More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1352 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1352  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 228 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1161  transcriptional regulator GntR  90.35 
 
 		 228 aa  420  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1375  GntR family transcriptional regulator  58.69 
 
 		 252 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473972  normal  0.0210118 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0770  GntR family transcriptional regulator  57.21 
 
 		 255 aa  247  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0774402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3020  GntR family transcriptional regulator  57.87 
 
 		 239 aa  246  3e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5236  transcriptional regulator, GntR family  57.75 
 
 		 252 aa  245  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0702  GntR family transcriptional regulator  54.59 
 
 		 240 aa  239  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1420  GntR family transcriptional regulator  54.38 
 
 		 236 aa  229  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  52.27 
 
 		 254 aa  224  8e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0841  GntR family transcriptional regulator  51.57 
 
 		 247 aa  222  4e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2162  transcriptional regulator, GntR family  52.53 
 
 		 262 aa  214  7e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1104  transcriptional regulator, GntR family  50.23 
 
 		 266 aa  208  6e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2501  transcriptional regulator, GntR family  51.15 
 
 		 262 aa  206  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365709  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3836  GntR family transcriptional regulator  49.33 
 
 		 312 aa  203  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.155558  normal  0.0735717 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2564  transcriptional regulator GntR  48.37 
 
 		 246 aa  195  6e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2747  transcriptional regulator, GntR family  45.37 
 
 		 233 aa  188  7e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.756614  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 260 aa  175  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  37.74 
 
 		 238 aa  145  6e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5040  GntR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.435911  normal  0.566869 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16960  transcriptional regulator, GntR family  39.6 
 
 		 229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.916885 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  35.68 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  36.98 
 
 		 244 aa  99  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0677  GntR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 254 aa  97.8  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5712  transcriptional regulator, GntR family  30.52 
 
 		 223 aa  97.4  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.678342 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  31.37 
 
 		 239 aa  97.1  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0705  transcriptional regulator, GntR family  35.41 
 
 		 243 aa  95.9  5e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000407645 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 216 aa  95.1  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6449  transcriptional regulator, GntR family  34.43 
 
 		 236 aa  95.1  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110693  normal  0.091376 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1405  GntR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 222 aa  92.8  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359865 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 		 217 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 212 aa  91.7  8e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 214 aa  89.4  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5092  GntR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 217 aa  89  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344916 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1021  GntR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 231 aa  88.6  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.698861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4063  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 243 aa  87.4  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.299746  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1829  GntR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 246 aa  87  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 227 aa  86.7  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28700  transcriptional regulator, GntR family  33.83 
 
 		 243 aa  86.3  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.915743  normal  0.0614661 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3952  GntR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 221 aa  85.9  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.942603  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  30.33 
 
 		 212 aa  85.9  5e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4656  transcriptional regulator, GntR family  29.15 
 
 		 237 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  27.8 
 
 		 227 aa  85.5  6e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0417  GntR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 254 aa  85.1  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  32.11 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4468  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3368  transcriptional regulator, GntR family  29.73 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646565  normal  0.0258143 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 232 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3216  GntR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0185552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  32.18 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5350  transcriptional regulator, GntR family  27.57 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1303  GntR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 238 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153269  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  34.09 
 
 		 216 aa  81.3  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5406  transcriptional regulator, GntR family  27.57 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.723673  hitchhiker  0.00193724 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6398  transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0568  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 396 aa  80.1  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 221 aa  79.7  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2332  transcriptional regulator, GntR family  24.41 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.738063 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1922  GntR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.430018 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  30.5 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  29.56 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  31.05 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 242 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5069  GntR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 247 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.046054  normal  0.249885 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0287  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 242 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00895  transcription regulator protein  33.49 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0473063  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1377  transcriptional regulator, GntR family  29.15 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322083  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 213 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5228  transcriptional regulator, GntR family  30.95 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  30.65 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1138  GntR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128923 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0297  transcriptional regulator, GntR family  30.41 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5027  transcriptional regulator, GntR family  26.83 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  28.3 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 218 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5344  transcriptional regulator, GntR family  30.1 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227261  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1913  transcriptional regulator, GntR family  30.39 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5097  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1304  GntR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0497792 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1281  GntR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1244  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.487831 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6216  transcriptional regulator, GntR family  28.06 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 239 aa  75.1  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5826  GntR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000644703 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 253 aa  75.5  0.0000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3145  GntR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>