84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2017 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3889  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  87.01 
 
 		 366 aa  650    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.040112 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2017  hypothetical protein  100 
 
 		 357 aa  736    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.115634  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3403  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  97.2 
 
 		 357 aa  717    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.636582 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3626  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  80.06 
 
 		 354 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.642022 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2113  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  79.77 
 
 		 354 aa  599  1e-170  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599809  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1655  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  79.77 
 
 		 354 aa  600  1e-170  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0111159  normal  0.447876 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1632  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  79.49 
 
 		 355 aa  599  1e-170  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.281691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1904  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  80.75 
 
 		 351 aa  596  1e-169  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000223695  normal  0.490603 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20050  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  74.21 
 
 		 353 aa  562  1.0000000000000001e-159  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44280  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  73.22 
 
 		 352 aa  549  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3767  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  71.79 
 
 		 352 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401236  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3252  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  50.96 
 
 		 366 aa  354  1e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.225665  normal  0.903193 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3125  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  49.31 
 
 		 366 aa  346  4e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000738334  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3205  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  49.31 
 
 		 366 aa  345  5e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.205397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3142  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  49.31 
 
 		 366 aa  345  5e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0783039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3064  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  49.04 
 
 		 366 aa  345  6e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157205  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3305  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  49.04 
 
 		 366 aa  345  6e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.571863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3190  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  49.04 
 
 		 366 aa  345  7e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.580308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2947  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  48.76 
 
 		 366 aa  344  2e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0906  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  48.76 
 
 		 366 aa  344  2e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3112  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  48.76 
 
 		 366 aa  344  2e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000130243  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2950  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  48.76 
 
 		 366 aa  344  2e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000823622  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4070  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  48.76 
 
 		 366 aa  344  2e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000374356  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02618  hypothetical protein  48.76 
 
 		 366 aa  344  2e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0882  conserved hypothetical protein  48.76 
 
 		 366 aa  344  2e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02657  predicted methyltransferase  48.76 
 
 		 366 aa  344  2e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0929  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  49.04 
 
 		 366 aa  342  8e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.088881  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3541  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  50.28 
 
 		 368 aa  341  1e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2981  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  49.15 
 
 		 360 aa  340  2e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2721  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  48.3 
 
 		 361 aa  340  2e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000344468  normal  0.0553209 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2792  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  48.3 
 
 		 361 aa  340  2e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000590307  normal  0.0659937 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3375  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  48.48 
 
 		 366 aa  339  5e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2891  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  48.01 
 
 		 361 aa  338  7e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000117947  hitchhiker  0.00000824021 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004249  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase mtfA  48.74 
 
 		 363 aa  338  9e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000917276  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2992  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  48.76 
 
 		 366 aa  337  9.999999999999999e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3803  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  49.59 
 
 		 367 aa  337  1.9999999999999998e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0270508  hitchhiker  0.000000465668 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1285  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  48.3 
 
 		 361 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000107001  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1353  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  48.3 
 
 		 361 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.109353  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01186  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  48.74 
 
 		 363 aa  335  5.999999999999999e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1392  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  48.3 
 
 		 361 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.14672 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1367  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  48.3 
 
 		 361 aa  335  7e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0458606  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2993  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  48.3 
 
 		 361 aa  335  7e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0309366  hitchhiker  0.00000241621 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1536  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  48.01 
 
 		 361 aa  335  9e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0693  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  48.46 
 
 		 363 aa  333  4e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.716543  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3219  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  47.74 
 
 		 368 aa  332  7.000000000000001e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000791022  normal  0.0810678 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1054  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  47.74 
 
 		 368 aa  332  8e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1001  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  47.74 
 
 		 368 aa  332  8e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000913251  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3468  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  46.88 
 
 		 358 aa  329  4e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0401954  hitchhiker  0.000523336 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3176  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  47.61 
 
 		 366 aa  329  4e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.875851  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2761  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  47.16 
 
 		 363 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0290768  normal  0.262725 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3319  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  46.88 
 
 		 360 aa  324  2e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.045342  normal  0.821385 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2426  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  48.58 
 
 		 361 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2562  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  46.74 
 
 		 367 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1613  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  44.03 
 
 		 365 aa  308  6.999999999999999e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.09552  normal  0.605694 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2780  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  45.3 
 
 		 362 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1153  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  45.45 
 
 		 349 aa  302  6.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.203097 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0496  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  43.73 
 
 		 361 aa  301  1e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0203038  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1930  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  44.06 
 
 		 350 aa  297  2e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.857797 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2412  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  45.85 
 
 		 357 aa  296  3e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2200  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  44.29 
 
 		 356 aa  295  6e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1151  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  46.11 
 
 		 364 aa  295  9e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.543809  hitchhiker  0.0000000680038 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0092  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  46.26 
 
 		 352 aa  292  6e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.155967  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1781  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  43.01 
 
 		 358 aa  279  6e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04620  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  43.23 
 
 		 347 aa  271  1e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0678  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  45.66 
 
 		 355 aa  268  1e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.829891 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1647  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  42.77 
 
 		 435 aa  259  4e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.092844  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2090  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  42.98 
 
 		 351 aa  255  8e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1661  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  42.17 
 
 		 337 aa  252  8.000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2011  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  42.41 
 
 		 366 aa  249  7e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.989087  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02563  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  38.48 
 
 		 365 aa  247  2e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00506422  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1490  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase  43.31 
 
 		 360 aa  248  2e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.624039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1789  hypothetical protein  35.54 
 
 		 344 aa  109  7.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4304  THUMP domain-containing protein  30.57 
 
 		 354 aa  74.3  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50496  predicted protein  31.89 
 
 		 504 aa  72  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.661697  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2347  hypothetical protein  32.73 
 
 		 310 aa  67  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0307  hypothetical protein  30.88 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2541  hypothetical protein  30.3 
 
 		 314 aa  65.1  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00453654  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49783  predicted protein  33.99 
 
 		 499 aa  63.9  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0659  hypothetical protein  26.95 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0643  hypothetical protein  28.4 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3257  putative RNA 2'-O-ribose methyltransferase MtfA  31.4 
 
 		 335 aa  62.8  0.000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0304  hypothetical protein  33.33 
 
 		 303 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.222321  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1968  cell division protein FtsJ  29.11 
 
 		 199 aa  48.9  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0248017  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2924  Fmu (Sun) domain-containing protein  46.27 
 
 		 433 aa  47  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>