More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1563 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1563  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  100 
 
 
211 aa  426  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1372  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  98.58 
 
 
225 aa  423  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.12772  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1130  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  92.42 
 
 
225 aa  400  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.491382  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1621  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  89.62 
 
 
231 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.239641 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1515  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  88.15 
 
 
222 aa  384  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4156  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  89.62 
 
 
224 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.121865 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1175  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  89.62 
 
 
224 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.334554  normal  0.339213 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3023  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  88.15 
 
 
224 aa  380  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000027014 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4054  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  88.68 
 
 
225 aa  380  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.617904  hitchhiker  0.00000246992 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17460  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  87.68 
 
 
211 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38700  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  81.52 
 
 
226 aa  349  2e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0927  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  63.33 
 
 
218 aa  257  9e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1433  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  62.26 
 
 
221 aa  256  1e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0886457  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1250  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  59.24 
 
 
223 aa  241  3.9999999999999997e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.424545 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1122  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  58.91 
 
 
211 aa  239  1e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1430  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  56.73 
 
 
220 aa  239  2e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3434  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  59.41 
 
 
211 aa  239  2e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1121  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  58.91 
 
 
211 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.968624 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1192  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  58.91 
 
 
211 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2419  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  58.57 
 
 
219 aa  236  2e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1076  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  58.25 
 
 
216 aa  235  4e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1202  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  56.65 
 
 
211 aa  235  4e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00210603  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1287  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  57.89 
 
 
221 aa  234  7e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.711076  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2751  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  56.93 
 
 
211 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1243  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  56.44 
 
 
211 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.485227  hitchhiker  0.0000000000649527 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3121  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  56.44 
 
 
211 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0790  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  58.1 
 
 
213 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.745112  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3130  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  56.44 
 
 
211 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.507511  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1211  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  57.92 
 
 
216 aa  232  3e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3273  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  56.44 
 
 
211 aa  231  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3861  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  55.98 
 
 
212 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1828  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  57.89 
 
 
221 aa  229  2e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1058  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  56.44 
 
 
211 aa  229  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.939702  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1825  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  56.6 
 
 
223 aa  227  1e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.175242  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1191  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  56.44 
 
 
211 aa  226  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0060  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  57.84 
 
 
208 aa  224  8e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1296  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  53.59 
 
 
211 aa  223  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000136531 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1042  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  53.47 
 
 
211 aa  223  1e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1256  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.88 
 
 
232 aa  222  4e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.228462  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03724  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  54.03 
 
 
211 aa  222  4e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.32477  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3344  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  54.95 
 
 
211 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0110739  unclonable  0.0000000118337 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002514  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  55.88 
 
 
208 aa  218  5e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.861678  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3427  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  55.45 
 
 
208 aa  218  7e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0283834  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0960  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  55.45 
 
 
208 aa  218  7e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3295  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  55.45 
 
 
208 aa  218  7e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03519  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  55.39 
 
 
208 aa  216  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2634  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  55.92 
 
 
229 aa  215  2.9999999999999998e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3350  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  53.55 
 
 
208 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.463185  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0830  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  55.39 
 
 
208 aa  215  5e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.187281 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2523  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  55.5 
 
 
216 aa  214  8e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000284795  normal  0.0683463 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3507  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  54.41 
 
 
208 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3214  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  55.92 
 
 
208 aa  213  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0870  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.94 
 
 
208 aa  211  7.999999999999999e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2352  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O- methyltransferase  51.66 
 
 
319 aa  210  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.030137  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1835  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.13 
 
 
350 aa  208  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.270121  normal  0.20732 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1846  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  53.08 
 
 
310 aa  208  6e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6257  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  53.08 
 
 
310 aa  207  7e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0810528  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1822  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  53.08 
 
 
310 aa  207  7e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.522704  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1451  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.61 
 
 
309 aa  206  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.140233 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1733  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.61 
 
 
315 aa  206  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0943473  normal  0.0857588 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5123  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  52.11 
 
 
310 aa  206  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0354756  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1760  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.58 
 
 
310 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.916333  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0839  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.98 
 
 
208 aa  204  7e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.649779  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3132  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.83 
 
 
208 aa  204  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.146098 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3116  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.83 
 
 
208 aa  204  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.184656  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0496  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.96 
 
 
211 aa  204  8e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.300793  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3236  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.83 
 
 
208 aa  204  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3051  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.83 
 
 
208 aa  204  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0960  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  51.17 
 
 
327 aa  203  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2508  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  54.41 
 
 
208 aa  204  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1993  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  52.63 
 
 
210 aa  203  1e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3077  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.83 
 
 
208 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.701477 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1459  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.63 
 
 
225 aa  203  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00164  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  53.11 
 
 
225 aa  203  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0650575  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1919  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.63 
 
 
225 aa  202  3e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.837211  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1394  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50 
 
 
220 aa  201  7e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02593  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.61 
 
 
208 aa  201  8e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0945  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.61 
 
 
208 aa  201  8e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.134508  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2881  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.61 
 
 
208 aa  201  8e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3994  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.61 
 
 
208 aa  201  8e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3044  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.61 
 
 
208 aa  201  8e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.896677  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3131  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.61 
 
 
208 aa  201  8e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3016  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  51.94 
 
 
215 aa  201  8e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.583924  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02558  hypothetical protein  52.61 
 
 
208 aa  201  8e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0969  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.61 
 
 
208 aa  201  8e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.533941  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2868  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.61 
 
 
208 aa  201  8e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2224  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.61 
 
 
327 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.507646  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0547  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50 
 
 
259 aa  199  1.9999999999999998e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2367  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.58 
 
 
322 aa  199  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.621232  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2200  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.58 
 
 
322 aa  199  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.106158  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2238  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.58 
 
 
322 aa  199  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.33511  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1356  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.11 
 
 
322 aa  198  6e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.800899  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0051  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.11 
 
 
322 aa  198  6e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576463  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1846  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.11 
 
 
322 aa  198  6e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.197153  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2480  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  51.47 
 
 
214 aa  198  6e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1118  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.11 
 
 
331 aa  197  7e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1049  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.86 
 
 
314 aa  196  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85681  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1205  hypothetical protein  49.12 
 
 
321 aa  195  5.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0836  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  50.7 
 
 
226 aa  194  6e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.214261  normal  0.264106 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1524  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.04 
 
 
216 aa  194  7e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>