50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1652 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1652  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  391  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215639  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3726  hypothetical protein  90.58 
 
 		 191 aa  355  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3820  hypothetical protein  53.1 
 
 		 181 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391965 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1040  hypothetical protein  51.05 
 
 		 170 aa  152  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3096  hypothetical protein  50 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.880364  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4296  BRO-like  50.3 
 
 		 176 aa  141  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.836622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2833  hypothetical protein  37.5 
 
 		 170 aa  94.4  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.977223  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33290  hypothetical protein  36.81 
 
 		 251 aa  91.3  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00174462  normal  0.221973 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49500  hypothetical protein  33.33 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000177569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3400  prophage antirepressor  29.91 
 
 		 284 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000183753  unclonable  1.97476e-16 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1644  BRO domain-containing protein  35.64 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0834656  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3254  prophage antirepressor  26.53 
 
 		 270 aa  61.6  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000711854  decreased coverage  0.00000000000000707487 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1161  hypothetical protein  28.87 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00000000330342  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3521  BRO, N-terminal  27.1 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000239324  decreased coverage  0.000343043 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2462  BRO-like protein  25.25 
 
 		 248 aa  55.1  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000468179  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1000  BRO family protein  30.53 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.173667  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1165  prophage antirepressor  30.68 
 
 		 149 aa  53.5  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1367  prophage antirepressor  29.41 
 
 		 264 aa  52.8  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000214644  unclonable  1.53039e-25 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2380  BRO domain-containing protein  31.68 
 
 		 335 aa  52.4  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.016925  normal  0.26363 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1142  phage antirepressor protein  26.26 
 
 		 267 aa  52.4  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000418777  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1555  antirepressor protein  30.1 
 
 		 292 aa  52  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0345805  hitchhiker  0.000277946 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1877  prophage LambdaSa2, antirepressor protein, putative  23.71 
 
 		 236 aa  51.6  0.000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0256664  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5813  prophage antirepressor  29.11 
 
 		 256 aa  51.2  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3791  prophage antirepressor  28 
 
 		 283 aa  51.2  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3740  prophage antirepressor  28 
 
 		 283 aa  51.2  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0554  prophage antirepressor  28.16 
 
 		 269 aa  50.4  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.239939  hitchhiker  0.000124341 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2642  hypothetical protein  25.77 
 
 		 252 aa  49.7  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.226633  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2135  phage-encoded protein  24.04 
 
 		 260 aa  49.7  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000332219  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2133  phage antirepressor protein  27.08 
 
 		 244 aa  50.1  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.335904 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0898  prophage antirepressor  28.57 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.798648  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0575  prophage antirepressor  28 
 
 		 295 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0524  prophage antirepressor  28.4 
 
 		 259 aa  49.3  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.844398  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0803  prophage antirepressor  22.22 
 
 		 257 aa  48.9  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000145423  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1235  prophage antirepressor  21.65 
 
 		 263 aa  48.5  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298657  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0797  BRO, N-terminal  26.88 
 
 		 111 aa  48.1  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.651064  hitchhiker  0.00000114436 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1874  prophage antirepressor  22.12 
 
 		 299 aa  47.8  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000268327  normal  0.0527213 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2513  BRO, N-terminal  27.27 
 
 		 172 aa  47.8  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0512852  normal  0.446294 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0789  BRO, N-terminal  25.27 
 
 		 172 aa  47.4  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000825833 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1073  BRO family protein  25 
 
 		 313 aa  47.8  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00174599  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1181  prophage antirepressor  25 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000354678  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1616  hypothetical protein  27.84 
 
 		 151 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0345712  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4230  hypothetical protein  34.85 
 
 		 64 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1825  prophage antirepressor  25.69 
 
 		 535 aa  45.8  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1205  prophage antirepressor  25.69 
 
 		 535 aa  45.8  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.312147  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3073  prophage antirepressor  25.69 
 
 		 270 aa  44.7  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.229766  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1867  prophage antirepressor  23.96 
 
 		 272 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000186522  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1322  prophage antirepressor  24.42 
 
 		 236 aa  43.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000035001  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1177  hypothetical protein  25.25 
 
 		 420 aa  42  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.163274  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2402  prophage antirepressor  33.33 
 
 		 230 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3227  prophage antirepressor  29.76 
 
 		 252 aa  41.2  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.323772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>