133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0714 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0714  autotransporter, putative  100 
 
 		 763 aa  1514    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0620  Outer membrane autotransporter barrel  86.82 
 
 		 759 aa  1310    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.553237 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0947  putative autotransporter protein  26.09 
 
 		 728 aa  125  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3276  hypothetical protein  25.66 
 
 		 728 aa  125  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.393702  hitchhiker  0.00000976174 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0998  outer membrane autotransporter  26.08 
 
 		 728 aa  125  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1775  outer membrane autotransporter  29.91 
 
 		 831 aa  100  9e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00532654 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4997  Outer membrane autotransporter barrel  27.66 
 
 		 998 aa  99.4  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1511  outer membrane autotransporter  31.91 
 
 		 1886 aa  97.1  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.188015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  27.33 
 
 		 983 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3385  outer membrane autotransporter  26.62 
 
 		 972 aa  93.6  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4267  outer membrane autotransporter  25.89 
 
 		 939 aa  90.9  8e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  28.94 
 
 		 1369 aa  90.5  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1194  autotransporter domain-containing protein  26.67 
 
 		 1068 aa  82.4  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.170523 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0488  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.05 
 
 		 774 aa  82.4  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1981  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.38 
 
 		 1242 aa  81.6  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1877  protein tyrosine/serine phosphatase  27.37 
 
 		 637 aa  81.6  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.880378 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3162  putative hemagglutinin-related protein  25.05 
 
 		 1012 aa  78.6  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.48 
 
 		 1489 aa  75.9  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  27.49 
 
 		 985 aa  75.5  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4652  Outer membrane autotransporter barrel  27.01 
 
 		 664 aa  73.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1857  outer membrane autotransporter  25.15 
 
 		 2848 aa  73.6  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2377  protein tyrosine/serine phosphatase  31.78 
 
 		 636 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188756 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0761  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.91 
 
 		 629 aa  70.1  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1095  outer membrane autotransporter  25.95 
 
 		 10429 aa  70.1  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  23.74 
 
 		 1001 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  28.06 
 
 		 994 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1155  autotransporter domain-containing protein  25.99 
 
 		 1677 aa  65.5  0.000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1283  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.96 
 
 		 3015 aa  63.5  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4377  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.11 
 
 		 641 aa  62.4  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3764  putative esterase/lipase/outer membrane autotransporter  25.52 
 
 		 723 aa  62  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.216349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.7 
 
 		 1673 aa  62  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  24.44 
 
 		 1066 aa  61.2  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707412  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  22.15 
 
 		 1001 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.16 
 
 		 919 aa  60.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0452  outer membrane autotransporter  27.38 
 
 		 629 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.459587 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  25 
 
 		 991 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2277  outer membrane autotransporter  28.19 
 
 		 980 aa  60.5  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  25.47 
 
 		 995 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24360  hypothetical protein  27.78 
 
 		 974 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.861832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  26.39 
 
 		 1769 aa  59.7  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1503  autotransporter beta-domain-containing protein  22.97 
 
 		 1069 aa  59.3  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  29.46 
 
 		 1508 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4784  outer membrane autotransporter  27.8 
 
 		 629 aa  59.3  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.336852 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1135  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.08 
 
 		 960 aa  58.5  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3587  outer membrane autotransporter  26.06 
 
 		 1011 aa  58.5  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334084  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  28.73 
 
 		 2396 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  25.68 
 
 		 1056 aa  58.2  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2063  autotransporter beta-domain-containing protein  29.86 
 
 		 954 aa  57.8  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217829  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5638  Outer membrane autotransporter barrel  23.95 
 
 		 488 aa  57  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190969  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1114  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.45 
 
 		 1358 aa  57  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3849  Outer membrane autotransporter barrel  24.02 
 
 		 684 aa  56.2  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0448048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2974  Outer membrane autotransporter barrel  25.74 
 
 		 814 aa  56.6  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67510  esterase EstA  28.49 
 
 		 646 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00791226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1537  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.57 
 
 		 3152 aa  55.5  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0363  putative outer membrane autotransporter  24.57 
 
 		 765 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.497355  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  22.22 
 
 		 1004 aa  55.8  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  24.23 
 
 		 995 aa  55.5  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1266  Outer membrane autotransporter  23.96 
 
 		 684 aa  55.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.384296 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  22.22 
 
 		 1033 aa  55.5  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5268  putative outer membrane autotransporter barrel  24.8 
 
 		 1078 aa  55.1  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.362559 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  27.7 
 
 		 2365 aa  54.7  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  24.77 
 
 		 1222 aa  54.7  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1833  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.54 
 
 		 1048 aa  54.3  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  27.7 
 
 		 2346 aa  54.3  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5845  esterase EstA  27.93 
 
 		 646 aa  54.3  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1880  outer membrane autotransporter  24.81 
 
 		 730 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.396897 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2586  Outer membrane autotransporter barrel  26.2 
 
 		 1154 aa  53.5  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501537  normal  0.680105 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2985  putative autotransporter protein  23.32 
 
 		 638 aa  53.9  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3064  outer membrane autotransporter  23.32 
 
 		 638 aa  53.9  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0402  outer membrane autotransporter  27.66 
 
 		 714 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.08 
 
 		 1285 aa  53.5  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2238  putative Outer membrane autotransporter protein  22.61 
 
 		 1025 aa  53.5  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.669565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0396  outer membrane autotransporter  27.78 
 
 		 922 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.381376  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3258  outer membrane autotransporter  27.78 
 
 		 1000 aa  53.1  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372144  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00321  conserved hypothetical protein  28.21 
 
 		 968 aa  52.4  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3845  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.53 
 
 		 826 aa  52.4  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0915  outer membrane autotransporter  23.33 
 
 		 658 aa  52.8  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0437  outer membrane autotransporter  27.78 
 
 		 465 aa  52.8  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1888  putative autotransporter protein  23.32 
 
 		 638 aa  52.4  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0815512  hitchhiker  0.00028295 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00325  hypothetical protein  28.21 
 
 		 968 aa  52.4  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3437  Outer membrane autotransporter  23.83 
 
 		 1179 aa  52  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0360967 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  24.31 
 
 		 1672 aa  51.6  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0291  outer membrane autotransporter domain protein  28.21 
 
 		 398 aa  50.8  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0847  outer membrane autotransporter barrel domain protein  21.62 
 
 		 1004 aa  51.2  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1723  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.98 
 
 		 1953 aa  51.2  0.00008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0576481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1722  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.62 
 
 		 1842 aa  50.4  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0890877 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1123  outer membrane autotransporter  26.74 
 
 		 1062 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948475  normal  0.876639 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0584  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.62 
 
 		 2302 aa  50.1  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.212067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1039  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.62 
 
 		 1865 aa  50.4  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.429609  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  22.09 
 
 		 1055 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  21.91 
 
 		 1038 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04290  hypothetical protein  27.72 
 
 		 647 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00560134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1996  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.6 
 
 		 1669 aa  49.7  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.357801  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0419  hypothetical protein  27.17 
 
 		 647 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2539  Outer membrane autotransporter barrel  24.19 
 
 		 1778 aa  48.9  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1288  putative autotransporter protein  28.64 
 
 		 759 aa  49.3  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0916938  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  25 
 
 		 1028 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  24.02 
 
 		 3506 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0501  outer membrane autotransporter  25.93 
 
 		 1371 aa  48.9  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.419631 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  26.26 
 
 		 3954 aa  48.9  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>