55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0919 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0919  MOSC domain protein  100 
 
 
174 aa  352  1e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0791  MOSC  95.4 
 
 
177 aa  340  5e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4829  MOSC  78.26 
 
 
175 aa  261  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142865  normal  0.399285 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0767  MOSC domain-containing protein  74.25 
 
 
182 aa  251  3e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58850  hypothetical protein  57.05 
 
 
149 aa  171  3e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.111042 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5172  hypothetical protein  56.38 
 
 
146 aa  172  3e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.634719  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1459  MOSC domain-containing protein  50.3 
 
 
181 aa  156  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550389  normal  0.126815 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00774  mosc  49.02 
 
 
151 aa  148  3e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00950006  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0530  alpha amylase domain-containing protein  48.25 
 
 
144 aa  141  5e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2906  MOSC domain containing protein  44.65 
 
 
167 aa  138  3e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7200  MOSC domain-containing protein  48.12 
 
 
167 aa  135  3e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.313237 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0265  MOSC domain containing protein  42.24 
 
 
184 aa  134  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798311  normal  0.0276593 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2516  MOSC  42.47 
 
 
165 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.406281  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0007  MOSC domain-containing protein  39.66 
 
 
206 aa  128  4e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.278634  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0358  MOSC  45.45 
 
 
155 aa  122  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2198  hypothetical protein  40.37 
 
 
159 aa  120  9e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2927  hypothetical protein  42.68 
 
 
165 aa  116  2e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113815  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3499  hypothetical protein  41.42 
 
 
178 aa  109  2e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.70844  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4111  putative sulferase  29.03 
 
 
174 aa  73.2  2e-12  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.641133  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2412  MOSC domain-containing protein  39.81 
 
 
162 aa  69.3  2e-11  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.255229  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2603  MOSC domain-containing protein  35.71 
 
 
151 aa  68.9  3e-11  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10057  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3073  MOSC domain containing protein  32.24 
 
 
153 aa  68.2  6e-11  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4639  MOSC domain containing protein  30.49 
 
 
163 aa  66.2  2e-10  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1758  MOSC domain containing protein  32.86 
 
 
143 aa  64.3  8e-10  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.175574  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3206  MOSC domain containing protein  34.18 
 
 
200 aa  63.9  1e-09  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0881785  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1008  MOSC  32.91 
 
 
181 aa  62.8  3e-09  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5926  hypothetical protein  31.06 
 
 
189 aa  60.5  1e-08  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0229267  normal  0.231206 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1460  hypothetical protein  33.58 
 
 
160 aa  58.9  3e-08  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1526  MOSC domain containing protein  41.1 
 
 
178 aa  57  1e-07  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4831  hypothetical protein  29.03 
 
 
189 aa  56.6  2e-07  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  8.5919e-08  hitchhiker  0.00670464 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1966  hypothetical protein  33.79 
 
 
156 aa  54.7  6e-07  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0292017  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0011  hypothetical protein  28.08 
 
 
145 aa  54.7  7e-07  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1442  MOSC domain-containing protein  28.37 
 
 
158 aa  54.7  7e-07  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1811  MOSC  32.26 
 
 
158 aa  52.8  2e-06  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.98215  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2298  MOSC domain containing protein  32.12 
 
 
142 aa  52.8  2e-06  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0106  hypothetical protein  32.5 
 
 
190 aa  50.4  1e-05  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3575  hypothetical protein  29.45 
 
 
190 aa  50.8  1e-05  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1741  MOSC domain-containing protein  32.81 
 
 
153 aa  50.4  1e-05  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.296315  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0019  hypothetical protein  27.89 
 
 
146 aa  50.4  1e-05  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110253 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1294  hypothetical protein  29.41 
 
 
176 aa  49.3  3e-05  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247549  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0012  hypothetical protein  25 
 
 
145 aa  47.8  9e-05  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  2.03173e-05 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0012  hypothetical protein  25 
 
 
145 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0020  MOSC domain-containing protein  25 
 
 
145 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.606276  hitchhiker  1.72861e-08 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4234  MOSC domain-containing protein  30.82 
 
 
180 aa  46.6  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.37433  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0014  hypothetical protein  31.16 
 
 
146 aa  45.8  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0124057  normal  0.43799 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0018  hypothetical protein  27.82 
 
 
145 aa  45.4  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0017  hypothetical protein  26.9 
 
 
148 aa  44.7  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0061  MOSC domain-containing protein  29.6 
 
 
201 aa  44.3  0.0009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.489415 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0016  hypothetical protein  26.53 
 
 
148 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.010551 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4294  hypothetical protein  30 
 
 
197 aa  44.3  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.17157  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0016  hypothetical protein  25.85 
 
 
148 aa  43.9  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.49396e-06 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0012  hypothetical protein  26.35 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0205  MOSC domain containing protein  32.08 
 
 
147 aa  42.7  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0214556  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0010  hypothetical protein  29.06 
 
 
150 aa  40.8  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.276585  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0010  hypothetical protein  31.58 
 
 
147 aa  41.2  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>