184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1802 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1802  nitroreductase family protein  100 
 
 		 186 aa  374  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.649607  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3592  nitroreductase  87.63 
 
 		 186 aa  332  1e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0449801  normal  0.683239 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1480  nitroreductase  69.57 
 
 		 188 aa  265  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0228393  normal  0.126132 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4012  nitroreductase  63.59 
 
 		 185 aa  250  6e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.147997  hitchhiker  0.000154736 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4506  nitroreductase  62.5 
 
 		 185 aa  249  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1405  nitroreductase  62.5 
 
 		 185 aa  248  4e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000113316  normal  0.729658 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3795  nitroreductase  62.5 
 
 		 185 aa  245  3e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000177685 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1828  nitroreductase  63.98 
 
 		 186 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1919  hypothetical protein  54.84 
 
 		 186 aa  203  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22710  hypothetical protein  53.76 
 
 		 186 aa  197  7e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0282238 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15580  Nitroreductase  58.06 
 
 		 186 aa  195  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.978849  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1800  nitroreductase  44.75 
 
 		 182 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.493936  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1354  nitroreductase  44.86 
 
 		 186 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000836569  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2590  nitroreductase family protein  41.41 
 
 		 198 aa  160  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236049  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2478  nitroreductase  44.2 
 
 		 182 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.981358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1808  nitroreductase  44.2 
 
 		 182 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1847  nitroreductase  43.65 
 
 		 182 aa  158  4e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1665  nitroreductase  43.89 
 
 		 182 aa  157  6e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2304  nitroreductase  43.33 
 
 		 182 aa  155  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0131618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2374  nitroreductase  42.78 
 
 		 182 aa  153  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.611093  normal  0.915737 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2494  nitroreductase  42.22 
 
 		 182 aa  154  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.838709  hitchhiker  0.00693244 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1740  nitroreductase  47.27 
 
 		 182 aa  153  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1967  hypothetical protein  43.17 
 
 		 183 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2708  nitroreductase family protein  45.45 
 
 		 182 aa  152  4e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2721  hypothetical protein  46.06 
 
 		 183 aa  151  5.9999999999999996e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.6916  hitchhiker  0.00284611 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1532  nitroreductase  45.45 
 
 		 182 aa  150  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2747  nitroreductase  44 
 
 		 182 aa  150  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.501163 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1617  nitroreductase  41.62 
 
 		 183 aa  149  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002916  protein ydjA  40.88 
 
 		 182 aa  149  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2345  hypothetical protein  45.45 
 
 		 183 aa  149  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000126395  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1981  hypothetical protein  45.45 
 
 		 183 aa  149  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000959579  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1833  nitroreductase  44.85 
 
 		 182 aa  148  4e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0967243  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2209  hypothetical protein  43.17 
 
 		 183 aa  148  5e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.601257  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2090  hypothetical protein  44.85 
 
 		 183 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.363519  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1891  nitroreductase  43.41 
 
 		 182 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01734  predicted oxidoreductase  41.82 
 
 		 183 aa  145  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00353733  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1877  nitroreductase  41.82 
 
 		 183 aa  145  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000380394  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2485  hypothetical protein  41.82 
 
 		 183 aa  145  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175131  normal  0.297695 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01722  hypothetical protein  41.82 
 
 		 183 aa  145  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00796019  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2020  hypothetical protein  41.82 
 
 		 183 aa  145  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242439  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1867  hypothetical protein  41.82 
 
 		 183 aa  145  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0147803  decreased coverage  0.00000404862 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1426  hypothetical protein  41.82 
 
 		 183 aa  145  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00297236  normal  0.808801 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1849  hypothetical protein  41.82 
 
 		 183 aa  145  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000672951  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1988  hypothetical protein  41.82 
 
 		 183 aa  145  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00470911  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01646  putative nitroreductase  41.94 
 
 		 183 aa  142  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00644737  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1971  hypothetical protein  39.56 
 
 		 183 aa  142  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1457  nitroreductase family protein  45.45 
 
 		 182 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2315  nitroreductase  43.03 
 
 		 182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7221  nitroreductase  40.98 
 
 		 221 aa  139  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2267  hypothetical protein  39.01 
 
 		 183 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1682  hypothetical protein  42.77 
 
 		 183 aa  138  4.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.5074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2050  hypothetical protein  42.17 
 
 		 183 aa  138  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.658191  normal  0.425687 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1390  hypothetical protein  42.17 
 
 		 183 aa  137  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.505181 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1407  hypothetical protein  42.17 
 
 		 183 aa  137  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0175478  normal  0.348646 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1423  hypothetical protein  42.17 
 
 		 183 aa  137  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.566409 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03042  hypothetical protein  41.44 
 
 		 182 aa  137  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1879  hypothetical protein  41.21 
 
 		 183 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000572902  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1763  nitroreductase  42.63 
 
 		 190 aa  135  3.0000000000000003e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0671  nitroreductase family protein  41.53 
 
 		 207 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2050  nitroreductase family protein  41.53 
 
 		 207 aa  134  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1783  nitroreductase family protein  41.53 
 
 		 207 aa  134  9e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0775  nitroreductase family protein  41.53 
 
 		 207 aa  134  9e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1068  nitroreductase family protein  41.53 
 
 		 207 aa  134  9e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2043  nitroreductase family protein  41.53 
 
 		 207 aa  134  9e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.144976  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0968  hypothetical protein  42.37 
 
 		 191 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1923  nitroreductase family protein  40.56 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0850  nitroreductase  42.37 
 
 		 191 aa  133  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.811499  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0762  nitroreductase family protein  40.98 
 
 		 207 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1101  nitroreductase  40.45 
 
 		 193 aa  132  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4233  nitroreductase  39.67 
 
 		 209 aa  128  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.064349  normal  0.419848 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0566  hypothetical protein  35.36 
 
 		 182 aa  126  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.121072  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2036  nitroreductase  34.05 
 
 		 187 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.378927  normal  0.848302 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0698  nitroreductase  41.4 
 
 		 193 aa  124  7e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129667 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3262  nitroreductase  37.1 
 
 		 191 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561471  normal  0.0279896 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2199  nitroreductase  37.85 
 
 		 188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.654603 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1668  nitroreductase  35.48 
 
 		 187 aa  117  7.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.145589  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2674  nitroreductase  37.43 
 
 		 194 aa  117  7.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04578  nitroreductase family  39.78 
 
 		 191 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0909  nitroreductase family protein  39.39 
 
 		 184 aa  115  3.9999999999999997e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.968398  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5206  hypothetical protein  33.51 
 
 		 187 aa  115  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130059 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2163  nitroreductase  34.91 
 
 		 169 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0519328 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0266  nitroreductase  33.7 
 
 		 187 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3888  nitroreductase  37.95 
 
 		 169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1618  nitroreductase  37.43 
 
 		 195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0191  nitroreductase  36.36 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.104049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1095  nitroreductase  34.13 
 
 		 219 aa  108  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.42931 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3637  nitroreductase  36.26 
 
 		 192 aa  108  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1495  hypothetical protein  37.79 
 
 		 187 aa  107  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0669321 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3123  nitroreductase  38.67 
 
 		 187 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7274  nitroreductase  39.77 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0573924  normal  0.0842376 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1011  nitroreductase  34.05 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1061  nitroreductase  35.76 
 
 		 208 aa  106  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.425769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0930  nitroreductase  33.53 
 
 		 235 aa  105  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0077  nitroreductase  33.92 
 
 		 196 aa  105  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02400  nitroreductase  39.39 
 
 		 191 aa  105  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.305369  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1635  nitroreductase  36.76 
 
 		 187 aa  105  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.191312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1287  aldehyde dehydrogenase  32.04 
 
 		 219 aa  104  7e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6294  nitroreductase  35.33 
 
 		 187 aa  104  8e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167962  normal  0.193293 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1818  nitroreductase  32.79 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2152  nitroreductase  33.51 
 
 		 195 aa  102  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>