208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1730 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1730  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  100 
 
 
204 aa  423  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3662  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  91.67 
 
 
204 aa  397  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0914759  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1688  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  71.08 
 
 
205 aa  308  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.468133 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53230  oxidoreductase  64.36 
 
 
207 aa  271  3e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.605908  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4666  oxidoreductase  64.85 
 
 
207 aa  270  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.243756  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0714  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  56.08 
 
 
191 aa  222  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2789  oxidoreductase, putative  52.91 
 
 
201 aa  221  8e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.287976  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2966  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  52.91 
 
 
192 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6041  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  53.23 
 
 
216 aa  207  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1013  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  47.62 
 
 
193 aa  204  8e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00015307  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2525  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  44.44 
 
 
191 aa  191  7e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.280985  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1807  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.84 
 
 
193 aa  185  5e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.308138  normal  0.0910397 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0087  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.28 
 
 
192 aa  176  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2640  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.45 
 
 
192 aa  175  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.236166  normal  0.823408 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0083  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.21 
 
 
192 aa  174  6e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0086  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.21 
 
 
192 aa  174  9e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0396  quinone family oxidoreductase/NAD(P)H dehydrogenase  41.27 
 
 
192 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.030635  normal  0.183286 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0623  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  45.79 
 
 
507 aa  164  6.9999999999999995e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1799  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.11 
 
 
192 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.2438  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6649  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.62 
 
 
195 aa  156  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4532  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.04 
 
 
192 aa  154  6e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1408  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.49 
 
 
507 aa  153  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6105  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.74 
 
 
193 aa  132  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.399246  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0006  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.13 
 
 
197 aa  125  5e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0938548  normal  0.382985 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0793  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.94 
 
 
197 aa  122  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408316  normal  0.755729 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1574  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.98 
 
 
194 aa  122  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.133884  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2732  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.57 
 
 
189 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2227  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.06 
 
 
194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1387  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.08 
 
 
196 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0844  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.45 
 
 
192 aa  106  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.275008  normal  0.86473 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3002  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  30.27 
 
 
191 aa  105  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0168994  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1123  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.36 
 
 
218 aa  105  5e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000199345 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3099  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.73 
 
 
191 aa  103  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.426933  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1921  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  30.27 
 
 
191 aa  104  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3330  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  29.73 
 
 
191 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3317  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  30.27 
 
 
191 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1192  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.38 
 
 
197 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3331  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  29.73 
 
 
191 aa  102  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3310  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  29.73 
 
 
191 aa  102  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0066019  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3035  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.72 
 
 
191 aa  102  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.700131  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3112  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  29.73 
 
 
191 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.460138  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3358  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  29.73 
 
 
191 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2320  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.28 
 
 
198 aa  97.4  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304506  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5101  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  31.58 
 
 
193 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4778  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.05 
 
 
193 aa  95.1  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0139  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  31.58 
 
 
193 aa  94.7  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.277932  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4826  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  31.22 
 
 
193 aa  92.8  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109009  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5191  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  31.22 
 
 
193 aa  92.8  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.174213  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4110  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.57 
 
 
199 aa  92.4  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal  0.138062 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5095  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  30.53 
 
 
193 aa  92  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.160737  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4666  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.53 
 
 
193 aa  92  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5100  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  30.53 
 
 
193 aa  91.7  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.203676  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3275  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.97 
 
 
204 aa  91.3  8e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4683  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.53 
 
 
193 aa  91.3  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000925813  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5061  hypothetical protein  30.53 
 
 
193 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1767  putative NADPH-quinone reductase (modulator of drug activity B)  28.65 
 
 
189 aa  90.1  2e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3453  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.6 
 
 
192 aa  88.2  9e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000000456035  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3280  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.86 
 
 
194 aa  84.7  9e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4565  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.05 
 
 
192 aa  84.3  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7957  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.15 
 
 
195 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.507514  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4343  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.6 
 
 
193 aa  82.4  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10655  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0608  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  24.6 
 
 
194 aa  82.4  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3342  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.65 
 
 
230 aa  82  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.241608  normal  0.325854 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0894  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.69 
 
 
200 aa  81.6  0.000000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.280002  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3056  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.51 
 
 
194 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1378  quinone dependent NAD(P)H dehydrogenase  29.9 
 
 
211 aa  78.6  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.367665  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0321  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.12 
 
 
206 aa  77.8  0.00000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0657  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.57 
 
 
196 aa  77  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.578822 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4755  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.41 
 
 
195 aa  77  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1125  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  32.54 
 
 
200 aa  76.3  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0534  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  25.13 
 
 
200 aa  75.9  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474001  normal  0.572601 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0573  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  26.52 
 
 
206 aa  74.7  0.0000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1733  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.08 
 
 
195 aa  74.7  0.0000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.130205  normal  0.727599 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0109  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.84 
 
 
223 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.12066  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4550  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.65 
 
 
197 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.617173  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3256  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.8 
 
 
194 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.144602  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0096  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.17 
 
 
199 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000110916  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1308  putative NAD(P)H oxidoreductase(quinone)  26.85 
 
 
213 aa  72.4  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.274882 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0727  putative NADPH-quinone reductase (modulator of drug activity B)  25.29 
 
 
198 aa  72.8  0.000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4047  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.94 
 
 
256 aa  72.8  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.984998  hitchhiker  0.00915897 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3142  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.75 
 
 
196 aa  72  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.2125 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3119  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.62 
 
 
197 aa  70.1  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.415856  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3499  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.21 
 
 
196 aa  70.5  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0029  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.14 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5137  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.69 
 
 
196 aa  69.7  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2263  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.11 
 
 
233 aa  68.9  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.193896  normal  0.343868 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0705  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.84 
 
 
195 aa  66.6  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1917  NAD(P)H dehydrogenase quinone family protein  33.33 
 
 
198 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.048206  normal  0.253839 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4162  NAD  30.92 
 
 
203 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.36876  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04777  NAD(P)H quinone oxidoreductase  23.81 
 
 
222 aa  63.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4996  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.7 
 
 
197 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.627512  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2068  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.32 
 
 
198 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2561  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  28.57 
 
 
259 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1477  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.51 
 
 
209 aa  63.9  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3074  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.91 
 
 
197 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.992671  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1673  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.23 
 
 
193 aa  63.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000846124  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1404  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.77 
 
 
259 aa  62.8  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.411972 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3555  NAD(P)H dehydrogenase protein  27.72 
 
 
193 aa  62  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.438204  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3534  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.63 
 
 
194 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.744175  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1362  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  33.06 
 
 
259 aa  61.6  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0148022  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>