More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1915 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1915  bacterial transferase, hexapeptide repeat protein  100 
 
 		 213 aa  424  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00871959  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1665  hexapaptide repeat-containing transferase  38.86 
 
 		 212 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3841  putative acetyltransferase  37.8 
 
 		 210 aa  161  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0094  putative acetyltransferase  36.84 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.315578 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2808  hexapeptide transferase family protein  41.63 
 
 		 216 aa  155  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3036  hexapeptide transferase family protein  41.63 
 
 		 216 aa  155  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.864375 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0101  hexapeptide transferase family protein  39.13 
 
 		 210 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3879  hexapeptide repeat-containing transferase  39.13 
 
 		 210 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3457  hexapeptide transferase family protein  38.65 
 
 		 210 aa  148  7e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10928  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2882  hexapeptide transferase family protein  38.65 
 
 		 210 aa  148  7e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3093  hexapeptide transferase family protein  38.65 
 
 		 210 aa  148  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.915098  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1662  hexapeptide transferase family protein  38.65 
 
 		 210 aa  148  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3961  hexapeptide repeat-containing transferase  38.65 
 
 		 210 aa  148  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0611  acetyltransferase  36.84 
 
 		 216 aa  138  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2645  acetyltransferase  34.78 
 
 		 214 aa  126  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.84069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06179  acetyltransferase  35.75 
 
 		 216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0364172  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00987  acetyltransferase  35.75 
 
 		 216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5253  hexapeptide repeat-containing transferase  36.02 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001766  putative serine O-acetyltransferase  36.54 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00483498  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4284  acetyltransferase  33.65 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3388  YvfD  31.43 
 
 		 210 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.163166  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0546  hypothetical protein  30.95 
 
 		 216 aa  102  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.882481 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3981  hypothetical protein  34.11 
 
 		 225 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1574  putative serine O-acetyltransferase  30.05 
 
 		 217 aa  96.7  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1168  putative acetyl transferase protein  30.56 
 
 		 217 aa  94.4  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.606064  normal  0.7385 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3060  hexapaptide repeat-containing transferase  37.33 
 
 		 218 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.820425  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1344  hexapaptide repeat-containing transferase  30.43 
 
 		 226 aa  92  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.966213 
 
 
-
 
NC_003296  RS02341  putative acetyl transferase protein  33.18 
 
 		 215 aa  91.7  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0378569 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3233  polysialic acid capsule biosynthesis protein NeuD  27.27 
 
 		 207 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.728164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3035  putative acetyl transferase protein  29.11 
 
 		 221 aa  89.4  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00399053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2592  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)-like protein  25.73 
 
 		 218 aa  88.2  7e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124242 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4004  pilin glycosylation protein  25.78 
 
 		 211 aa  88.2  9e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3476  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)-like  31.02 
 
 		 269 aa  86.7  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30060  Trimeric LpxA-like family protein  38.33 
 
 		 209 aa  85.5  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219117  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5367  hexapaptide repeat-containing transferase  29.59 
 
 		 222 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0951  general glycosylation pathway protein  31.97 
 
 		 195 aa  83.6  0.000000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1127  putative acetyl transferase protein  28.63 
 
 		 220 aa  83.2  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.037936  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2518  putative acetyltransferase protein  29.76 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1999  hexapaptide repeat-containing transferase  28.64 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.776075 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0449  general glycosylation pathway protein  30.56 
 
 		 196 aa  81.3  0.00000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0027  hexapaptide repeat-containing transferase  28.32 
 
 		 217 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3630  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  35.37 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.655904 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4261  hexapaptide repeat-containing transferase  28.99 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1736  transferase hexapeptide repeat containing protein  32.99 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3899  putative acetyltransferase protein  27.23 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0366  acetyltransferase  30.4 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4087  carbonic anhydrase  31.91 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0293  carbonic anhydrase  32.27 
 
 		 214 aa  78.2  0.00000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.436969  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12993  putative acetyltransferase  34.29 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1269  acetyltransferase  33.03 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83932  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1210  diguanylate cyclase  27.66 
 
 		 194 aa  77.4  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1935  acetyltransferase  27.01 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1128  hexapaptide repeat-containing transferase  26.48 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2813  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  28.44 
 
 		 365 aa  76.3  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4746  transferase hexapeptide repeat containing protein  32.04 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00152727  normal  0.0166501 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1256  UDP-4-amino-sugar N-acetyltransferase  29.87 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0359  hexapeptide transferase family protein  33.33 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3010  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein NeuD  26.44 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5687  sugar O-acyltransferase, sialic acid O- acetyltransferase NeuD family  35.56 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1212  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  29.61 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1575  acetyltransferase (the isoleucine patch superfamily)  30 
 
 		 212 aa  74.7  0.0000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  9.09781e-19 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7036  acetyltransferase  39.83 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0820  hypothetical protein  31.21 
 
 		 202 aa  73.9  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4045  hexapaptide repeat-containing transferase  31.28 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.950103  normal  0.545183 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16960  transferase hexapeptide repeat protein  31.09 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0791  hypothetical protein  33.33 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1700  Serine acetyltransferase-like protein  34.29 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1265  general glycosylation pathway protein  25.63 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.333754  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2333  hexapaptide repeat-containing transferase  31.25 
 
 		 220 aa  72  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2647  putative acetyltransferase  28.57 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0050  sialic acid biosynthesis protein NeuD  29.84 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4057  acetyltransferases  26.76 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1458  hexapaptide repeat-containing transferase  30.28 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2767  putative serine O-acetyltransferase  25.59 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1140  general glycosylation pathway protein  24.62 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.672363  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0314  hexapaptide repeat-containing transferase  26.17 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.328072  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0598  general glycosylation pathway protein  24.74 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.707027  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0194  hypothetical protein  24.64 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0192  transferase, putative  22.93 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0496333  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4155  acetyltransferase  28.17 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.603693 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0637  putative acetyl transferase protein  25.41 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.714613  normal  0.346317 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8498  acetyltransferase  30.7 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.898885  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001799  putative acetyltransferase  30.16 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1973  hexapeptide transferase family protein  28.91 
 
 		 209 aa  64.7  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2227  hexapaptide repeat-containing transferase  28.39 
 
 		 174 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11536  hypothetical protein  26.51 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.315623 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1515  hexapaptide repeat-containing transferase  27.34 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0168  putative acetyltransferase  28 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0255  putative acetyltransferase  28 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0632  sugar O-acyltransferase, sialic acid O-acetyltransferase NeuD family  31.94 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1380  general glycosylation pathway protein  22.99 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3872  hexapaptide repeat-containing transferase  27.1 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2641  Serine acetyltransferase-like protein  27.98 
 
 		 216 aa  62  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0701  carbonic anhydrase  30.08 
 
 		 221 aa  61.6  0.000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000513916  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0919  hypothetical protein  25.59 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0491377 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1700  hexapaptide repeat-containing transferase  33.79 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0572  putative acetyltransferase  27.01 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0399272  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1022  Tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain protein  33.85 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2245  pilin glycosylation protein  27.08 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0796956  normal  0.0504546 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2607  putative acetyltransferase  27.41 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000773835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>