More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1857 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1857  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 342 aa  702    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.114565  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4080  transcriptional regulator  54.52 
 
 		 348 aa  344  1e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2659  AraC family transcriptional regulator  53.55 
 
 		 333 aa  339  4e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5943  transcriptional regulator  52.9 
 
 		 338 aa  328  7e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0475  AraC family transcriptional regulator  52.35 
 
 		 350 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625315  normal  0.0311111 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1334  putative transcriptional regulator  51.11 
 
 		 317 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2002  AraC family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 341 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.513633  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2612  AraC family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 341 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2641  AraC family transcriptional regulator  51.94 
 
 		 338 aa  324  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15150  putative transcriptional regulator  51.11 
 
 		 317 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.414846  hitchhiker  0.0000298096 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2532  AraC family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 333 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.607958 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0686  AraC family transcriptional regulator  51.48 
 
 		 330 aa  318  7e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3109  AraC family transcriptional regulator  48.25 
 
 		 320 aa  318  1e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.59349 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0282  AraC family transcriptional regulator  49.05 
 
 		 342 aa  317  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4197  transcriptional regulator, AraC family  52.06 
 
 		 331 aa  311  1e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4085  transcriptional regulator, AraC family  52.06 
 
 		 331 aa  311  1e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.825112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0489  transcriptional regulator, AraC family  51.76 
 
 		 325 aa  306  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0527  transcriptional regulator, AraC family  46.67 
 
 		 318 aa  301  1e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3261  transcriptional regulator, AraC family  53.87 
 
 		 337 aa  300  3e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0705  AraC family transcriptional regulator  54.19 
 
 		 331 aa  299  6e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0488  AraC family transcriptional regulator  43.44 
 
 		 335 aa  296  3e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3963  AraC family transcriptional regulator  43.44 
 
 		 335 aa  296  3e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3836  AraC family transcriptional regulator  43.44 
 
 		 335 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3780  transcriptional regulator, AraC family  43.12 
 
 		 335 aa  292  7e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0419  arac-family transcriptional regulator  43.49 
 
 		 317 aa  290  3e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000111496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0051  transcriptional regulator  43.17 
 
 		 323 aa  281  9e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.929929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4236  transcriptional regulator, AraC family  45.66 
 
 		 325 aa  278  1e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3186  AraC family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 333 aa  270  2e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8035  AraC family transcriptional regulator  44.65 
 
 		 333 aa  269  4e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.511507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2364  transcriptional regulator, AraC family  44.48 
 
 		 322 aa  265  5.999999999999999e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4599  transcriptional regulator, AraC family  46.33 
 
 		 332 aa  265  5.999999999999999e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1218  transcriptional regulator, AraC family  45.66 
 
 		 323 aa  262  4.999999999999999e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4046  transcriptional regulator, AraC family  44.24 
 
 		 327 aa  262  8e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.188489  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4139  ThiJ/PfpI domain protein  42.31 
 
 		 321 aa  259  5.0000000000000005e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2157  AraC family transcriptional regulator  44.69 
 
 		 346 aa  256  3e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256833  hitchhiker  0.00609835 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2631  transcriptional regulator  43.61 
 
 		 347 aa  256  4e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0133443  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1271  transcriptional regulator, AraC family  44.05 
 
 		 317 aa  256  5e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2327  transcriptional regulator  39.68 
 
 		 316 aa  256  5e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.223293  normal  0.02817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7121  transcriptional activator FtrA  42.58 
 
 		 328 aa  255  9e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9264  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  46.35 
 
 		 328 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4339  transcriptional regulator, AraC family  43.09 
 
 		 334 aa  253  4.0000000000000004e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.400268 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3587  transcriptional activator FtrA  43.27 
 
 		 329 aa  250  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116485  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4725  AraC family transcriptional regulator  43.45 
 
 		 332 aa  249  5e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4495  AraC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 340 aa  249  5e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2289  transcriptional regulator, AraC family  44.97 
 
 		 332 aa  248  1e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0296172  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2725  transcriptional regulator, AraC family  45.19 
 
 		 320 aa  248  1e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1531  transcriptional regulator, AraC family  47.91 
 
 		 316 aa  247  2e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.608485 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0514  transcriptional regulator, AraC family  43.23 
 
 		 334 aa  245  6.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0923  AraC family transcriptional regulator  41.69 
 
 		 331 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3031  transcriptional activator FtrA  40.51 
 
 		 333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00937108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2003  AraC family transcriptional regulator  43.92 
 
 		 342 aa  244  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3284  transcriptional activator FtrA  39.57 
 
 		 333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.059892 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3631  transcriptional regulator, AraC family  44.3 
 
 		 327 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5407  transcriptional regulator, AraC family  42.49 
 
 		 313 aa  242  7e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6166  transcriptional regulator, AraC family  43.87 
 
 		 362 aa  242  7e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0220245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3202  transcriptional regulator, AraC family  41.64 
 
 		 330 aa  242  7e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125903  unclonable  0.000000000016632 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5328  transcriptional activator FtrA  40.8 
 
 		 324 aa  242  7.999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.417039 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5179  transcriptional regulator, AraC family  43.25 
 
 		 352 aa  242  7.999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  42.26 
 
 		 316 aa  241  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4426  transcriptional activator FtrA  41.21 
 
 		 331 aa  240  2e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1985  transcriptional activator FtrA  39.49 
 
 		 333 aa  239  4e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0670847 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2641  transcriptional activator FtrA  42.58 
 
 		 322 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0056  transcriptional activator FtrA  40.97 
 
 		 326 aa  237  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4142  transcriptional regulator, AraC family  42.04 
 
 		 318 aa  236  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00637596  normal  0.887483 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4403  transcriptional activator FtrA  40.84 
 
 		 333 aa  236  3e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2856  AraC family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 314 aa  236  4e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2062  transcriptional activator FtrA  40.51 
 
 		 329 aa  236  6e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3843  transcriptional regulator, AraC family  43.95 
 
 		 339 aa  235  9e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.295718  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5349  AraC family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0431  transcriptional regulator, AraC family  40.51 
 
 		 320 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1215  transcriptional regulator, AraC family  42.58 
 
 		 356 aa  233  4.0000000000000004e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  normal  0.0161998 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4747  AraC family transcriptional regulator  42.9 
 
 		 320 aa  231  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000169446 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4748  transcriptional regulator  38.82 
 
 		 326 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.760248  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5890  transcriptional activator FtrA  41.14 
 
 		 321 aa  231  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1437  AraC family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 326 aa  231  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4834  transcriptional regulator  38.82 
 
 		 326 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1693  AraC family transcriptional regulator  38.29 
 
 		 321 aa  230  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.69841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5134  transcriptional regulator  39.23 
 
 		 326 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6692  transcriptional regulator, AraC family  42.31 
 
 		 313 aa  229  5e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6340  transcriptional regulator, AraC family  39.81 
 
 		 326 aa  228  8e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351976 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0500  ThiJ/PfpI domain protein  40.6 
 
 		 346 aa  228  9e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4737  transcriptional activator FtrA  40.19 
 
 		 321 aa  228  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1097  ThiJ/PfpI domain protein  38.89 
 
 		 350 aa  227  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266562  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2133  transcriptional regulator, AraC family  40.13 
 
 		 321 aa  227  3e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3549  transcriptional regulator, AraC family  42.36 
 
 		 337 aa  226  4e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.757715  normal  0.622262 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2087  transcriptional activator FtrA  40.51 
 
 		 321 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1058  transcriptional regulator, AraC family  45.21 
 
 		 322 aa  225  8e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.787566  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1680  transcriptional regulator, AraC family  42.49 
 
 		 319 aa  225  9e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00886314  normal  0.186042 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4355  AraC family transcriptional regulator  43.85 
 
 		 356 aa  224  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5345  AraC family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 318 aa  223  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2051  transcriptional regulator, AraC family  41.08 
 
 		 344 aa  223  4e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0835  transcriptional activator FtrA  39.87 
 
 		 318 aa  222  6e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0055  transcriptional activator FtrA  39.87 
 
 		 318 aa  222  6e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00213604  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0872  transcriptional activator FtrA  39.87 
 
 		 318 aa  222  6e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.637455  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1565  transcriptional activator FtrA  39.87 
 
 		 318 aa  222  6e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0715182  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2214  transcriptional activator FtrA  39.87 
 
 		 318 aa  222  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00591748  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0964  transcriptional activator FtrA  39.56 
 
 		 318 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3383  transcriptional regulator  40.69 
 
 		 320 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.690138  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3394  transcriptional regulator  40.69 
 
 		 320 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3445  transcriptional regulator  40.69 
 
 		 320 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.68449 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>