195 aa  358  2e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.378219  hitchhiker  0.00133315 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3860  hypothetical protein  62.3 
 
 		 193 aa  240  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1606  type IV pilus assembly PilZ  58.51 
 
 		 188 aa  222  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.321815  normal  0.0962013 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1670  type IV pilus assembly PilZ  58.03 
 
 		 194 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1694  type IV pilus assembly PilZ  55.96 
 
 		 194 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132383 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3589  type IV pilus assembly PilZ  54.92 
 
 		 194 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.549929 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2153  type IV pilus assembly PilZ  54.4 
 
 		 194 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00727048 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2172  hypothetical protein  50.99 
 
 		 199 aa  185  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.849179  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25420  hypothetical protein  49.5 
 
 		 254 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1808  hypothetical protein  26.67 
 
 		 192 aa  80.5  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1748  hypothetical protein  31.69 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.690123  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02436  hypothetical protein  25.99 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.232664  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1890  hypothetical protein  23.12 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1901  hypothetical protein  23.12 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3217  modification methylase HemK  21.98 
 
 		 187 aa  48.1  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2288  hypothetical protein  23.31 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0111603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1844  type IV pilus assembly PilZ  21.69 
 
 		 193 aa  43.1  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.177632  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>