More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1356 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  100 
 
 
228 aa  466  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  94.74 
 
 
228 aa  448  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  79.82 
 
 
227 aa  377  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  76.55 
 
 
230 aa  360  7.0000000000000005e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  79.72 
 
 
233 aa  360  8e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  77.48 
 
 
230 aa  359  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  76.02 
 
 
234 aa  355  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  76.42 
 
 
234 aa  355  3.9999999999999996e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  75.57 
 
 
234 aa  354  5.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  76.26 
 
 
239 aa  353  1e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  76.71 
 
 
239 aa  352  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  76.02 
 
 
239 aa  352  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  75.65 
 
 
231 aa  349  2e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  75.89 
 
 
233 aa  348  5e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  72.12 
 
 
232 aa  344  6e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  74.31 
 
 
227 aa  336  1.9999999999999998e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  69.16 
 
 
230 aa  334  7.999999999999999e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  72.94 
 
 
247 aa  330  2e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  70.72 
 
 
241 aa  319  1.9999999999999998e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  54.42 
 
 
389 aa  254  6e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  52.94 
 
 
231 aa  241  5e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  49.78 
 
 
240 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  51.08 
 
 
236 aa  216  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  53.39 
 
 
226 aa  216  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  52.94 
 
 
226 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  49.78 
 
 
240 aa  211  5.999999999999999e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  51.15 
 
 
223 aa  211  5.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  52.49 
 
 
226 aa  211  7e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  53.24 
 
 
240 aa  210  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  51.16 
 
 
223 aa  209  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  52.38 
 
 
230 aa  204  7e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  51.47 
 
 
225 aa  202  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2765  isochorismatase hydrolase  51.95 
 
 
230 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2809  isochorismatase hydrolase  51.95 
 
 
230 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.168317 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  49.01 
 
 
228 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  48.83 
 
 
223 aa  199  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  48.18 
 
 
231 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  49.77 
 
 
231 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  46.95 
 
 
222 aa  195  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  47.42 
 
 
222 aa  195  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  47.85 
 
 
232 aa  194  8.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03716  conserved hypothetical protein  48.9 
 
 
222 aa  194  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03665  hypothetical protein  48.9 
 
 
222 aa  194  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4203  isochorismatase family protein  48.9 
 
 
222 aa  194  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000421381 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  48.84 
 
 
233 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  44.59 
 
 
227 aa  188  5e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  45.79 
 
 
236 aa  186  2e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  49.02 
 
 
225 aa  184  8e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0764  hypothetical protein  52.24 
 
 
229 aa  182  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0418642  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1649  isochorismatase hydrolase  38.04 
 
 
281 aa  168  7e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.137775  normal  0.599986 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  39.51 
 
 
266 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  39.89 
 
 
274 aa  125  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  35.81 
 
 
264 aa  122  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  35.56 
 
 
241 aa  113  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  34.18 
 
 
231 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  33.67 
 
 
230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  33.67 
 
 
231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  33.67 
 
 
231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  33.67 
 
 
231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  33.67 
 
 
230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  34.27 
 
 
231 aa  108  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  34.66 
 
 
252 aa  107  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  33.71 
 
 
231 aa  106  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  33.7 
 
 
233 aa  105  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  31.63 
 
 
248 aa  103  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17210  nicotinamidase-like amidase  33.52 
 
 
256 aa  104  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  29.58 
 
 
244 aa  103  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  31.78 
 
 
248 aa  102  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  31.96 
 
 
246 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  31 
 
 
245 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  33.16 
 
 
230 aa  100  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  36.02 
 
 
212 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1076  isochorismatase hydrolase  32.69 
 
 
247 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.029222 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  31.78 
 
 
248 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  29.51 
 
 
201 aa  95.9  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  32.45 
 
 
204 aa  94.7  9e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  30.19 
 
 
258 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.418934 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  36.02 
 
 
227 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  34.01 
 
 
213 aa  92.8  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  33.15 
 
 
191 aa  92.4  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  31.22 
 
 
213 aa  90.5  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  30.65 
 
 
217 aa  90.1  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  30.94 
 
 
205 aa  88.2  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  32.43 
 
 
201 aa  88.2  9e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  33.85 
 
 
224 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0181  isochorismatase hydrolase  32.52 
 
 
247 aa  85.9  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72660  hypothetical protein  30.73 
 
 
217 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280253  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  31.72 
 
 
201 aa  85.1  7e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6308  hypothetical protein  30.24 
 
 
217 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18103  predicted protein  28.71 
 
 
214 aa  82  0.000000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000572408  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  32.12 
 
 
193 aa  81.6  0.000000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2775  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
189 aa  81.6  0.000000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0016707  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2058  isochorismatase hydrolase  30.24 
 
 
214 aa  81.6  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  30.6 
 
 
204 aa  81.3  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3317  isochorismatase hydrolase  30.21 
 
 
193 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  31.89 
 
 
214 aa  81.6  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4193  isochorismatase hydrolase  27.88 
 
 
226 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  26.84 
 
 
224 aa  80.5  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  27.75 
 
 
221 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  30.15 
 
 
192 aa  79.7  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>