More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1649 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  100 
 
 		 1001 aa  2020    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  48.38 
 
 		 1055 aa  843    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  47.18 
 
 		 1038 aa  822    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  92.41 
 
 		 1001 aa  1848    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  69.03 
 
 		 983 aa  1381    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  47.81 
 
 		 1028 aa  833    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  64.68 
 
 		 991 aa  1270    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  65.5 
 
 		 995 aa  1278    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  38.39 
 
 		 1033 aa  571  1e-161  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  37.81 
 
 		 1004 aa  563  1.0000000000000001e-159  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1263  serine protease  48.53 
 
 		 1129 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1063  serine protease  48.53 
 
 		 1131 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1327  serine protease  48.53 
 
 		 1131 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0234  serine protease  48.53 
 
 		 1131 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411978  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0506  serine protease  48.53 
 
 		 1131 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2572  serine protease  48.35 
 
 		 1129 aa  462  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1408  serine protease  48.35 
 
 		 1131 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0123331  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1429  serine protease  47.8 
 
 		 1130 aa  431  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.25 
 
 		 1125 aa  375  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  37.09 
 
 		 986 aa  339  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  37.23 
 
 		 995 aa  339  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  37.32 
 
 		 1119 aa  301  3e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  38.61 
 
 		 1029 aa  298  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.87 
 
 		 919 aa  290  8e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0132  outer membrane autotransporter barrel domain protein  38.53 
 
 		 972 aa  277  7e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  36.33 
 
 		 1550 aa  276  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2102  outer membrane autotransporter  27.7 
 
 		 1006 aa  275  3e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.24 
 
 		 1011 aa  273  8.000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1478  Outer membrane autotransporter barrel  32.77 
 
 		 650 aa  259  1e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.45 
 
 		 1227 aa  259  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  34.85 
 
 		 3506 aa  254  5.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  35.49 
 
 		 2365 aa  243  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  34.18 
 
 		 1508 aa  243  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  35.49 
 
 		 2346 aa  242  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7274  hypothetical protein  32.65 
 
 		 990 aa  239  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.45 
 
 		 1848 aa  238  5.0000000000000005e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  33.99 
 
 		 2003 aa  237  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.75 
 
 		 1285 aa  234  6e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  35.65 
 
 		 2396 aa  234  7.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  32.99 
 
 		 1782 aa  232  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  35.84 
 
 		 2371 aa  233  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  35.84 
 
 		 2366 aa  232  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  0.00000000166918 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  32.83 
 
 		 4238 aa  229  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  34.19 
 
 		 3954 aa  228  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  32.83 
 
 		 4238 aa  228  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  32.83 
 
 		 3822 aa  227  8e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  29.43 
 
 		 1881 aa  211  5e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3082  outer membrane autotransporter  33.22 
 
 		 1164 aa  203  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184876  normal  0.275156 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0137  outer membrane autotransporter  28.91 
 
 		 1519 aa  201  6e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1933  outer membrane autotransporter  32.06 
 
 		 1053 aa  196  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0182819 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3061  outer membrane autotransporter  31.19 
 
 		 677 aa  196  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.26513 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  30.51 
 
 		 1056 aa  195  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3607  outer membrane autotransporter  29.53 
 
 		 1333 aa  193  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  30.26 
 
 		 985 aa  191  5.999999999999999e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  33.27 
 
 		 994 aa  190  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1082  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.76 
 
 		 915 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3729  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.01 
 
 		 913 aa  184  7e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0892  autotransporter, putative  33.95 
 
 		 1016 aa  178  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2701  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.29 
 
 		 906 aa  177  9e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000419199  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3587  outer membrane autotransporter  32.63 
 
 		 1011 aa  169  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334084  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1123  outer membrane autotransporter  29.65 
 
 		 1062 aa  168  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948475  normal  0.876639 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2586  Outer membrane autotransporter barrel  24.98 
 
 		 1154 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501537  normal  0.680105 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.99 
 
 		 926 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2017  Outer membrane autotransporter barrel  25.46 
 
 		 1156 aa  160  9e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2277  outer membrane autotransporter  28.94 
 
 		 980 aa  159  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2147  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.47 
 
 		 1134 aa  157  7e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0135  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.19 
 
 		 910 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01745  serine protease  26.52 
 
 		 942 aa  149  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3532  outer membrane autotransporter  28.89 
 
 		 1152 aa  148  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3437  Outer membrane autotransporter  25.02 
 
 		 1179 aa  146  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0360967 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  29.04 
 
 		 2711 aa  145  5e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4232  beta strand repeat-containing protein  29.94 
 
 		 1446 aa  144  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.819177  normal  0.109622 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1114  serine protease  26.35 
 
 		 965 aa  144  7e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0955353  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  29.47 
 
 		 1180 aa  144  8e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.06 
 
 		 1081 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2063  autotransporter beta-domain-containing protein  26.92 
 
 		 954 aa  142  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217829  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24360  hypothetical protein  24.63 
 
 		 974 aa  139  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.861832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1371  serine protease  26.78 
 
 		 1121 aa  137  8e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0234  serine protease  27.32 
 
 		 998 aa  134  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.249897  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0453  outer membrane autotransporter  26.23 
 
 		 959 aa  132  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4538  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.1 
 
 		 710 aa  130  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1004  beta strand repeat-containing protein  26.03 
 
 		 909 aa  130  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.27 
 
 		 1489 aa  130  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0206  beta strand repeat-containing protein  26.88 
 
 		 970 aa  130  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0308  beta strand repeat-containing protein  26.87 
 
 		 970 aa  126  2e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.000000319801  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0340  serine protease  26.87 
 
 		 949 aa  126  2e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.000000485293  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2974  Outer membrane autotransporter barrel  28 
 
 		 814 aa  124  9e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4135  outer membrane autotransporter  31.29 
 
 		 407 aa  119  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00592356  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5638  Outer membrane autotransporter barrel  29.32 
 
 		 488 aa  115  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190969  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1417  serine protease  30.93 
 
 		 1175 aa  115  3e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3411  Outer membrane autotransporter barrel  29 
 
 		 1130 aa  114  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7520  outer membrane autotransporter domain-containing protein  25.94 
 
 		 1177 aa  114  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  25.88 
 
 		 1769 aa  108  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  25.68 
 
 		 1066 aa  107  9e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707412  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2954  autotransporter-associated beta strand repeat protein  25.2 
 
 		 947 aa  107  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0154236  hitchhiker  0.00450699 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  28.38 
 
 		 1459 aa  104  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1791  serine protease  27.14 
 
 		 1066 aa  103  1e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0261515  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  48.05 
 
 		 1532 aa  101  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.45 
 
 		 3629 aa  101  7e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00703  serine protease  30.64 
 
 		 911 aa  101  8e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.585891  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>