More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1706 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1706  lipoprotein, putative  100 
 
 		 181 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3683  NLP/P60  95.58 
 
 		 181 aa  325  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454661 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1638  NLP/P60  74.16 
 
 		 178 aa  263  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.52996  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4048  NLP/P60 protein  69.1 
 
 		 177 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1268  NLP/P60 protein  76 
 
 		 177 aa  225  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1228  NLP/P60 protein  67.42 
 
 		 177 aa  225  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.771322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48790  putative lipoprotein  65.56 
 
 		 177 aa  225  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.006644  hitchhiker  0.0000000144437 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1670  NLP/P60 protein  75.33 
 
 		 177 aa  224  7e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1747  NLP/P60 protein  67.05 
 
 		 174 aa  223  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  65.52 
 
 		 173 aa  222  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4179  putative lipoprotein  73.79 
 
 		 197 aa  220  8e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000450162  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1606  NLP/P60 protein  51.19 
 
 		 209 aa  168  5e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1659  hypothetical protein  60.32 
 
 		 209 aa  165  4e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.255203  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2887  NLP/P60 protein  61.11 
 
 		 179 aa  165  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.171139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  44.92 
 
 		 205 aa  159  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  46.11 
 
 		 193 aa  159  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1314  lipoprotein transmembrane  49.15 
 
 		 258 aa  158  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01907  lipoprotein  62.7 
 
 		 133 aa  158  3e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.324405  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  49.41 
 
 		 248 aa  158  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33180  NLP/P60 family lipoprotein  53.49 
 
 		 205 aa  156  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.38174  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1972  NLP/P60  56.62 
 
 		 212 aa  150  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107958  normal  0.172208 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1189  NLP/P60 protein  50 
 
 		 249 aa  150  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.103363  normal  0.0364754 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2283  NlpC/P60 family lipoprotein  47.8 
 
 		 404 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1397  NLP/P60 family lipoprotein  47.8 
 
 		 407 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.929375  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2408  NLP/P60 family lipoprotein  47.8 
 
 		 407 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166866  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5167  NLP/P60 family lipoprotein  46.24 
 
 		 364 aa  149  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1407  NLP/P60 protein  47.22 
 
 		 369 aa  149  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.374528 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1887  NLP/P60 family lipoprotein  47.8 
 
 		 407 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.850579  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0009  NLP/P60 family lipoprotein  47.8 
 
 		 407 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30529  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1160  NLP/P60 family lipoprotein  47.8 
 
 		 407 aa  149  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.812731  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2244  NlpC/P60 family lipoprotein  47.8 
 
 		 404 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3984  NLP/P60 protein  50 
 
 		 173 aa  149  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.499071  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1999  NLP/P60  54.96 
 
 		 226 aa  148  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0741  NLP/P60  46.67 
 
 		 167 aa  148  5e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.128662  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2186  NLP/P60 family lipoprotein  46.74 
 
 		 407 aa  147  8e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1890  NLP/P60 protein  45.65 
 
 		 363 aa  147  8e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00780805  hitchhiker  0.0000000811276 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6213  NLP/P60  45.65 
 
 		 363 aa  147  9e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.935456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1866  NLP/P60 protein  45.65 
 
 		 363 aa  147  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1776  NLP/P60 protein  44.74 
 
 		 353 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1267  NLP/P60 protein  48.15 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206085 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1746  NLP/P60 protein  41.11 
 
 		 203 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1669  NLP/P60 protein  50.4 
 
 		 214 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2393  putative transmembrane lipoprotein  44.51 
 
 		 404 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.951834  normal  0.103299 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0919  NLP/P60 protein  44.15 
 
 		 382 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0475791  normal  0.21921 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4049  NLP/P60 protein  48.18 
 
 		 212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  48.91 
 
 		 177 aa  145  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1804  NLP/P60 protein  46.45 
 
 		 354 aa  145  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1227  NLP/P60 protein  46.15 
 
 		 214 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19170  hypothetical protein  47.18 
 
 		 198 aa  144  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3684  NLP/P60  52.03 
 
 		 242 aa  144  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.49515  hitchhiker  0.00130241 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1794  NLP/P60 protein  42.55 
 
 		 418 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.435053  hitchhiker  0.00883906 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2733  NLP/P60 protein  56.06 
 
 		 190 aa  142  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0192428  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0019  NLP/P60 protein  45.56 
 
 		 160 aa  142  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0865382  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0001  NLP/P60 protein  44.97 
 
 		 160 aa  141  4e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.309085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0427  NLP/P60 protein  54.26 
 
 		 177 aa  141  6e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00285469  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1637  NLP/P60  50.39 
 
 		 226 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58461  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1705  NLP/P60 family protein  51.22 
 
 		 242 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2888  NLP/P60 protein  53.23 
 
 		 234 aa  139  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1982  NLP/P60 family protein  48.82 
 
 		 234 aa  139  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000770897  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  48.82 
 
 		 234 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  48.82 
 
 		 234 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  48.82 
 
 		 234 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  48.82 
 
 		 218 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  48.82 
 
 		 218 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  48.82 
 
 		 218 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  48.82 
 
 		 218 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  45.07 
 
 		 223 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  45.07 
 
 		 223 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  45.07 
 
 		 223 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  48.03 
 
 		 224 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5317  NLP/P60  44.29 
 
 		 205 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  47.24 
 
 		 221 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  47.24 
 
 		 221 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  39.47 
 
 		 275 aa  134  8e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.179042 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01625  predicted lipoprotein  39.47 
 
 		 271 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1868  NlpC/P60 family protein  39.47 
 
 		 271 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1985  NLP/P60 protein  39.47 
 
 		 271 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.778309  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1852  NlpC/P60 family protein  39.47 
 
 		 271 aa  134  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000302623  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2367  NlpC/P60 family protein  39.47 
 
 		 271 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00414236  normal  0.27776 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  45 
 
 		 224 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1734  NlpC/P60 family protein  39.47 
 
 		 271 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1974  NLP/P60 protein  39.47 
 
 		 271 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117191 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01615  hypothetical protein  39.47 
 
 		 271 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0018  NLP/P60 protein  46.72 
 
 		 188 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  47.24 
 
 		 223 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  47.24 
 
 		 223 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1379  NLP/P60 protein  46.46 
 
 		 223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0123318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2570  NlpC/P60 family lipoprotein  39.29 
 
 		 283 aa  132  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.117101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1864  NLP/P60 protein  39.29 
 
 		 283 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.617955  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1602  NlpC/P60 family protein  40.3 
 
 		 273 aa  131  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1742  NlpC/P60 family protein  40.3 
 
 		 273 aa  131  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000022854  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1528  NlpC/P60 family protein  40.3 
 
 		 273 aa  131  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1911  NlpC/P60 family protein  40.3 
 
 		 273 aa  131  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.569551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1542  NlpC/P60 family protein  40.3 
 
 		 273 aa  131  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0237599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1757  NlpC/P60 family lipoprotein  39.29 
 
 		 283 aa  131  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156191  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0373  NLP/P60 protein  45.26 
 
 		 208 aa  131  6e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1792  NLP/P60 protein  39.55 
 
 		 256 aa  130  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.851858  normal  0.0301658 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5092  NLP/P60 protein  46.04 
 
 		 207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4965  NLP/P60 protein  45.71 
 
 		 208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2197  NLP/P60 protein  38.67 
 
 		 273 aa  130  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.369734  hitchhiker  0.00000685507 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>