More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0871 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0871  macrolide efflux protein, putative  100 
 
 
394 aa  771    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25090  Major facilitator superfamily transporter  64.29 
 
 
411 aa  460  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05460  macrolide-efflux transmembrane protein  64.71 
 
 
450 aa  426  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.810092  normal  0.114702 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2925  major facilitator transporter  58.16 
 
 
425 aa  423  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2001  major facilitator transporter  48.47 
 
 
425 aa  343  2e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1250  major facilitator transporter  36.11 
 
 
425 aa  200  3.9999999999999996e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4328  major facilitator transporter  36.11 
 
 
430 aa  191  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0872  H+ Antiporter protein  31.28 
 
 
405 aa  177  3e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1118  major facilitator superfamily MFS_1  27.44 
 
 
406 aa  157  4e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1517  major facilitator superfamily MFS_1  28.15 
 
 
412 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.5366 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1381  major facilitator superfamily MFS_1  27.6 
 
 
407 aa  152  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258845  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3442  major facilitator superfamily MFS_1  32.72 
 
 
440 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0102132  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2526  H+ Antiporter protein  28.76 
 
 
411 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000735797  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2514  major facilitator superfamily MFS_1  28.75 
 
 
439 aa  143  4e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  27.47 
 
 
1833 aa  144  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5239  macrolide-efflux protein  26.92 
 
 
397 aa  143  6e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0536  major facilitator superfamily MFS_1  30.62 
 
 
432 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.187699  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0024  macrolide-efflux protein  27.95 
 
 
397 aa  139  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0413389 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 
415 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 
463 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0564  major facilitator superfamily MFS_1  31.41 
 
 
439 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.60112  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  30.02 
 
 
474 aa  133  5e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  28.37 
 
 
445 aa  132  7.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  23.31 
 
 
439 aa  131  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1011  major facilitator superfamily MFS_1  29.43 
 
 
458 aa  123  5e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0969  major facilitator superfamily permease  26.12 
 
 
410 aa  123  6e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00309098  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  29.18 
 
 
1816 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0658  permease of the major facilitator superfamily  25.3 
 
 
485 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.590518  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6842  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  29.4 
 
 
1876 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731708  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  26.51 
 
 
433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  30.56 
 
 
1829 aa  113  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3103  major facilitator superfamily MFS_1  24.66 
 
 
434 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00979206  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3019  major facilitator superfamily MFS_1  24.66 
 
 
434 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  29.7 
 
 
1769 aa  109  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 
432 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2046  hypothetical protein  23.63 
 
 
448 aa  107  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.258697 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0208  major facilitator superfamily MFS_1  23.94 
 
 
433 aa  106  8e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2654  macrolide efflux protein, putative  26.01 
 
 
414 aa  105  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  24.21 
 
 
433 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0193  major facilitator superfamily MFS_1  26.2 
 
 
448 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4661  major facilitator transporter  24.34 
 
 
454 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.731341  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0001  major facilitator transporter  31.05 
 
 
434 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51078  hitchhiker  0.00413697 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  26.8 
 
 
441 aa  104  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0066  macrolide-efflux protein  27.32 
 
 
441 aa  103  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000436229  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4102  major facilitator transporter  27.3 
 
 
438 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.56542 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5583  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  30.35 
 
 
1806 aa  102  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.786514 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  23.94 
 
 
432 aa  102  9e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  25.52 
 
 
424 aa  102  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2407  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
437 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0245013  normal  0.811162 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  26.07 
 
 
446 aa  101  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1862  major facilitator transporter  27.09 
 
 
432 aa  101  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  26.81 
 
 
436 aa  100  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  25.36 
 
 
418 aa  99.8  8e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  24.86 
 
 
430 aa  98.6  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  26.6 
 
 
447 aa  98.6  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  27.14 
 
 
440 aa  98.6  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  24.93 
 
 
418 aa  97.4  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  29.05 
 
 
1839 aa  97.1  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  29.78 
 
 
442 aa  95.9  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  23.4 
 
 
409 aa  95.5  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  26.86 
 
 
499 aa  94.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4120  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  28.96 
 
 
2720 aa  94  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0715236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3346  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  27.06 
 
 
1864 aa  94  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0153259 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6160  major facilitator superfamily MFS_1  29.4 
 
 
438 aa  93.6  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48405  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 
456 aa  92.4  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  23.29 
 
 
444 aa  92.4  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  21.84 
 
 
413 aa  91.7  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1932  major facilitator superfamily MFS_1  26.9 
 
 
406 aa  91.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  21.84 
 
 
413 aa  91.7  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1086  major facilitator superfamily protein  32.8 
 
 
134 aa  91.3  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  24.5 
 
 
431 aa  91.3  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  25.34 
 
 
450 aa  90.5  5e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  24.93 
 
 
426 aa  90.1  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  25 
 
 
429 aa  89.7  8e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 
412 aa  89  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2187  major facilitator family transporter  30.77 
 
 
495 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189175  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  24.59 
 
 
422 aa  88.2  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  26.18 
 
 
413 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  24.73 
 
 
432 aa  88.2  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  24.14 
 
 
419 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0532  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 
428 aa  88.2  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  21.34 
 
 
418 aa  87.8  3e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1398  major facilitator transporter  23.22 
 
 
422 aa  87.4  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.902897  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2286  major facilitator transporter  24.59 
 
 
414 aa  87  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0407537  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  25.53 
 
 
440 aa  87  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1575  major facilitator transporter  22.66 
 
 
472 aa  86.7  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  27 
 
 
441 aa  86.7  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3594  putative permease  24.37 
 
 
422 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2435  putative ABC transporter, permease protein  29.38 
 
 
414 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.70932  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  24.47 
 
 
431 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  28.71 
 
 
414 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2576  putative ABC transporter, permease protein  25.07 
 
 
415 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00174173  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0885  major facilitator transporter  25.62 
 
 
415 aa  84.3  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  18.98 
 
 
412 aa  84  0.000000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3736  major facilitator superfamily MFS_1  28.05 
 
 
432 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.854411  normal  0.0699565 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3682  major facilitator superfamily MFS_1  28.05 
 
 
432 aa  84  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  26.5 
 
 
407 aa  84  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  19.68 
 
 
412 aa  83.2  0.000000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  26.01 
 
 
446 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1942  multidrug resistance protein; putative tetracycline resistance determinant  24.17 
 
 
406 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0213e-35 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>