More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1918 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1555  glycosyl transferase family 2  36.87 
 
 		 1188 aa  765    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1918  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 		 1173 aa  2407    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1946  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.84 
 
 		 1191 aa  640    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4280  hypothetical protein  40.69 
 
 		 1171 aa  827    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00983  O-antigen biosynthesis protein  39.12 
 
 		 1165 aa  734    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  42.21 
 
 		 1759 aa  639    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2650  glycosyl transferase family protein  40.36 
 
 		 1177 aa  838    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06183  O-antigen biosynthesis protein  39.12 
 
 		 1165 aa  734    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00444077  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3720  glycosyl transferase family protein  34.04 
 
 		 1193 aa  617  1e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3469  glycosyl transferase family protein  34.3 
 
 		 1190 aa  615  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.65715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1508  glycosyl transferase family protein  33.42 
 
 		 1198 aa  590  1e-167  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  38.34 
 
 		 1359 aa  590  1e-167  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2593  glycosyl transferase family protein  34.83 
 
 		 1187 aa  538  1e-151  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.842346  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1482  glycosyl transferase family protein  37.13 
 
 		 1162 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.345967  normal  0.675162 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1476  glycosyl transferase family protein  32.67 
 
 		 1192 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.891442 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50300  hypothetical protein  36.62 
 
 		 1694 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0552832  decreased coverage  0.000853187 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3468  glycosyl transferase family protein  40.87 
 
 		 968 aa  372  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1947  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.26 
 
 		 968 aa  366  2e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1517  glycosyl transferase family protein  37.41 
 
 		 974 aa  356  1e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3712  glycosyl transferase family protein  39.54 
 
 		 965 aa  345  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2886  glycosyl transferase family 2  30.27 
 
 		 1213 aa  333  1e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.242978  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1503  glycosyl transferase family 2  32.58 
 
 		 733 aa  207  1e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1492  glycosyl transferase family 2  31.14 
 
 		 958 aa  206  3e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  30.79 
 
 		 746 aa  200  1.0000000000000001e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  30.49 
 
 		 632 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0767  glycosyl transferase family 2  34.54 
 
 		 602 aa  194  8e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00968  putative glycosyltransferase family 2 protein  29.54 
 
 		 731 aa  193  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  27.92 
 
 		 1486 aa  191  5e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0288  glycosyl transferase family protein  29.93 
 
 		 709 aa  191  9e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0772  glycosyl transferase family protein  29.93 
 
 		 709 aa  191  9e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3973  glycosyl transferase family protein  31.76 
 
 		 1275 aa  188  4e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1477  hypothetical protein  31.62 
 
 		 905 aa  188  7e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.559988 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  30.07 
 
 		 1509 aa  184  7e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0396  glycosyl transferase family protein  27.29 
 
 		 625 aa  182  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  27.45 
 
 		 1067 aa  182  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0878  glycosyl transferase family protein  27.29 
 
 		 625 aa  182  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  25.4 
 
 		 1152 aa  179  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  25.4 
 
 		 1152 aa  179  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0852  glycosyl transferase family protein  28.06 
 
 		 765 aa  179  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0849  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 		 625 aa  178  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.33844 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0589  glycosyl transferase family protein  30.35 
 
 		 684 aa  175  5e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal  0.0559054 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2042  glycosyl transferase family 2  28.42 
 
 		 832 aa  170  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.635088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  28.93 
 
 		 1334 aa  170  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.29 
 
 		 610 aa  168  5e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0564  glycosyl transferase family 2  35.07 
 
 		 670 aa  168  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.501276 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0883  glycosyl transferase family 2  29.34 
 
 		 723 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0725  glycosyl transferase family protein  28.22 
 
 		 734 aa  165  6e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.492928  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1074  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.76 
 
 		 1561 aa  161  8e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.755532  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  28.25 
 
 		 996 aa  160  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0354  glycosyl transferase family protein  29.3 
 
 		 658 aa  158  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0600  glycosyl transferase family 2  32.79 
 
 		 684 aa  154  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.149205 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0599  glycosyl transferase family 2  28.75 
 
 		 551 aa  153  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.144427 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  28.31 
 
 		 617 aa  153  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3756  glycosyl transferase family protein  40.53 
 
 		 393 aa  152  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.379294 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3489  glycosyl transferase family protein  31.99 
 
 		 635 aa  151  6e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0475235 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  29.37 
 
 		 1644 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  29.37 
 
 		 1644 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0588  glycosyl transferase family protein  29.38 
 
 		 551 aa  148  5e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231059  normal  0.109318 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  27.41 
 
 		 988 aa  147  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3488  glycosyl transferase family protein  31.18 
 
 		 539 aa  147  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0563  glycosyl transferase family 2  29.48 
 
 		 555 aa  146  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.158623 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1842  glycosyl transferase family 2  30.32 
 
 		 531 aa  145  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1841  glycosyl transferase family 2  30.74 
 
 		 652 aa  145  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3207  glycosyl transferase family protein  30.96 
 
 		 576 aa  144  8e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1401  glycosyl transferase family protein  32.46 
 
 		 808 aa  144  9e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0929  glycosyl transferase family protein  35.21 
 
 		 796 aa  144  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.283533 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0236  hypothetical protein  27.78 
 
 		 783 aa  141  8.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000717832  normal  0.75423 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1792  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.99 
 
 		 809 aa  140  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 		 880 aa  140  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2613  glycosyl transferase family protein  27.18 
 
 		 556 aa  138  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1815  glycosyl transferase family 2  27.64 
 
 		 958 aa  138  6.0000000000000005e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.613695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4882  glycosyl transferase family protein  32.58 
 
 		 526 aa  138  8e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.763618  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2052  glycosyl transferase family 2  29.71 
 
 		 794 aa  138  8e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.039975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1840  glycosyl transferase family 2  29.82 
 
 		 710 aa  137  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0202284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1948  glycosyl transferase family 2  34.57 
 
 		 721 aa  136  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1729  glycosyl transferase family protein  33.82 
 
 		 728 aa  135  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.95068 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3223  glycosyl transferase family protein  35 
 
 		 729 aa  134  7.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0315  glycosyl transferase family protein  33.46 
 
 		 775 aa  134  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1479  methyltransferase type 11  26.2 
 
 		 2046 aa  132  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.604446 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4005  glycosyl transferase family 2  25.28 
 
 		 790 aa  132  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.318857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  34.08 
 
 		 717 aa  132  6e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3236  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.07 
 
 		 851 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2719  glycosyl transferase family 2  29.92 
 
 		 662 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0729  glycosyl transferase family protein  32.5 
 
 		 586 aa  131  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155064  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1495  glycosyltransferase protein  27.54 
 
 		 632 aa  130  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403758  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3321  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.07 
 
 		 851 aa  130  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3284  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.07 
 
 		 851 aa  130  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0268448  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3582  group 2 family glycosyl transferase  34.07 
 
 		 851 aa  130  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3536  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.07 
 
 		 851 aa  130  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000936493 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  26.95 
 
 		 1182 aa  129  5e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4883  glycosyl transferase family protein  27.65 
 
 		 653 aa  129  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.830469  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2009  glycosyl transferase  27.74 
 
 		 810 aa  128  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 717 aa  128  8.000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4777  glycosyl transferase family 2  27.93 
 
 		 742 aa  126  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1062  glycosyl transferase family protein  31.09 
 
 		 783 aa  122  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  25.73 
 
 		 857 aa  122  4.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  26.35 
 
 		 1991 aa  121  7e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2026  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.06 
 
 		 853 aa  121  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.739679  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4626  glycosyl transferase family 2  27.48 
 
 		 742 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4260  glycosyl transferase family protein  27.99 
 
 		 742 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109167  normal  0.249298 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>