More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2104 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_6273  citrate transporter  81.78 
 
 		 429 aa  672    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.318839  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2104  major facilitator family transporter  100 
 
 		 432 aa  862    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.386264  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72280  citrate transporter  82.01 
 
 		 429 aa  657    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1899  major facilitator transporter  97.44 
 
 		 430 aa  813    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00967745  normal  0.065462 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1366  major facilitator transporter  74.1 
 
 		 435 aa  635    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3864  general substrate transporter  85.45 
 
 		 430 aa  750    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1949  general substrate transporter  73.05 
 
 		 429 aa  631  1e-180  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3059  sugar transporter transmembrane protein  73.75 
 
 		 431 aa  630  1e-179  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.45158 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2992  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  71.63 
 
 		 433 aa  626  1e-178  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3339  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  71.16 
 
 		 437 aa  623  1e-177  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2370  general substrate transporter  71.67 
 
 		 477 aa  611  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.114747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0721  general substrate transporter  70.36 
 
 		 433 aa  610  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0155857  normal  0.463435 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0891  general substrate transporter  72.2 
 
 		 431 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4140  major facilitator transporter  71.46 
 
 		 431 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0903  general substrate transporter  72.2 
 
 		 431 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.289816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1618  citrate-proten symporter  71.53 
 
 		 431 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0175  citrate-proton symporter  71.05 
 
 		 431 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3060  transporter transmembrane protein  71.02 
 
 		 433 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0454  citrate-proten symporter  71.05 
 
 		 431 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2968  citrate-proton symporter  71.05 
 
 		 431 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3029  General substrate transporter  69.88 
 
 		 433 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.07969  normal  0.0112235 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0971  citrate-proton symporter  71.05 
 
 		 431 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.710178  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2600  citrate-proton symporter  71.05 
 
 		 431 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.356599  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0958  major facilitator superfamily citrate/H(+) symporter  70.98 
 
 		 433 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.646724  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3016  citrate-proton symporter  70.8 
 
 		 446 aa  600  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2908  citrate-proton symporter  70.8 
 
 		 431 aa  600  1e-170  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.566614  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1646  general substrate transporter  68.81 
 
 		 439 aa  593  1e-168  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0986  general substrate transporter  68.68 
 
 		 431 aa  588  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.535486  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1027  general substrate transporter  69.36 
 
 		 431 aa  589  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0728  General substrate transporter  69.1 
 
 		 454 aa  585  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0548  general substrate transporter  69.36 
 
 		 488 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.300835  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0530  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  68.43 
 
 		 431 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4980  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  67.62 
 
 		 431 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6665  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  67.55 
 
 		 431 aa  579  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.422553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6430  metabolite  67.55 
 
 		 431 aa  579  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6015  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  67.39 
 
 		 438 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.898773 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0543  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  67.71 
 
 		 431 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6263  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  67.31 
 
 		 431 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.268636  normal  0.400634 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2667  general substrate transporter  66.2 
 
 		 437 aa  570  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.180535  normal  0.174811 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5623  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  67.78 
 
 		 431 aa  568  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6371  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  68.12 
 
 		 431 aa  567  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.86681 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3167  citrate-proton symport  66.67 
 
 		 433 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.905782  normal  0.340935 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5520  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  65.48 
 
 		 432 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.112643 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6136  general substrate transporter  65.96 
 
 		 477 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2761  General substrate transporter  66.18 
 
 		 437 aa  560  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3510  citrate-proton symport  65.23 
 
 		 430 aa  555  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0855554  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6303  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  66.91 
 
 		 438 aa  557  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.429838  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3336  citrate transporter  67 
 
 		 433 aa  551  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6012  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  65.48 
 
 		 432 aa  554  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.976511 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6132  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  67.15 
 
 		 440 aa  554  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1663  general substrate transporter  62.5 
 
 		 425 aa  553  1e-156  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5624  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  66.27 
 
 		 439 aa  550  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.181082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5880  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  65.94 
 
 		 440 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.744654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0845  citrate-proton symporter  62.65 
 
 		 434 aa  521  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0809  citrate-proton symporter  62.65 
 
 		 434 aa  521  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.511471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0796  citrate-proton symporter  62.65 
 
 		 434 aa  521  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0736  citrate-proton symporter  62.65 
 
 		 434 aa  521  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0748  citrate-proton symporter  62.65 
 
 		 434 aa  521  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.93839 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3179  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  60.99 
 
 		 431 aa  517  1.0000000000000001e-145  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02399  citrate carrier protein  60.24 
 
 		 425 aa  504  1e-141  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5091  general substrate transporter  61.74 
 
 		 435 aa  495  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510267 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6399  General substrate transporter  60.68 
 
 		 431 aa  489  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1915  major facilitator superfamily metabolite(citrate)/H(+) symporter  59.37 
 
 		 440 aa  484  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2273  general substrate transporter  58.35 
 
 		 440 aa  475  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.979998  normal  0.381458 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2401  General substrate transporter  57.87 
 
 		 430 aa  453  1.0000000000000001e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7138  citrate-proton symporter  56.8 
 
 		 437 aa  436  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.575895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1274  major facilitator family transporter  42.96 
 
 		 427 aa  332  6e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  45.05 
 
 		 425 aa  331  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  40.75 
 
 		 443 aa  329  5.0000000000000004e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0684  major facilitator transporter  44.2 
 
 		 425 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0717  major facilitator transporter  44.2 
 
 		 425 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0233  major facilitator transporter  44.2 
 
 		 425 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0632  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 425 aa  325  1e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0608  major facilitator transporter  43.83 
 
 		 425 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3994  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  44.39 
 
 		 425 aa  323  3e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0178094  normal  0.374978 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0703  major facilitator superfamily MFS_1  44.55 
 
 		 425 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406001  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  43.1 
 
 		 425 aa  318  1e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  40.19 
 
 		 443 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3376  major facilitator family transporter  43.22 
 
 		 499 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  40.43 
 
 		 438 aa  312  7.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3805  major facilitator transporter  43.26 
 
 		 425 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  39.52 
 
 		 438 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4332  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  39.49 
 
 		 430 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1160  major facilitator transporter  40.29 
 
 		 440 aa  301  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3314  major facilitator superfamily MFS_1  39.34 
 
 		 457 aa  297  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0645  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  39.66 
 
 		 454 aa  296  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.27253 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2610  major facilitator transporter  40.57 
 
 		 436 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2752  major facilitator transporter  39.76 
 
 		 436 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0219  major facilitator family transporter  41.33 
 
 		 430 aa  293  3e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  39.72 
 
 		 461 aa  293  5e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3091  general substrate transporter  39.31 
 
 		 435 aa  292  7e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4727  major facilitator transporter  41.38 
 
 		 428 aa  292  8e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192951  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2957  general substrate transporter  39.31 
 
 		 435 aa  292  9e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.803782 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0389  General substrate transporter  38.79 
 
 		 430 aa  291  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1763  major facilitator superfamily MFS_1  40.78 
 
 		 427 aa  291  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0782222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3065  general substrate transporter  39.31 
 
 		 435 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2122  major facilitator family transporter  40.62 
 
 		 430 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443931  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3046  general substrate transporter  39.08 
 
 		 435 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2432  general substrate transporter  39.08 
 
 		 435 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2967  major facilitator family transporter  40.62 
 
 		 430 aa  290  3e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>