46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1364 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1364  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  288  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.646938  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0561  hypothetical protein  57.25 
 
 		 134 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5476  hypothetical protein  60.48 
 
 		 128 aa  159  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.880512  normal  0.34526 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4135  protein of unknown function DUF1486  56.92 
 
 		 134 aa  157  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5702  hypothetical protein  58.06 
 
 		 128 aa  153  8e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161292 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3766  hypothetical protein  58.06 
 
 		 128 aa  153  8e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4602  hypothetical protein  58.06 
 
 		 128 aa  153  8e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170557  normal  0.0512749 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0475  hypothetical protein  56.8 
 
 		 130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.882422  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4033  hypothetical protein  58.06 
 
 		 128 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.243937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4099  protein of unknown function DUF1486  55.65 
 
 		 132 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000310906  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4044  hypothetical protein  58.87 
 
 		 151 aa  149  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233017  normal  0.541602 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4491  hypothetical protein  57.26 
 
 		 128 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1135  hypothetical protein  54.62 
 
 		 136 aa  148  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168418  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4171  hypothetical protein  54.84 
 
 		 286 aa  145  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4095  hypothetical protein  54.84 
 
 		 286 aa  145  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2712  protein of unknown function DUF1486  53.6 
 
 		 138 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6920  hypothetical protein  56.1 
 
 		 128 aa  143  9e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4326  hypothetical protein  54.03 
 
 		 286 aa  142  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0121723  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4437  hypothetical protein  57.14 
 
 		 126 aa  142  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.195339  normal  0.857866 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4630  protein of unknown function DUF1486  53.23 
 
 		 126 aa  142  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  0.196817 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3939  hypothetical protein  51.94 
 
 		 135 aa  141  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1364  hypothetical protein  52.85 
 
 		 127 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0619  hypothetical protein  50 
 
 		 128 aa  137  6e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.619761  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46310  hypothetical protein  56.03 
 
 		 135 aa  135  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0677929  normal  0.0352526 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2254  protein of unknown function DUF1486  52.1 
 
 		 134 aa  135  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.416383  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4646  protein of unknown function DUF1486  50 
 
 		 134 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.701678  normal  0.971312 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0952  protein of unknown function DUF1486  33.33 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0666254  decreased coverage  0.00444563 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3974  hypothetical protein  33 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26760  predicted ester cyclase  38.67 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.683774  normal  0.316469 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5626  protein of unknown function DUF1486  27.93 
 
 		 147 aa  51.2  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1624  hypothetical protein  28.3 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000580657 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2953  ester cyclase-like  30 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0819  hypothetical protein  39.74 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0339  protein of unknown function DUF1486  25.83 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.175362  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0659  protein of unknown function DUF1486  23.81 
 
 		 145 aa  43.5  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.984641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0498  hypothetical protein  23.81 
 
 		 145 aa  43.5  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.0035037  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6742  protein of unknown function DUF1486  32.43 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2161  protein of unknown function DUF1486  33.8 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395088  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1022  putative lipoprotein  29.59 
 
 		 179 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36501  predicted protein  28.24 
 
 		 284 aa  42.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260623  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0316  protein of unknown function DUF1486  23.81 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5286  hypothetical protein  25 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4651  hypothetical protein  27.85 
 
 		 186 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0837  putative lipoprotein  28.57 
 
 		 179 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.461005  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0797  putative lipoprotein  28.57 
 
 		 182 aa  40.4  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.430815  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0996  protein of unknown function DUF1486  29.89 
 
 		 173 aa  40.4  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>