More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1313 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1313  pili assembly chaperone  100 
 
 		 250 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.654177  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1132  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  72.4 
 
 		 264 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.083408 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0831  Pili assembly chaperone, N-terminal  43.93 
 
 		 248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.440668  normal  0.119444 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3043  pili assembly chaperone  42.62 
 
 		 249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000936481  normal  0.260101 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3754  pili assembly chaperone  42.37 
 
 		 248 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3923  Pili assembly chaperone, N-terminal  42.92 
 
 		 247 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.358656  normal  0.566628 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3810  Pili assembly chaperone, N-terminal  42.92 
 
 		 247 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0391987  normal  0.124157 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0762  Pili assembly chaperone, N-terminal  41.55 
 
 		 248 aa  161  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.0172596 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  39.18 
 
 		 243 aa  159  6e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51460  chaperone CupC  39.01 
 
 		 237 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0145666  hitchhiker  0.000165686 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3291  Pili assembly chaperone, N-terminal  39.73 
 
 		 238 aa  154  9e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0353367 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2971  putative fimbrial chaperone protein  35.42 
 
 		 247 aa  148  8e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1317  fimbral chaperone protein  41.07 
 
 		 260 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.367695  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6637  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.66 
 
 		 250 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480181  hitchhiker  0.00000000170705 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  34.62 
 
 		 241 aa  143  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0053  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.66 
 
 		 266 aa  143  3e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.541811  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0064  chaperone protein precursor  35.66 
 
 		 266 aa  142  5e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00812776  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  35 
 
 		 241 aa  141  8e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00139  predicted periplasmic pilin chaperone  35.08 
 
 		 246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0365328  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  32.65 
 
 		 245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0143  putative chaperone protein EcpD  35.08 
 
 		 246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000190021  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0151  putative chaperone protein EcpD  35.51 
 
 		 246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00134354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0143  putative chaperone protein EcpD  35.08 
 
 		 246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867572  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00138  hypothetical protein  35.08 
 
 		 246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0326342  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  35.17 
 
 		 227 aa  138  7.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3462  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.08 
 
 		 246 aa  138  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000279745  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5937  pili assembly chaperone  35.06 
 
 		 260 aa  138  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6928  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.07 
 
 		 265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.811433 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2236  pili assembly chaperone  34.12 
 
 		 233 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.918746  normal  0.0175555 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1134  pili assembly chaperone  35.71 
 
 		 261 aa  136  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal  0.162532 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0575  pili assembly chaperone  34.73 
 
 		 256 aa  135  8e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0839  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  36.94 
 
 		 251 aa  135  9e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1818  pili assembly chaperone  35.54 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000389193 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6668  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.12 
 
 		 244 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0489694 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  36 
 
 		 226 aa  133  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3033  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.37 
 
 		 243 aa  133  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4960  pili assembly chaperone  34.53 
 
 		 234 aa  132  6e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0268456  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3852  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  35.68 
 
 		 232 aa  132  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5934  pili assembly chaperone  32.77 
 
 		 253 aa  131  9e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1695  twin-arginine translocation pathway signal  34.22 
 
 		 257 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.734718  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3961  putative pili assembly chaperone, N- domain  35.68 
 
 		 232 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4251  periplasmic pilus chaperone  36.04 
 
 		 250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.253121 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4023  pili assembly chaperone  34.17 
 
 		 246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4022  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  35.68 
 
 		 232 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3917  putative pili assembly chaperone, N- domain  35.68 
 
 		 232 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.878446 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3975  putative chaperone protein EcpD  33.9 
 
 		 247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1022  fimbrial chaperone protein  34.89 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.490389  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2232  fimbrial chaperone protein  34.73 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0389823  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0116  fimbrial chaperone protein ecpD  35.11 
 
 		 241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2032  fimbrial assembly chaperone protein  35.32 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2089  fimbrial assembly chaperone protein  34.73 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0210  putative chaperone protein EcpD  35.48 
 
 		 250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.304462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1015  chaperone CupB2  35.42 
 
 		 248 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  31.98 
 
 		 225 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1054  pili assembly chaperone  36.61 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0368487 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4921  chaperone protein FimC  34.05 
 
 		 229 aa  126  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1465  pili assembly chaperone  32.88 
 
 		 244 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548977 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0151  fimbrial assembly chaperone protein  34.36 
 
 		 236 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1535  Pili assembly chaperone, N-terminal  32.37 
 
 		 266 aa  125  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0256445  normal  0.556062 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1599  chaperone protein EcpD precursor  34.36 
 
 		 240 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307824  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0655  chaperone protein FimC  38.07 
 
 		 237 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0127  fimbrial assembly chaperone protein  34.36 
 
 		 245 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0594  chaperone protein FimC  37.61 
 
 		 230 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.152719 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4095  long polar fimbrial operon protein LpfB  34.31 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0598  chaperone protein FimC  37.61 
 
 		 230 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.417884  normal  0.056011 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0590  chaperone protein FimC  37.61 
 
 		 230 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0318933 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0591  chaperone protein FimC  37.61 
 
 		 230 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00455551  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4242  pili assembly chaperone protein  33.89 
 
 		 243 aa  122  6e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2038  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  32.17 
 
 		 248 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.361686  normal  0.374928 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0192  chaperone protein FimC  35.38 
 
 		 227 aa  121  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1533  Pili assembly chaperone, N-terminal  36.28 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.981289  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0191  chaperone protein FimC  33.96 
 
 		 227 aa  119  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11070  chaperone CupB2  33.05 
 
 		 248 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.745503  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2282  Pili assembly chaperone, N-terminal  32.07 
 
 		 234 aa  119  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578603  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0208  chaperone protein FimC  34.91 
 
 		 227 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0085  pili assembly chaperone  28.96 
 
 		 234 aa  118  7e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0989  pili assembly chaperone  33.33 
 
 		 230 aa  118  7e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0200  chaperone protein FimC  33.49 
 
 		 227 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.873819  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1890  pili assembly chaperone  29.78 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000417223 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2229  chaperone protein PapD  31.03 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.482953  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2119  periplasmic pilus chaperone family protein  33.88 
 
 		 236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.423034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3747  pili assembly chaperone  33.66 
 
 		 234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.81685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0573  chaperone protein FimC  32.3 
 
 		 230 aa  116  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0096123  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0195  chaperone protein FimC  33.02 
 
 		 227 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857802  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4461  gram-negative pili assembly chaperone protein  34.53 
 
 		 224 aa  116  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1665  periplasmic pilus chaperone family protein  33.2 
 
 		 236 aa  115  5e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.656199 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3625  pili assembly chaperone protein  33.19 
 
 		 231 aa  115  5e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1017  chaperone CupB4  33.33 
 
 		 250 aa  115  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218387  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03010  predicted periplasmic pilin chaperone  33.62 
 
 		 231 aa  115  6e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3335  pili assembly chaperone protein  33.62 
 
 		 231 aa  115  6e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.63342  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0555  pili assembly chaperone  33.62 
 
 		 231 aa  115  6e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.970343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02961  hypothetical protein  33.62 
 
 		 231 aa  115  6e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2659  fimbrial assembly chaperone protein  30.91 
 
 		 245 aa  115  6.9999999999999995e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0270298  normal  0.0110591 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0576  chaperone protein FimC-like protein  31.86 
 
 		 230 aa  115  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.128277  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00481  pilin chaperone, periplasmic  31.86 
 
 		 230 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00486  hypothetical protein  31.86 
 
 		 230 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3082  Pili assembly chaperone, N-terminal  31.86 
 
 		 230 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3091  pili assembly chaperone  31.86 
 
 		 230 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.554326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4194  long polar fimbrial operon protein LpfB  33.05 
 
 		 243 aa  115  8.999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1676  fimbrial assembly chaperone protein  31.28 
 
 		 245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315033  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>