More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1354 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  100 
 
 		 225 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  83.56 
 
 		 225 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  67.44 
 
 		 231 aa  296  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  65.89 
 
 		 231 aa  290  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  65.12 
 
 		 223 aa  276  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  62.1 
 
 		 223 aa  267  1e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  58.04 
 
 		 236 aa  260  1e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1649  isochorismatase hydrolase  53.11 
 
 		 281 aa  256  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.137775  normal  0.599986 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  58.45 
 
 		 222 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  57.53 
 
 		 222 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0764  hypothetical protein  61.68 
 
 		 229 aa  251  7e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0418642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  59.91 
 
 		 240 aa  248  4e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  54.55 
 
 		 236 aa  248  5e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  57.75 
 
 		 228 aa  246  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  58.33 
 
 		 232 aa  244  6e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  55.61 
 
 		 230 aa  244  6e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  56.88 
 
 		 240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  59.72 
 
 		 226 aa  237  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  59.26 
 
 		 226 aa  234  6e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  58.45 
 
 		 226 aa  234  6e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  58.06 
 
 		 233 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2765  isochorismatase hydrolase  56.62 
 
 		 230 aa  229  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2809  isochorismatase hydrolase  56.62 
 
 		 230 aa  229  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.168317 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  54.76 
 
 		 223 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03716  conserved hypothetical protein  56.8 
 
 		 222 aa  206  3e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03665  hypothetical protein  56.8 
 
 		 222 aa  206  3e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4203  isochorismatase family protein  56.8 
 
 		 222 aa  206  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000421381 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  49.31 
 
 		 227 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  51.71 
 
 		 239 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  51.22 
 
 		 239 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  46.72 
 
 		 232 aa  194  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  45.16 
 
 		 389 aa  192  3e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  50.73 
 
 		 239 aa  192  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  49.28 
 
 		 227 aa  192  3e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  47.32 
 
 		 230 aa  192  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  49.11 
 
 		 233 aa  191  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  47.27 
 
 		 230 aa  189  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  47.62 
 
 		 247 aa  187  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  46.43 
 
 		 231 aa  186  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  48.15 
 
 		 234 aa  186  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  49.02 
 
 		 228 aa  184  8e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  47.3 
 
 		 241 aa  184  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  44.95 
 
 		 233 aa  182  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  43.66 
 
 		 230 aa  181  8.000000000000001e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  45.12 
 
 		 227 aa  180  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  48.04 
 
 		 228 aa  180  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  45.54 
 
 		 234 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  45.37 
 
 		 234 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  41.86 
 
 		 231 aa  156  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  40 
 
 		 240 aa  148  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  30.81 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  30.3 
 
 		 231 aa  109  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  30.3 
 
 		 230 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  30.3 
 
 		 231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  30.3 
 
 		 230 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  30.3 
 
 		 231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  32.14 
 
 		 241 aa  108  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  30.3 
 
 		 231 aa  108  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  30.16 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  29.68 
 
 		 248 aa  104  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  33.84 
 
 		 274 aa  101  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  31.96 
 
 		 266 aa  97.4  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  29.33 
 
 		 233 aa  97.4  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  30.81 
 
 		 230 aa  97.4  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  32.63 
 
 		 264 aa  96.7  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  28.11 
 
 		 244 aa  90.5  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72660  hypothetical protein  33.5 
 
 		 217 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2058  isochorismatase hydrolase  31.53 
 
 		 214 aa  89  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6308  hypothetical protein  31.53 
 
 		 217 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  31.07 
 
 		 221 aa  87.4  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  33.9 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  27.43 
 
 		 248 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  28.72 
 
 		 245 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0780  isochorismatase hydrolase  30.48 
 
 		 243 aa  82  0.000000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.473619  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  33.71 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  27.27 
 
 		 252 aa  81.3  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17210  nicotinamidase-like amidase  32.09 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  30.05 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2701  isochorismatase  29.53 
 
 		 168 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4490  isochorismatase hydrolase  29.25 
 
 		 220 aa  80.5  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0028  isochorismatase hydrolase  32.52 
 
 		 247 aa  80.1  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.123472 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  27.94 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  31.03 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  29.74 
 
 		 201 aa  77.8  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  27.69 
 
 		 246 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2680  isochorismatase  28.19 
 
 		 176 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  32 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5346  isochorismatase hydrolase  26.77 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708564  normal  0.524133 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  34.64 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  26.34 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.418934 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  32.24 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  30.73 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  26.99 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1076  isochorismatase hydrolase  28.72 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.029222 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0212  isochorismatase hydrolase  31.28 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2598  isochorismatase hydrolase  30.36 
 
 		 181 aa  74.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  28.86 
 
 		 176 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  28.86 
 
 		 176 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  28.85 
 
 		 359 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  28.92 
 
 		 181 aa  74.3  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>