More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1843 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4274  aspartate kinase  95.16 
 
 
413 aa  788  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  9.67452e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3762  aspartate kinase  94.16 
 
 
411 aa  782  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.216913  normal  0.392085 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3555  aspartate kinase  99.76 
 
 
410 aa  825  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00961214  normal  0.594079 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1442  aspartate kinase  92.46 
 
 
411 aa  770  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0731797  normal  0.880113 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4611  aspartate kinase  90.53 
 
 
412 aa  748  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3978  aspartate kinase  93.19 
 
 
411 aa  777  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34450  aspartate kinase  90.51 
 
 
411 aa  755  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0250796  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2902  aspartate kinase  91.26 
 
 
424 aa  760  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4473  aspartate kinase  92.46 
 
 
411 aa  770  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52580  aspartate kinase  90.78 
 
 
412 aa  748  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1843  aspartate kinase, monofunctional class  100 
 
 
410 aa  827  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369756  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0966  aspartate kinase  78.47 
 
 
412 aa  631  1e-180  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00725941  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3627  aspartate kinase  75.55 
 
 
413 aa  631  1e-180  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  9.37685e-05  decreased coverage  1.09716e-07 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0969  aspartate kinase  74.32 
 
 
409 aa  612  1e-174  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1290  aspartate kinase  77.02 
 
 
409 aa  613  1e-174  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.686916  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1300  aspartate kinase  73.83 
 
 
408 aa  603  1e-171  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  1.8313e-10  normal  0.0162978 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0390  aspartate kinase  74.01 
 
 
409 aa  598  1e-170  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0927  aspartate kinase  72.73 
 
 
413 aa  600  1e-170  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2515  aspartate kinase  71.6 
 
 
406 aa  593  1e-168  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00310544  normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0567  aspartate kinase  71.92 
 
 
408 aa  588  1e-167  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.475671  normal  0.793189 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1613  aspartate kinase  73.02 
 
 
414 aa  587  1e-166  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal  0.584087 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1480  aspartate kinase  73.27 
 
 
416 aa  579  1e-164  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.630457  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0358  aspartate kinase  70.94 
 
 
410 aa  571  1e-162  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00114688  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1652  aspartate kinase  72.03 
 
 
416 aa  574  1e-162  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1639  aspartate kinase  68.35 
 
 
428 aa  572  1e-162  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  1.45942e-05  hitchhiker  0.000682871 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1461  aspartate kinase  68.11 
 
 
428 aa  570  1e-161  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  3.57046e-13  hitchhiker  3.74387e-05 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0571  aspartate kinase  71.04 
 
 
408 aa  563  1e-159  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1941  aspartate kinase  70.44 
 
 
409 aa  561  1e-159  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.122463  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0407  aspartate kinase, monofunctional class  71.04 
 
 
408 aa  563  1e-159  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0626  aspartate kinase  71.26 
 
 
414 aa  560  1e-158  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  1.47671e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1612  aspartate kinase  67.31 
 
 
427 aa  548  1e-155  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  4.35622e-10  hitchhiker  1.29841e-08 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1589  aspartate kinase  68.87 
 
 
408 aa  540  1e-152  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  2.53157e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2452  aspartate kinase  65.71 
 
 
453 aa  538  1e-152  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.459441  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2889  aspartate kinase  64.05 
 
 
422 aa  532  1e-150  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.428464  normal  0.0547466 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2860  aspartate kinase  64.29 
 
 
422 aa  528  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3379  aspartate kinase  66.01 
 
 
410 aa  529  1e-149  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  1.24538e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2324  aspartate kinase  63.57 
 
 
423 aa  521  1e-147  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.752292  hitchhiker  0.000104056 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1832  aspartate kinase  67.73 
 
 
410 aa  523  1e-147  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.722812  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1674  aspartate kinase  64.11 
 
 
422 aa  522  1e-147  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.998246 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3086  aspartate kinase  63.1 
 
 
422 aa  518  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1353  aspartate kinase  63.18 
 
 
422 aa  519  1e-146  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0422902  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1945  aspartate kinase  65.22 
 
 
416 aa  515  1e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2591  aspartate kinase  65.46 
 
 
416 aa  515  1e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1427  aspartate kinase  65.46 
 
 
416 aa  515  1e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1799  aspartate kinase  62.78 
 
 
405 aa  514  1e-145  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00100247  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3161  aspartate kinase  65.46 
 
 
416 aa  515  1e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.40885  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2154  aspartate kinase  65.46 
 
 
416 aa  515  1e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1652  aspartate kinase  65.46 
 
 
416 aa  515  1e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.01573  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4940  aspartate kinase  63.64 
 
 
422 aa  517  1e-145  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43762  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2677  aspartate kinase  65.46 
 
 
416 aa  515  1e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2086  aspartate kinase  62.44 
 
 
422 aa  512  1e-144  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0950022  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2074  aspartate kinase  64.73 
 
 
417 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1979  aspartate kinase  64.49 
 
 
417 aa  514  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28482  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1628  aspartate kinase  62.44 
 
 
422 aa  512  1e-144  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.539935 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2540  aspartate kinase  65.22 
 
 
416 aa  512  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.585891  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6003  aspartate kinase  64.73 
 
 
417 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0226396  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1207  aspartate kinase  64.73 
 
 
416 aa  513  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.629425  normal  0.263968 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2093  aspartate kinase  64.73 
 
 
417 aa  513  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0140093  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5380  aspartate kinase  64.49 
 
 
417 aa  512  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0197228  normal  0.567081 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1171  aspartate kinase  66.43 
 
 
416 aa  511  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000593821  normal  0.758494 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1089  aspartate kinase  66.43 
 
 
416 aa  509  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  2.3583e-09  hitchhiker  0.00464797 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0862  aspartate kinase  67.15 
 
 
416 aa  509  1e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2511  aspartate kinase  62.38 
 
 
421 aa  509  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.628463  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2109  aspartate kinase  64.49 
 
 
417 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371456  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1386  aspartate kinase  64.73 
 
 
416 aa  509  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0459009  normal  0.427854 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1126  aspartate kinase  65.7 
 
 
416 aa  508  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  7.63531e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1630  aspartate kinase  64.73 
 
 
416 aa  506  1e-142  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  7.35102e-05  normal  0.733503 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1106  aspartate kinase  65.94 
 
 
416 aa  507  1e-142  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.736404  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2506  aspartate kinase  64.49 
 
 
416 aa  506  1e-142  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0261079  hitchhiker  0.00613103 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1012  aspartate kinase  65.94 
 
 
416 aa  507  1e-142  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.173113  normal  0.0921493 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1006  aspartate kinase  62.87 
 
 
410 aa  504  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.23126e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0976  aspartate kinase  65.94 
 
 
416 aa  500  1e-140  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2318  aspartate kinase  62.28 
 
 
407 aa  497  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  2.67569e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1880  aspartate kinase  62.28 
 
 
405 aa  494  1e-138  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  2.66682e-14  hitchhiker  8.23679e-05 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2531  aspartate kinase  61.79 
 
 
404 aa  486  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  2.1173e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1264  aspartate kinase  61.29 
 
 
404 aa  486  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  2.23474e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3019  aspartate kinase  61.54 
 
 
405 aa  487  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0991  aspartokinase  60.74 
 
 
409 aa  480  1e-134  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  4.71315e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0884  aspartate kinase  60.49 
 
 
409 aa  477  1e-133  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  1.66262e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0966  aspartate kinase  59.75 
 
 
418 aa  473  1e-132  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0227813  hitchhiker  0.000505058 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2262  aspartate kinase  59.55 
 
 
404 aa  468  1e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  1.47386e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0743  aspartate kinase  59.85 
 
 
406 aa  454  1e-127  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0773  aspartate kinase  58.66 
 
 
406 aa  453  1e-126  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0117085  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1251  aspartate kinase  56.79 
 
 
408 aa  453  1e-126  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.545654 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1377  aspartate kinase  55.83 
 
 
400 aa  449  1e-125  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  3.78473e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2048  aspartate kinase  55.69 
 
 
409 aa  447  1e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.122311  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1044  aspartate kinase  58.85 
 
 
411 aa  447  1e-124  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1570  aspartate kinase  55.47 
 
 
399 aa  443  1e-123  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0685  aspartate kinase  54.73 
 
 
400 aa  443  1e-123  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.985937  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2173  aspartate kinase  56.59 
 
 
417 aa  444  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1650  aspartate kinase  54.48 
 
 
403 aa  443  1e-123  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00485759  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0610  aspartate kinase  54.73 
 
 
400 aa  442  1e-123  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1141  aspartate kinase  54.7 
 
 
411 aa  440  1e-122  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0999  aspartate kinase  54.73 
 
 
401 aa  439  1e-122  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.419107  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1087  aspartate kinase  53.73 
 
 
400 aa  437  1e-121  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0276  aspartate kinase  55.45 
 
 
409 aa  437  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.067186 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2018  aspartate kinase  54.73 
 
 
399 aa  438  1e-121  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  7.59653e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4947  aspartate kinase  54.81 
 
 
412 aa  430  1e-119  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.599309  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1008  aspartate kinase  56.68 
 
 
405 aa  429  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0787  aspartate kinase  54.89 
 
 
404 aa  429  1e-119  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>