More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1074 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0849  glycosyl transferase family protein  55.68 
 
 		 625 aa  689    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.33844 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  57.66 
 
 		 1509 aa  1790    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1074  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 		 1561 aa  3229    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.755532  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0883  glycosyl transferase family 2  50.57 
 
 		 723 aa  676    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  57.81 
 
 		 632 aa  721    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0396  glycosyl transferase family protein  55.93 
 
 		 625 aa  715    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0878  glycosyl transferase family protein  55.93 
 
 		 625 aa  715    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1492  glycosyl transferase family 2  56.29 
 
 		 958 aa  635  1e-180  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3973  glycosyl transferase family protein  53.38 
 
 		 1275 aa  617  1e-175  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0288  glycosyl transferase family protein  49.7 
 
 		 709 aa  609  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0772  glycosyl transferase family protein  49.7 
 
 		 709 aa  609  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00968  putative glycosyltransferase family 2 protein  51.41 
 
 		 731 aa  576  1.0000000000000001e-162  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1503  glycosyl transferase family 2  52.91 
 
 		 733 aa  569  1e-160  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2399  glycosyl transferase, group 1  50.63 
 
 		 996 aa  550  1e-155  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.969384  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0852  glycosyl transferase family protein  41.99 
 
 		 765 aa  549  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  43.03 
 
 		 1334 aa  540  9.999999999999999e-153  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  46.29 
 
 		 1152 aa  518  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  46.17 
 
 		 1152 aa  519  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0354  glycosyl transferase family protein  45.34 
 
 		 658 aa  498  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  43.95 
 
 		 746 aa  500  1e-139  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1840  glycosyl transferase family 2  44.97 
 
 		 710 aa  499  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0202284  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0767  glycosyl transferase family 2  42.12 
 
 		 602 aa  493  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1948  glycosyl transferase family 2  47.16 
 
 		 721 aa  491  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  46.22 
 
 		 1067 aa  491  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  44.03 
 
 		 717 aa  478  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  44.03 
 
 		 717 aa  480  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0315  glycosyl transferase family protein  48.05 
 
 		 775 aa  466  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1729  glycosyl transferase family protein  44.97 
 
 		 728 aa  457  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.95068 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  43.51 
 
 		 1991 aa  450  1.0000000000000001e-124  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4005  glycosyl transferase family 2  42.63 
 
 		 790 aa  446  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.318857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2042  glycosyl transferase family 2  41.84 
 
 		 832 aa  423  1e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.635088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  35.75 
 
 		 988 aa  407  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  41.17 
 
 		 1486 aa  407  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0725  glycosyl transferase family protein  39.79 
 
 		 734 aa  409  1.0000000000000001e-112  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.492928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2052  glycosyl transferase family 2  40.68 
 
 		 794 aa  403  9.999999999999999e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.039975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  35.29 
 
 		 1182 aa  391  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  36.65 
 
 		 983 aa  389  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1971  glycosyl transferase family 2  40.21 
 
 		 1084 aa  382  1e-104  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  35.33 
 
 		 996 aa  379  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  40.33 
 
 		 880 aa  373  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  42.33 
 
 		 610 aa  367  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  41.84 
 
 		 857 aa  363  1e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4777  glycosyl transferase family 2  37.89 
 
 		 742 aa  362  4e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4260  glycosyl transferase family protein  37.32 
 
 		 742 aa  356  2e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109167  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4626  glycosyl transferase family 2  37.25 
 
 		 742 aa  355  4e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1815  glycosyl transferase family 2  37.89 
 
 		 958 aa  346  2e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.613695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0236  hypothetical protein  36.54 
 
 		 783 aa  344  8e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000717832  normal  0.75423 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2009  glycosyl transferase  36.33 
 
 		 810 aa  343  2e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3207  glycosyl transferase family protein  42.79 
 
 		 576 aa  307  1.0000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  29.33 
 
 		 1644 aa  291  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  29.33 
 
 		 1644 aa  290  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1401  glycosyl transferase family protein  38.74 
 
 		 808 aa  286  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0729  glycosyl transferase family protein  35.84 
 
 		 586 aa  285  4.0000000000000003e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155064  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  38.76 
 
 		 1359 aa  281  8e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0929  glycosyl transferase family protein  37.25 
 
 		 796 aa  278  6e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.283533 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1792  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.56 
 
 		 809 aa  277  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0102114 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  33.2 
 
 		 617 aa  270  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0769  glycosyl transferase family 2  33.16 
 
 		 732 aa  270  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.034944 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1479  methyltransferase type 11  35.05 
 
 		 2046 aa  265  6e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.604446 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0804  glycosyl transferase family 2  33.39 
 
 		 725 aa  261  1e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16838 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3223  glycosyl transferase family protein  35.99 
 
 		 729 aa  260  2e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1842  glycosyl transferase family 2  32.58 
 
 		 531 aa  259  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2106  methyltransferase type 12  34.52 
 
 		 565 aa  259  4e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  38.42 
 
 		 1759 aa  255  5.000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0845  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 		 725 aa  254  7e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00935412  normal  0.295818 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0589  glycosyl transferase family protein  31.56 
 
 		 684 aa  254  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.271762  normal  0.0559054 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0564  glycosyl transferase family 2  32.38 
 
 		 670 aa  251  1e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.501276 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0563  glycosyl transferase family 2  33.26 
 
 		 555 aa  243  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.158623 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1841  glycosyl transferase family 2  34.69 
 
 		 652 aa  240  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4882  glycosyl transferase family protein  37.87 
 
 		 526 aa  239  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.763618  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2613  glycosyl transferase family protein  32.98 
 
 		 556 aa  239  4e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0588  glycosyl transferase family protein  35.42 
 
 		 551 aa  238  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231059  normal  0.109318 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1043  glycosyl transferase family 2  32.18 
 
 		 1009 aa  233  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0124689  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3489  glycosyl transferase family protein  34.56 
 
 		 635 aa  233  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0475235 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0599  glycosyl transferase family 2  34.69 
 
 		 551 aa  232  4e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.144427 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1495  glycosyltransferase protein  33.55 
 
 		 632 aa  231  7e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403758  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3488  glycosyl transferase family protein  34.93 
 
 		 539 aa  231  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4883  glycosyl transferase family protein  34.11 
 
 		 653 aa  230  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.830469  normal  0.0228705 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0600  glycosyl transferase family 2  31.26 
 
 		 684 aa  229  3e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.149205 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2719  glycosyl transferase family 2  29.78 
 
 		 662 aa  229  4e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2886  glycosyl transferase family 2  32.19 
 
 		 1213 aa  228  6e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.242978  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1062  glycosyl transferase family protein  34.68 
 
 		 783 aa  227  2e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3348  glycosyl transferase family protein  31.62 
 
 		 1074 aa  214  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0861977  normal  0.0615574 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3720  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 		 1193 aa  213  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1508  glycosyl transferase family protein  34.69 
 
 		 1198 aa  212  5e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0422  glycosyl transferase family protein  30.88 
 
 		 1297 aa  201  1.0000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0548  glycosyl transferase family protein  33.26 
 
 		 784 aa  199  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1555  glycosyl transferase family 2  31.03 
 
 		 1188 aa  198  6e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1529  glycosyl transferase family 2  30.13 
 
 		 748 aa  196  4e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3469  glycosyl transferase family protein  31.22 
 
 		 1190 aa  193  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.65715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50300  hypothetical protein  31.21 
 
 		 1694 aa  188  6e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0552832  decreased coverage  0.000853187 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1946  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.47 
 
 		 1191 aa  183  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1517  glycosyl transferase family protein  31.12 
 
 		 974 aa  183  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206981  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1918  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.76 
 
 		 1173 aa  181  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0055  glycosyl transferase family 2  29.32 
 
 		 1171 aa  181  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180545  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3468  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 968 aa  175  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1947  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.06 
 
 		 968 aa  172  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0120  Methyltransferase type 12  28.6 
 
 		 619 aa  172  4e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000561606  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2650  glycosyl transferase family protein  27.29 
 
 		 1177 aa  166  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4280  hypothetical protein  33.23 
 
 		 1171 aa  165  6e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>