More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1927 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1927  chemotaxis protein CheV, putative  100 
 
 		 308 aa  631  1e-180  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.203525  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3486  response regulator receiver:CheW-like protein  99.35 
 
 		 308 aa  627  1e-179  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4253  CheW protein  86.04 
 
 		 310 aa  551  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3734  response regulator receiver modulated CheW protein  85.02 
 
 		 309 aa  541  1e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20750  putative chemotaxis protein  83.12 
 
 		 310 aa  540  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1781  putative chemotaxis protein  83.12 
 
 		 310 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4393  chemotaxis protein CheV  84.42 
 
 		 309 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3954  response regulator receiver modulated CheW protein  84.42 
 
 		 309 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1461  putative CheW protein  84.42 
 
 		 309 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2852  putative CheW protein  81.49 
 
 		 310 aa  496  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.141391 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1068  putative CheW protein  70.03 
 
 		 309 aa  437  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0334866  normal  0.0302452 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2215  putative chemotaxis protein  67.21 
 
 		 316 aa  419  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1176  putative CheW protein  63.04 
 
 		 309 aa  379  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.531119  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1159  response regulator receiver modulated CheW protein  59.33 
 
 		 306 aa  376  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.601808  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2340  chemotaxis protein methyltransferase CheV  59.6 
 
 		 306 aa  372  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1257  response regulator receiver modulated CheW protein  59.67 
 
 		 306 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1327  response regulator receiver modulated CheW protein  59.67 
 
 		 306 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1319  response regulator receiver modulated CheW protein  59.33 
 
 		 306 aa  372  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0920942 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2949  putative CheW protein  58.67 
 
 		 306 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3252  chemotaxis protein CheV  59 
 
 		 306 aa  370  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  58.67 
 
 		 306 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.896505 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2964  putative CheW protein  58.67 
 
 		 306 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.725917  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1414  response regulator receiver modulated CheW protein  58.67 
 
 		 306 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2599  putative CheW protein  58.67 
 
 		 306 aa  369  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1794  chemotaxis protein CheV  59.34 
 
 		 308 aa  367  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1301  CheW-like protein  57.67 
 
 		 306 aa  365  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1343  response regulator receiver modulated CheW protein  58.69 
 
 		 306 aa  364  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.447173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1595  response regulator receiver modulated CheW protein  58 
 
 		 307 aa  363  1e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3089  response regulator receiver modulated CheW protein  58.67 
 
 		 306 aa  364  1e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1338  response regulator receiver modulated CheW protein  57.67 
 
 		 306 aa  363  3e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2320  chemotaxis protein CheV  58.8 
 
 		 306 aa  363  3e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.698234  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01282  hypothetical protein  58.75 
 
 		 308 aa  360  2e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004175  chemotaxis protein CheV  57.89 
 
 		 308 aa  357  9.999999999999999e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  58.33 
 
 		 306 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.262439  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1474  chemotaxis protein CheV  55.56 
 
 		 309 aa  355  6.999999999999999e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1572  CheW protein  53.57 
 
 		 310 aa  343  2e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1215  response regulator receiver modulated CheW protein  53.75 
 
 		 310 aa  341  9e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.186708  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3954  CheW protein  53.9 
 
 		 311 aa  338  5e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3524  chemotaxis protein CheV, putative  53.62 
 
 		 308 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010446  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3297  response regulator receiver:CheW-like protein  53.29 
 
 		 308 aa  332  4e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.307395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2213  putative CheW protein  52.61 
 
 		 311 aa  332  7.000000000000001e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.542266 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1646  response regulator receiver modulated CheW protein  52.96 
 
 		 311 aa  329  4e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2128  chemotaxis protein CheV  52.96 
 
 		 311 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.103105 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3612  putative CheW protein  52.96 
 
 		 311 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.296716  normal  0.145923 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2032  chemotaxis protein CheV  53.72 
 
 		 338 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00977151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1670  response regulator receiver modulated CheW protein  52.96 
 
 		 311 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75876 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2144  response regulator receiver modulated CheW protein  52.58 
 
 		 317 aa  322  5e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000067765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2144  CheW-like protein  53.07 
 
 		 313 aa  322  5e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00213305  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0231  chemotaxis protein CheV  52.75 
 
 		 313 aa  319  3e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2678  response regulator receiver modulated CheW protein  52.75 
 
 		 312 aa  318  7e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0199239  normal  0.361965 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1752  response regulator receiver modulated CheW protein  52.43 
 
 		 314 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0141626  hitchhiker  0.0048436 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1989  chemotaxis protein CheV  53.72 
 
 		 314 aa  317  1e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2708  response regulator receiver modulated CheW protein  52.43 
 
 		 314 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.404736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2594  putative CheW protein  52.43 
 
 		 314 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0125388  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2633  putative CheW protein  52.43 
 
 		 314 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0317026  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2344  response regulator receiver modulated CheW protein  53.72 
 
 		 314 aa  317  2e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.088498  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2462  response regulator receiver modulated CheW protein  53.72 
 
 		 314 aa  317  2e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0985134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1944  response regulator receiver modulated CheW protein  52.1 
 
 		 314 aa  316  3e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000211383  normal  0.0128896 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2272  response regulator receiver modulated CheW protein  53.72 
 
 		 314 aa  316  3e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.740501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2316  response regulator receiver modulated CheW protein  51.94 
 
 		 313 aa  316  4e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.90141  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0522  putative CheW protein  50.97 
 
 		 311 aa  315  4e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2319  putative CheW protein  52.75 
 
 		 314 aa  315  7e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00776156  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02869  hypothetical protein  51.61 
 
 		 313 aa  314  9.999999999999999e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003013  chemotaxis protein CheV  50.97 
 
 		 317 aa  310  2e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0891  response regulator receiver modulated CheW protein  48.71 
 
 		 312 aa  308  6.999999999999999e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.875715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1431  response regulator receiver modulated CheW protein  52.67 
 
 		 313 aa  308  8e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0924  response regulator receiver modulated CheW protein  50.65 
 
 		 309 aa  302  6.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1592  chemotaxis protein CheV  50.32 
 
 		 314 aa  300  2e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01327  chemotaxis protein CheV  50.33 
 
 		 319 aa  300  2e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.750704  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01014  chemotaxis protein  48.21 
 
 		 314 aa  298  1e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.347371  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06152  chemotaxis protein  48.21 
 
 		 314 aa  298  1e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000739527  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1901  response regulator receiver modulated CheW protein  52.43 
 
 		 314 aa  294  1e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0980501  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1063  putative CheW protein  51.2 
 
 		 307 aa  293  2e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1907  response regulator receiver modulated CheW protein  47.56 
 
 		 314 aa  291  1e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.150829 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1476  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  46.5 
 
 		 324 aa  285  8e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02930  chemotaxis protein  53.56 
 
 		 248 aa  264  1e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.464973  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2899  response regulator receiver modulated CheW protein  38.41 
 
 		 295 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.715975  hitchhiker  0.00931868 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0734  response regulator receiver:CheW-like protein  37.42 
 
 		 322 aa  209  5e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1457  response regulator receiver modulated CheW protein  37.55 
 
 		 314 aa  206  3e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1747  response regulator receiver modulated CheW protein  38.75 
 
 		 298 aa  206  4e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0999043 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2185  putative CheW protein  38.73 
 
 		 297 aa  203  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0845954  normal  0.0210169 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1463  response regulator receiver modulated CheW protein  37.02 
 
 		 308 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2708  response regulator receiver modulated CheW protein  38.85 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1805  response regulator receiver modulated CheW protein  38.03 
 
 		 312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.123386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2201  chemotaxis protein CheV  37.28 
 
 		 299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.865724 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1425  response regulator receiver modulated CheW protein  36.82 
 
 		 299 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.419487  normal  0.0812955 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4573  response regulator receiver modulated CheW protein  34.84 
 
 		 316 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.639433 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3501  response regulator receiver modulated CheW protein  34.84 
 
 		 316 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.096074  normal  0.598076 
 
 
-
 
NC_003296  RS03881  putative response regulator transcription regulator protein  35.6 
 
 		 313 aa  194  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.521949  normal  0.59764 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3123  chemotaxis protein CheV  36.33 
 
 		 299 aa  193  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0826  putative CheW protein  35.81 
 
 		 299 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449083  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1372  response regulator receiver modulated CheW protein  36.46 
 
 		 299 aa  193  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980078 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1437  response regulator receiver modulated CheW protein  36.46 
 
 		 299 aa  193  3e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.080472 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0841  response regulator receiver modulated CheW protein  35.81 
 
 		 299 aa  192  8e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5616  response regulator receiver modulated CheW protein  35.08 
 
 		 316 aa  192  9e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.375026 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3224  response regulator receiver modulated CheW protein  37.05 
 
 		 319 aa  191  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0658571  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4985  response regulator receiver:CheW-like protein  34.62 
 
 		 318 aa  190  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3225  response regulator receiver modulated CheW protein  36.08 
 
 		 322 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.185014  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2493  putative CheW protein  36.1 
 
 		 299 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0802  chemotaxis protein CheV  35.47 
 
 		 299 aa  188  8e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>