48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0837 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0837  hypothetical protein  100 
 
 
200 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1176  protein of unknown function DUF1349  46.81 
 
 
197 aa  195  5.000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0661  protein of unknown function DUF1349  45.83 
 
 
193 aa  194  8.000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3279  protein of unknown function DUF1349  42.93 
 
 
222 aa  174  8e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2842  protein of unknown function DUF1349  41.46 
 
 
222 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.650239  normal  0.12049 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4025  hypothetical protein  41.35 
 
 
211 aa  171  5e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1147  protein of unknown function DUF1349  30.56 
 
 
199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2931  hypothetical protein  28.89 
 
 
209 aa  108  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00140052  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1749  protein of unknown function DUF1349  31.32 
 
 
180 aa  98.6  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.335138  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2454  hypothetical protein  27.07 
 
 
195 aa  92.4  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4481  hypothetical protein  28.11 
 
 
216 aa  92  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3819  hypothetical protein  29.83 
 
 
191 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391965 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4071  hypothetical protein  29.73 
 
 
191 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0615371  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2937  protein of unknown function DUF1349  28.5 
 
 
181 aa  89.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6671  protein of unknown function DUF1349  27.62 
 
 
194 aa  89  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00171031  normal  0.066277 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1579  protein of unknown function DUF1349  28.74 
 
 
179 aa  87.8  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0157914  normal  0.0167635 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5764  protein of unknown function DUF1349  25.97 
 
 
194 aa  86.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000000913507  normal  0.562373 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4540  hypothetical protein  26.55 
 
 
182 aa  86.3  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1564  protein of unknown function DUF1349  29.55 
 
 
176 aa  86.3  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0761212  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2399  hypothetical protein  28 
 
 
198 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2191  hypothetical protein  26.74 
 
 
198 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00552643  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2536  hypothetical protein  25.81 
 
 
198 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.278  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0097  protein of unknown function DUF1349  30.17 
 
 
216 aa  83.6  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000978689  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2934  hypothetical protein  29.17 
 
 
183 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.404051  hitchhiker  0.0000430397 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2248  hypothetical protein  26.82 
 
 
198 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000136964  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2473  hypothetical protein  25.86 
 
 
198 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0333618  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2274  hypothetical protein  25.81 
 
 
209 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2442  hypothetical protein  25.81 
 
 
198 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2458  hypothetical protein  25.81 
 
 
198 aa  82  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2234  hypothetical protein  25.81 
 
 
209 aa  82  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000537336  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4314  hypothetical protein  29.12 
 
 
191 aa  81.6  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0820719 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2143  protein of unknown function DUF1349  24.46 
 
 
197 aa  75.1  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3213  protein of unknown function DUF1349  24.35 
 
 
195 aa  68.6  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2174  hypothetical protein  26.78 
 
 
243 aa  68.6  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.419457  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4328  protein of unknown function DUF1349  24.57 
 
 
193 aa  67.8  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.683999  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1434  hypothetical protein  24.73 
 
 
191 aa  63.9  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1507  protein of unknown function DUF1349  25 
 
 
203 aa  61.2  0.000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.449634  normal  0.257305 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15801  predicted protein  22.41 
 
 
178 aa  59.7  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2053  protein of unknown function DUF1349  30.25 
 
 
207 aa  58.9  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.144756 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1441  hypothetical protein  27.78 
 
 
151 aa  57.8  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0614  protein of unknown function DUF1349  27.42 
 
 
208 aa  56.6  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.274963 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07990  hypothetical protein  23.2 
 
 
202 aa  54.7  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0670449  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18430  hypothetical protein  30.53 
 
 
200 aa  54.3  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.257569 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36940  predicted protein  26.97 
 
 
295 aa  54.7  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.945986  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3715  hypothetical protein  25.58 
 
 
235 aa  50.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0316  hypothetical protein  20.22 
 
 
233 aa  47.4  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07484  Uncharacterized protein AN7484 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AW46]  24.26 
 
 
200 aa  45.4  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2670  hypothetical protein  21.12 
 
 
174 aa  44.3  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.257486  normal  0.255504 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>