More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1152 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1152  HDIG domain protein  100 
 
 		 395 aa  815    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0994  metal-dependent phosphohydrolase  85.32 
 
 		 393 aa  701    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0187  HDIG  55.06 
 
 		 401 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10820  HDIG domain-containing protein  55.2 
 
 		 414 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768614  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0987  hypothetical protein  53.6 
 
 		 427 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0121413  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1495  metal dependent phosphohydrolase, HD region  52.22 
 
 		 404 aa  426  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0636739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1096  hypothetical protein  51.59 
 
 		 409 aa  419  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0739  metal dependent phosphohydrolase  49.88 
 
 		 411 aa  409  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1617  metal dependent phosphohydrolase  51.49 
 
 		 410 aa  405  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.035653 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2515  hypothetical protein  51.49 
 
 		 402 aa  403  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0603316  decreased coverage  0.00307837 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1532  metal dependent phosphohydrolase  50.61 
 
 		 413 aa  404  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0592  metal dependent phosphohydrolase  48.95 
 
 		 431 aa  401  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3329  metal dependent phosphohydrolase  50.25 
 
 		 399 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0192459  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0366  metal dependent phosphohydrolase  48.45 
 
 		 419 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.364375  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2378  metal dependent phosphohydrolase  48.51 
 
 		 402 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2783  metal dependent phosphohydrolase  47.64 
 
 		 403 aa  376  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1010  metal dependent phosphohydrolase  47.19 
 
 		 419 aa  370  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03945  putative signal protein with HD-GYP domain  44.76 
 
 		 419 aa  371  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4124  metal dependent phosphohydrolase  55.91 
 
 		 372 aa  352  4e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1802  metal-dependent phosphohydrolase  42.2 
 
 		 413 aa  309  5.9999999999999995e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0592  hypothetical protein  39.95 
 
 		 403 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5388  metal dependent phosphohydrolase  38.77 
 
 		 446 aa  299  5e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0518  metal dependent phosphohydrolase  39.15 
 
 		 406 aa  298  9e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.454264 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0505  metal dependent phosphohydrolase  39.85 
 
 		 404 aa  297  2e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.311766  normal  0.892483 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1822  metal dependent phosphohydrolase  37.73 
 
 		 395 aa  297  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.248214  normal  0.0148052 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0582  metal dependent phosphohydrolase  37.76 
 
 		 400 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3662  metal dependent phosphohydrolase  33.75 
 
 		 402 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0279  metal dependent phosphohydrolase  35.52 
 
 		 424 aa  244  1.9999999999999999e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000015793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0670  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 386 aa  228  1e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.150341  hitchhiker  0.000000203392 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1865  metal dependent phosphohydrolase  34.49 
 
 		 377 aa  228  2e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4444  metal dependent phosphohydrolase  32.51 
 
 		 396 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2918  metal dependent phosphohydrolase  35 
 
 		 390 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.271043  normal  0.722363 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4069  metal dependent phosphohydrolase  32.79 
 
 		 396 aa  222  9e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3871  metal dependent phosphohydrolase  32.79 
 
 		 396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4711  HD domain-containing protein  32.14 
 
 		 394 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1719  metal dependent phosphohydrolase  39.39 
 
 		 402 aa  219  5e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1680  metal dependent phosphohydrolase  32.3 
 
 		 401 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4304  metal dependent phosphohydrolase  31.97 
 
 		 396 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0096  metal dependent phosphohydrolase  31.97 
 
 		 396 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1233  TRAP dicarboxylate transporter, DctM subunit  33.33 
 
 		 390 aa  218  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1823  metal dependent phosphohydrolase  31.06 
 
 		 405 aa  218  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0845  metal dependent phosphohydrolase  33.73 
 
 		 429 aa  217  2.9999999999999998e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242914  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0350  metal-dependent phosphohydrolase  30.52 
 
 		 406 aa  216  4e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4249  metal dependent phosphohydrolase  32.24 
 
 		 396 aa  216  5e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3954  metal dependent phosphohydrolase  31.69 
 
 		 411 aa  216  5e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3456  metal dependent phosphohydrolase  35.25 
 
 		 412 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3861  metal dependent phosphohydrolase  31.69 
 
 		 411 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0063  metal-dependent phosphohydrolase  33.24 
 
 		 404 aa  215  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174704  normal  0.452255 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3670  metal dependent phosphohydrolase  32.51 
 
 		 401 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0100  metal dependent phosphohydrolase  29.89 
 
 		 392 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0137  HD domain-containing protein  31.34 
 
 		 392 aa  212  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4083  metal dependent phosphohydrolase  30.61 
 
 		 394 aa  209  7e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0215  metal-dependent phosphohydrolase  32.25 
 
 		 400 aa  209  7e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2259  metal dependent phosphohydrolase  31.39 
 
 		 400 aa  209  7e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12698  normal  0.0858358 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02542  hypothetical protein  30.16 
 
 		 403 aa  208  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003582  HD-domain protein  30.34 
 
 		 405 aa  207  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1799  metal dependent phosphohydrolase domain-containing protein  31.71 
 
 		 410 aa  208  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4285  metal dependent phosphohydrolase  32.43 
 
 		 388 aa  206  5e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00317648  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3098  metal dependent phosphohydrolase  35.53 
 
 		 304 aa  206  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.867396  normal  0.800633 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0329  metal dependent phosphohydrolase  31.42 
 
 		 448 aa  206  5e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3785  metal dependent phosphohydrolase  32.36 
 
 		 436 aa  205  9e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915661  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4619  HD domain-containing protein  33.23 
 
 		 389 aa  205  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0698  putative metal dependent phosphohydrolase  30.26 
 
 		 439 aa  205  1e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04078  metal dependent phosphohydrolase  32.25 
 
 		 398 aa  202  7e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3912  metal dependent phosphohydrolase  30.08 
 
 		 397 aa  202  9e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2829  metal dependent phosphohydrolase  33.44 
 
 		 304 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.131607  normal  0.233959 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0136  putative metal dependent phosphohydrolase  30.81 
 
 		 398 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2450  metal dependent phosphohydrolase  32.8 
 
 		 401 aa  201  3e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.573389 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2399  metal-dependent phosphohydrolase  28.05 
 
 		 417 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1140  metal dependent phosphohydrolase  35.05 
 
 		 395 aa  197  3e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0146  metal dependent phosphohydrolase  29.09 
 
 		 391 aa  196  6e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2944  metal dependent phosphohydrolase  36.75 
 
 		 349 aa  195  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5380  metal dependent phosphohydrolase  35.12 
 
 		 319 aa  193  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.946632 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1218  metal dependent phosphohydrolase  30.05 
 
 		 448 aa  188  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3202  metal dependent phosphohydrolase  29.73 
 
 		 441 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.117462  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1832  metal dependent phosphohydrolase  32.67 
 
 		 350 aa  182  7e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.49605  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3529  metal dependent phosphohydrolase  34.41 
 
 		 372 aa  182  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0195  metal dependent phosphohydrolase  40.16 
 
 		 373 aa  181  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2150  metal dependent phosphohydrolase  34.98 
 
 		 364 aa  180  4e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2138  metal dependent phosphohydrolase  36.29 
 
 		 369 aa  180  4e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1192  metal dependent phosphohydrolase  38.91 
 
 		 364 aa  178  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.050597  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2263  metal dependent phosphohydrolase  37.45 
 
 		 389 aa  177  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.442932 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1419  metal dependent phosphohydrolase  38.6 
 
 		 350 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1234  HD-GYP domain-containing protein  30 
 
 		 424 aa  174  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3231  metal dependent phosphohydrolase  35.81 
 
 		 366 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1193  metal dependent phosphohydrolase  34.23 
 
 		 373 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.364245  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0755  HD-GYP domain-containing protein  35.04 
 
 		 443 aa  166  5e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000768118  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1502  metal dependent phosphohydrolase  26.93 
 
 		 377 aa  165  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.858643  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0640  metal dependent phosphohydrolase  32.28 
 
 		 369 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4093  metal dependent phosphohydrolase  34.52 
 
 		 436 aa  161  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3755  metal-dependent phosphohydrolase  32.41 
 
 		 435 aa  160  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.912761 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03089  metal-dependent phosphohydrolase domain  24.33 
 
 		 395 aa  159  6e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3998  metal dependent phosphohydrolase  34.52 
 
 		 436 aa  159  6e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.541607  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0287  HD domain-containing protein  33.09 
 
 		 453 aa  159  7e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0364333  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2651  metal dependent phosphohydrolase  32.93 
 
 		 370 aa  159  9e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1504  metal dependent phosphohydrolase  30.1 
 
 		 388 aa  159  9e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.438459  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1451  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 366 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32319  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3275  metal dependent phosphohydrolase  35.46 
 
 		 448 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.003044  normal  0.177194 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0203  metal dependent phosphohydrolase  35.08 
 
 		 360 aa  152  8e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.640069  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3124  metal dependent phosphohydrolase  35.51 
 
 		 341 aa  152  8.999999999999999e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.759811 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>